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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2024-2-27 17:22:12 | 只看该作者 Only view this author
好像是赝势和赝势基组的写法有问题?可以参考卢老师详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)一文中的写法。
还有想请教一下同学为啥输入文件中要加上5d 7f关键词呀

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发表于 Post on 2024-2-27 23:31:12 | 只看该作者 Only view this author
老师们好,最近开始接触ω调控长程矫正泛函的激发态研究方法,有几个小问题想和各位前辈讨论一下:
1. 在同一个工作中,我想要比较两个体系的激发态性质(激发能、ΔEST等),大概率适合两个分子的ω值有明显不同,那么比较仍然是有意义的嘛(都用LC-ωPBE的情况下);
2. 优化ω实际上是一个基态的计算,那么可以用优化出来的ω值、确定LC-ωPBE泛函的具体形式之后,用于优化激发态吗?在钟老师比较早的文献中好像激发态结构优化还是用现成的CAM-B3LYP做,然后只在计算能量时用了LC-ωPBE(10.1021/acs.jctc.5b00431,而且这里好像发现用TDDFT/CAM-B3LYP算出来也没比TDA-LC-ωPBE差多少);
3. 如果可以用于优化的话,那么我可以从之前用CAM-B3LYP优化后的激发态结构下、而非从基态结构开始 再重新优化吗?主要是害怕会优化到不同的极小值点上去造成错误。
谢谢各位老师

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发表于 Post on 2024-2-27 23:44:18 | 只看该作者 Only view this author

b3lyp/6-311g(d,p)加色散矫正就会报错语法或关键词错误

做水合钴离子的结构优化,b3lyp/6-311g(d,p)基组只要加上色散矫正em=gd3bj就会报错提示关键词或语法错误。

11.gjf

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11.out

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发表于 Post on 2024-2-28 00:58:19 | 只看该作者 Only view this author
很显然,你用的G09 B这个版本根本没有D3校正的功能,程序无法识别em=gd3bj的关键词所以报错。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-28 01:05:46 | 只看该作者 Only view this author
KSeGaSn 发表于 2024-2-27 23:31
老师们好,最近开始接触ω调控长程矫正泛函的激发态研究方法,有几个小问题想和各位前辈讨论一下:
1. 在 ...

1 对两个体系分别调控w是有意义的,能够对比,这相当于二者都用了共同的“w调控”方法
2 可以。CAM-B3LYP对于激发态优化总体来说是比较稳的,LE和CT都适用。用w调控的泛函优化激发态结构即便某些情况更好,但一般也不会有太明显的改进、极小点位置差不了多少
3 可以
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-28 05:41:10 | 只看该作者 Only view this author
anning 发表于 2024-2-27 23:44
做水合钴离子的结构优化,b3lyp/6-311g(d,p)基组只要加上色散矫正em=gd3bj就会报错提示关键词或语法错误。

别乱找地方发帖,Gaussian的问题发到第一性原理版块做什么。这次给你移动了,下次删帖处理

下文明确说了,G09 D.01开始才支持D3校正
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-28 06:33:12 | 只看该作者 Only view this author
五月疯 发表于 2024-2-27 16:23
对La使用ECP基组,使用的是Linux系统下的Gaussian 16进行计算,出现 Wanted an integer as input. Found a  ...

很长的信息别直接贴,要当做附件上传。输入文件也直接上传,别直接贴
仔细看此文搞清楚格式
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373http://bbs.keinsci.com/thread-5625-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-28 06:33:41 | 只看该作者 Only view this author
CLJJ 发表于 2024-2-27 17:22
好像是赝势和赝势基组的写法有问题?可以参考卢老师详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入 - ...

7f本来就是默认的,没有任何写的意义
5d对于使用gen的情况也是默认的,所以写是多余的
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发表于 Post on 2024-2-28 09:17:40 | 只看该作者 Only view this author

跑IRC时的报错

第一次跑IRC时读取了opt=ts正常结束后产生的chk文件,第二次删除了guess=read关键词,两次都产生如下的错误
Charge and Multiplicity card seems defective:
Wanted an integer as input.

?
找到的过渡态有一个-535.58的虚频,也不确定这个结构对不对,所以想跑个IRC看看。
我在找另一步的ts时跑IRC都没问题,关键词设置的是一样的都没有报错,很疑惑,请大佬们看看哪里出错了。
gjf文件后的空格也多给了几个。

irc.zip

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发表于 Post on 2024-2-28 09:18:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-28 06:33
很长的信息别直接贴,要当做附件上传。输入文件也直接上传,别直接贴
仔细看此文搞清楚格式
谈谈赝势基 ...

好的老师,下次注意,谢谢老师。

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发表于 Post on 2024-2-28 09:37:48 | 只看该作者 Only view this author
opt关键词删掉啊,不是跑IRC吗

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发表于 Post on 2024-2-28 11:03:45 | 只看该作者 Only view this author

b3lyp/6-311g(d,p)基组加色散校正就报错关键词和语法错误

b3lyp/6-311g(d,p)基组只要加加色散校正em=gd3bj就报错关键词和语法错误。

11.gjf

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11.out

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发表于 Post on 2024-2-28 11:22:12 | 只看该作者 Only view this author
版本太老,换G16。在G09 D.01版之前不支持DFT-D3,G09 D.01支持但是DFT-D3的Hessian计算结果不对。

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发表于 Post on 2024-2-28 14:37:18 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2024-2-28 11:22
版本太老,换G16。在G09 D.01版之前不支持DFT-D3,G09 D.01支持但是DFT-D3的Hessian计算结果不对。

原来如此,感谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-28 19:39:59 | 只看该作者 Only view this author
anning 发表于 2024-2-28 11:03
b3lyp/6-311g(d,p)基组只要加加色散校正em=gd3bj就报错关键词和语法错误。

DFT-D色散校正的使用
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