计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

  [复制链接 Copy URL]

1万

帖子

0

威望

9004

eV
积分
20760

Level 6 (一方通行)

3661#
发表于 Post on 2024-7-31 17:23:21 | 只看该作者 Only view this author
土拔鼠 发表于 2024-7-31 10:08
感谢老师回复 我理解的相对稳定就是同一时间出现以15个水分子组成的团簇的出现概率是最大的 不知道这么理 ...

问题在于,在水溶液里你怎么定义哪些水分子是一个团簇?所有水分子基本上是形成一个连续的氢键网络,如果只要彼此形成氢键网络就是一个团簇的话,那么最稳定的团簇是无穷大的
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

36

帖子

0

威望

249

eV
积分
285

Level 3 能力者

3662#
发表于 Post on 2024-7-31 17:29:26 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-7-26 17:02
guess=mix只能保证收敛到正确波函数的概率不是0,对于足够简单的体系(例如开壳层单重态)可以收敛到正确 ...

明白了,多谢老师的详细解答

36

帖子

0

威望

249

eV
积分
285

Level 3 能力者

3663#
发表于 Post on 2024-7-31 17:32:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-29 02:41
CP2K也可能收敛到不稳定波函数,用OT的时候这种概率比用对角化更高。不过CP2K没有波函数稳定性测试功能。 ...

明白了,多谢您的详细解答

190

帖子

0

威望

1691

eV
积分
1881

Level 5 (御坂)

3664#
发表于 Post on 2024-7-31 21:03:26 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-7-31 17:23
问题在于,在水溶液里你怎么定义哪些水分子是一个团簇?所有水分子基本上是形成一个连续的氢键网络,如果 ...

老师说的有道理 实话说我现在都不理解为什么水溶液中会有水分子团簇这个概念 我们实验组用核磁测了很多不同来源的水 发现不同来源的水半峰宽不一样 组长认为是水分子团簇的尺寸的区别造成的 让我们对这个说法进行理论支持

1万

帖子

0

威望

9004

eV
积分
20760

Level 6 (一方通行)

3665#
发表于 Post on 2024-7-31 21:22:48 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wzkchem5 于 2024-7-31 14:24 编辑
土拔鼠 发表于 2024-7-31 14:03
老师说的有道理 实话说我现在都不理解为什么水溶液中会有水分子团簇这个概念 我们实验组用核磁测了很多不 ...

确定不是核磁匀场的问题?
水里稍微有点杂质颗粒,很容易影响匀场,导致半峰宽变化。乃至水里有没有气泡,核磁管里装了多少水,水面是凸的还是凹的,管壁有没有挂水珠,这些因素都很容易影响峰形。应当先查一下正经研究核磁半峰宽的文献,看看他们为了让半峰宽结果可重复、完全排除仪器影响,都用了哪些手段。等确保这些手段你们都用上了,再来谈如何解释实验结果的问题
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

22

帖子

0

威望

247

eV
积分
269

Level 3 能力者

3666#
发表于 Post on 2024-8-1 23:47:31 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,sob老师的博文里提到“LBO的大小与C-C键的BDE有极好的线性相关性”。
请问可以通过对比LBO的小大来比较不同分子中C-C键的强度吗?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120180

管理员

公社社长

3667#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-2 03:52:48 | 只看该作者 Only view this author
Miao 发表于 2024-8-1 23:47
各位老师好,sob老师的博文里提到“LBO的大小与C-C键的BDE有极好的线性相关性”。
请问可以通过对比LBO的 ...

可以
以后波函数分析相关问题发到1L提到的专门的帖子里
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

22

帖子

0

威望

247

eV
积分
269

Level 3 能力者

3668#
发表于 Post on 2024-8-2 10:27:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-8-2 03:52
可以
以后波函数分析相关问题发到1L提到的专门的帖子里

好的,谢谢sob老师!

245

帖子

0

威望

780

eV
积分
1025

Level 4 (黑子)

3669#
发表于 Post on 2024-8-2 23:57:53 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,sob老师曾经在http://sobereva.com/462中写过,“ORCA考虑SOC对(磷光)光谱的影响靠的是让不考虑SOC时得到的单重态和三重态混合来实现的”,请问这种单重态和三重态的“混合程度”可以怎么衡量呢?是SOCME越大,就能说明这种混合就更强烈,还是说应该更进一步考虑能量差异、势能面形状的信息?另外是否也需要考虑三重态激发态之间的“混合”才能更进一步说明T1态的发射呢?

1万

帖子

0

威望

9004

eV
积分
20760

Level 6 (一方通行)

3670#
发表于 Post on 2024-8-3 00:00:10 | 只看该作者 Only view this author
KSeGaSn 发表于 2024-8-2 16:57
各位老师好,sob老师曾经在http://sobereva.com/462中写过,“ORCA考虑SOC对(磷光)光谱的影响靠的是让不考 ...

ORCA会打印QDPT state在scalar state上的展开系数,由此可以看出混合情况
三重态之间确实也会混合。ORCA计算已经考虑了这一点
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

432

帖子

0

威望

1273

eV
积分
1705

Level 5 (御坂)

迷茫的本科生一枚

3671#
发表于 Post on 2024-8-3 14:34:54 | 只看该作者 Only view this author
请问老师ESIPT过程适合用concvar程序来研究吗
放下

154

帖子

0

威望

858

eV
积分
1012

Level 4 (黑子)

3672#
发表于 Post on 2024-8-3 15:48:27 | 只看该作者 Only view this author

单独一个氧气分子进行优化的时候有报错

单独一个氧气分子进行优化的时候有报错
泛函基组溶剂模型都是不可以改变的,因为另外用这个方法算的大体系里需要计算出减去一个氧气的能量


输入文件信息:
%nprocshared=64
%mem=96GB
%chk=O.chk
# opt 6-31+g(d,p) scrf=(smd,solvent=water) m062x


O


0 1
O                 -2.91221382    1.48091601    0.00000000
O                 -4.07381382    1.48091601    0.00000000




输出文件信息:
Entering Gaussian System, Link 0=g16
Initial command:
/public/home/acgcwoz92l/software/g16/l1.exe "/public/home/acgcwoz92l/software/g16/scratch/Gau-123869.inp" -scrdir="/public/home/acgcwoz92l/software/g16/scratch/"
Entering Link 1 = /public/home/acgcwoz92l/software/g16/l1.exe PID=    123870.
  
Copyright (c) 1988,1990,1992,1993,1995,1998,2003,2009,2016,
            Gaussian, Inc.  All Rights Reserved.
  
This is part of the Gaussian(R) 16 program.  It is based on
the Gaussian(R) 09 system (copyright 2009, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 03 system (copyright 2003, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 98 system (copyright 1998, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 94 system (copyright 1995, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 92(TM) system (copyright 1992, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 90(TM) system (copyright 1990, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 88(TM) system (copyright 1988, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 86(TM) system (copyright 1986, Carnegie Mellon
University), and the Gaussian 82(TM) system (copyright 1983,
Carnegie Mellon University). Gaussian is a federally registered
trademark of Gaussian, Inc.
  
This software contains proprietary and confidential information,
including trade secrets, belonging to Gaussian, Inc.
  
This software is provided under written license and may be
used, copied, transmitted, or stored only in accord with that
written license.
  
The following legend is applicable only to US Government
contracts under FAR:
  
                    RESTRICTED RIGHTS LEGEND
  
Use, reproduction and disclosure by the US Government is
subject to restrictions as set forth in subparagraphs (a)
and (c) of the Commercial Computer Software - Restricted
Rights clause in FAR 52.227-19.
  
Gaussian, Inc.
340 Quinnipiac St., Bldg. 40, Wallingford CT 06492
  
  
---------------------------------------------------------------
Warning -- This program may not be used in any manner that
competes with the business of Gaussian, Inc. or will provide
assistance to any competitor of Gaussian, Inc.  The licensee
of this program is prohibited from giving any competitor of
Gaussian, Inc. access to this program.  By using this program,
the user acknowledges that Gaussian, Inc. is engaged in the
business of creating and licensing software in the field of
computational chemistry and represents and warrants to the
licensee that it is not a competitor of Gaussian, Inc. and that
it will not use this program in any manner prohibited above.
---------------------------------------------------------------
  


Cite this work as:
Gaussian 16, Revision A.03,
M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria,
M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone,
G. A. Petersson, H. Nakatsuji, X. Li, M. Caricato, A. V. Marenich,
J. Bloino, B. G. Janesko, R. Gomperts, B. Mennucci, H. P. Hratchian,
J. V. Ortiz, A. F. Izmaylov, J. L. Sonnenberg, D. Williams-Young,
F. Ding, F. Lipparini, F. Egidi, J. Goings, B. Peng, A. Petrone,
T. Henderson, D. Ranasinghe, V. G. Zakrzewski, J. Gao, N. Rega,
G. Zheng, W. Liang, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda,
J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai,
T. Vreven, K. Throssell, J. A. Montgomery, Jr., J. E. Peralta,
F. Ogliaro, M. J. Bearpark, J. J. Heyd, E. N. Brothers, K. N. Kudin,
V. N. Staroverov, T. A. Keith, R. Kobayashi, J. Normand,
K. Raghavachari, A. P. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar,
J. Tomasi, M. Cossi, J. M. Millam, M. Klene, C. Adamo, R. Cammi,
J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, O. Farkas,
J. B. Foresman, and D. J. Fox, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2016.

******************************************
Gaussian 16:  ES64L-G16RevA.03 25-Dec-2016
                31-Jul-2024
******************************************
%nprocshared=64
Will use up to   64 processors via shared memory.
%mem=96GB
%chk=O.chk
------------------------------------------------
# opt 6-31+g(d,p) scrf=(smd,solvent=water) m062x
------------------------------------------------
1/18=20,19=15,26=3,38=1/1,3;
2/9=110,12=2,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=1,6=6,7=111,11=2,25=1,30=1,70=32201,71=1,72=1,74=-55/1,2,3;
4//1;
5/5=2,38=5,53=1/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
7//1,2,3,16;
1/18=20,19=15,26=3/3(2);
2/9=110/2;
99//99;
2/9=110/2;
3/5=1,6=6,7=111,11=2,25=1,30=1,70=32205,71=1,72=1,74=-55/1,2,3;
4/5=5,16=3,69=1/1;
5/5=2,38=5,53=1/2;
7//1,2,3,16;
1/18=20,19=15,26=3/3(-5);
2/9=110/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,28=1/1;
99/9=1/99;
-
O
-
Symbolic Z-matrix:
Charge =  0 Multiplicity = 1
O                    -2.91221   1.48092   0.
O                    -4.07381   1.48092   0.
End of file in ZSymb.
Error termination via Lnk1e in /public/home/acgcwoz92l/software/g16/l101.exe at Wed Jul 31 16:23:00 2024.
Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes 15.4 seconds.
Elapsed time:       0 days  0 hours  0 minutes  0.5 seconds.

File lengths (MBytes):  RWF=      6 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1

1016

帖子

0

威望

2096

eV
积分
3112

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

3673#
发表于 Post on 2024-8-3 16:02:32 | 只看该作者 Only view this author
氧气分子的基态是三重态。如果你算单重态(激发态)的氧气分子,要复杂一点。
http://bbs.keinsci.com/thread-27461-1-1.html
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

1万

帖子

0

威望

9004

eV
积分
20760

Level 6 (一方通行)

3674#
发表于 Post on 2024-8-3 16:57:33 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2024-8-3 07:34
请问老师ESIPT过程适合用concvar程序来研究吗

只要相关的速率常数都算出来了,就行
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

432

帖子

0

威望

1273

eV
积分
1705

Level 5 (御坂)

迷茫的本科生一枚

3675#
发表于 Post on 2024-8-3 17:10:31 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-8-3 16:57
只要相关的速率常数都算出来了,就行

但是ESIPT的时间尺度较小,然而http://sobereva.com/642中给的例子经历了几十秒的模拟。
放下

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-17 10:16 , Processed in 0.311830 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list