计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

  [复制链接 Copy URL]

1万

帖子

0

威望

9004

eV
积分
20760

Level 6 (一方通行)

3676#
发表于 Post on 2024-8-3 17:13:46 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2024-8-3 10:10
但是ESIPT的时间尺度较小,然而http://sobereva.com/642中给的例子经历了几十秒的模拟。

重要的不是绝对的时间尺度,而是你的体系涉及的所有过程的相对时间尺度。如果最慢的反应比最快的反应慢特别多倍,比如一百万倍以上,那可能比较难算准。但是如果所有反应都极其快,或者所有反应都极其慢,那么计算没有任何问题。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

154

帖子

0

威望

858

eV
积分
1012

Level 4 (黑子)

3677#
发表于 Post on 2024-8-3 21:03:45 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2024-8-3 16:02
氧气分子的基态是三重态。如果你算单重态(激发态)的氧气分子,要复杂一点。
http://bbs.keinsci.com/thr ...

谢谢 我把自旋多重度改为3了 但是还有同样的报错

1016

帖子

0

威望

2096

eV
积分
3112

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

3678#
发表于 Post on 2024-8-3 21:29:58 | 只看该作者 Only view this author
〇66 发表于 2024-8-3 21:03
谢谢 我把自旋多重度改为3了 但是还有同样的报错

可能是%nprocshared和%mem的问题,去掉这两行看看。
http://sobereva.com/439
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

201

帖子

0

威望

535

eV
积分
736

Level 4 (黑子)

3679#
发表于 Post on 2024-8-3 21:54:37 | 只看该作者 Only view this author
分子坐标的结束部分需要有一个空行。以后遇到"End of file in ZSymb."就先看看是不是这个问题。

432

帖子

0

威望

1273

eV
积分
1705

Level 5 (御坂)

迷茫的本科生一枚

3680#
发表于 Post on 2024-8-3 22:28:41 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-8-3 17:13
重要的不是绝对的时间尺度,而是你的体系涉及的所有过程的相对时间尺度。如果最慢的反应比最快的反应慢特 ...

明白了 感谢解惑
放下

449

帖子

0

威望

1561

eV
积分
2010

Level 5 (御坂)

3681#
发表于 Post on 2024-8-3 22:47:36 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,在计算激基复合物的发光时,在选择所使用的泛函时,有什么推荐或者建议嘛?比如HF成分,是否范围分离泛函更加合适?或者双杂化泛函才能更好胜任呢?
我自己在使用普通杂化泛函进行TDDFT计算时,针对S1进行优化后,经常遇到:前两/三个态的振子强度都小于0.01,且即使采用def2TZVP+smd模型,振子强度较大的态,相比测试结果也大大蓝移(主要是因为前几个比较红的态振子强度都为0)

1万

帖子

0

威望

9004

eV
积分
20760

Level 6 (一方通行)

3682#
发表于 Post on 2024-8-4 00:04:52 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-8-3 15:47
各位老师好,在计算激基复合物的发光时,在选择所使用的泛函时,有什么推荐或者建议嘛?比如HF成分,是否范 ...

会不会是激基复合物没有搜到最合理的构象
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

449

帖子

0

威望

1561

eV
积分
2010

Level 5 (御坂)

3683#
发表于 Post on 2024-8-4 00:23:00 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-8-4 00:04
会不会是激基复合物没有搜到最合理的构象

不仅溶液中的结果是这样的,我在固体/晶体中观察到的激基复合物的发光,依然出现上述情况(按说晶体应该不太会出现构想不合理的情况)。
我的模拟方法是:用QM/MM对二聚体做TD+OPT,用模拟后的二聚体(激基复合物)来计算发光,方法采用PBE0和BhandHLYP配合Def2TZVP。(之所以判断晶体发光有激基复合物特征也是因为观测到了相比单体,红移+structureless+更宽的发光光谱)
所以我想知道,是不是算二聚体发光的时候,使用普通泛函是否会有局限?因为我很少看到有对激基复合物发光进行模拟的文章,所以不太确定。

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120180

管理员

公社社长

3684#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-4 07:45:33 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2024-8-3 14:34
请问老师ESIPT过程适合用concvar程序来研究吗

不适合
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120180

管理员

公社社长

3685#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-4 07:47:23 | 只看该作者 Only view this author
KSeGaSn 发表于 2024-8-2 23:57
各位老师好,sob老师曾经在http://sobereva.com/462中写过,“ORCA考虑SOC对(磷光)光谱的影响靠的是让不考 ...

根据展开系数计算考虑SOC后的态中的单、三重态成份所占比例就能体现。不考虑SOC时的态要么100%单重态要么0%单重态,单-三重态混合程度越高,单重态成份偏离0或100%越明显
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120180

管理员

公社社长

3686#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-4 08:33:05 | 只看该作者 Only view this author
〇66 发表于 2024-8-3 15:48
单独一个氧气分子进行优化的时候有报错
泛函基组溶剂模型都是不可以改变的,因为另外用这个方法算的大体系 ...

若以命令行方式提交任务,末尾至少空两行
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

245

帖子

0

威望

780

eV
积分
1025

Level 4 (黑子)

3687#
发表于 Post on 2024-8-4 10:30:23 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-8-3 00:00
ORCA会打印QDPT state在scalar state上的展开系数,由此可以看出混合情况
三重态之间确实也会混合。ORCA ...

谢谢老师,请问是Eigenvectors of the SOC matrix的表格里面,各个SOC State有不同的Root  Spin  Ms态组成吗?另外我注意到ORCA打印了一个CALCULATED REDUCED SOCME BETWEEN TRIPLETS的表格,请问这个表格是什么含义呢,三重态之间也会有SOCME吗?   

245

帖子

0

威望

780

eV
积分
1025

Level 4 (黑子)

3688#
发表于 Post on 2024-8-4 10:53:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-8-4 07:47
根据展开系数计算考虑SOC后的态中的单、三重态成份所占比例就能体现。不考虑SOC时的态要么100%单重态要么 ...

谢谢老师,这个部分应该能够反应SOC态中的纯态组成吧?后面的Root的编号规则是什么呢?比如这里SOC态的state 1,可以看作是(0.53442+0.23143+0.23143)的T1态和(0.00079+0.00068+0.00068)的T5态构成的吗?

屏幕截图 2024-08-04 103556.png (45.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 58)

屏幕截图 2024-08-04 103556.png

1万

帖子

0

威望

9004

eV
积分
20760

Level 6 (一方通行)

3689#
发表于 Post on 2024-8-4 16:13:15 | 只看该作者 Only view this author
KSeGaSn 发表于 2024-8-4 03:30
谢谢老师,请问是Eigenvectors of the SOC matrix的表格里面,各个SOC State有不同的Root  Spin  Ms态组 ...


三重态之间确实有SOCME,只不过因为其量级一般小于三重态之间的NACME,所以在计算速率的时候往往忽略而已
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

1万

帖子

0

威望

9004

eV
积分
20760

Level 6 (一方通行)

3690#
发表于 Post on 2024-8-4 16:14:09 | 只看该作者 Only view this author
KSeGaSn 发表于 2024-8-4 03:53
谢谢老师,这个部分应该能够反应SOC态中的纯态组成吧?后面的Root的编号规则是什么呢?比如这里SOC态的st ...

可以。spin是自旋量子数,Ms是磁量子数
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-17 10:09 , Processed in 0.181808 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list