简单量子化学问题答疑专帖

chands · 发表于 Post on 2023-3-10 15:36:35

糖糖糖豆9988 发表于 2023-3-10 14:36
老师，抱歉哈，麻烦您看下IRC，反应物和图片结构可能会有些差异，反应物是一个自旋多重度为2的开壳层自由 ...

产物的烃基部分是卡宾，这个卡宾如果和OH作为产物的整体（IRC末端）的自旋多重度没有变，还是2，但是如果把OH挪去剩下的卡宾的自旋多重度是多少，就不好说了，可能是1也可能是3，简单的卡宾是三重态能量低一点，但是这个结构我不知道

糖糖糖豆9988 · 发表于 Post on 2023-3-10 16:08:12

chands 发表于 2023-3-10 15:36
产物的烃基部分是卡宾，这个卡宾如果和OH作为产物的整体（IRC末端）的自旋多重度没有变，还是2，但是如果 ...

老师，这个反应确实有点意外，但是既然TS连接着我的反应物所以我还是考虑这个反应，也说不准优化之后发现他不稳定

；再请教一下您：①这个IRC产物一侧不包括OH的结构就是卡宾，我分别采用3 和 1 去计算，那个能量低用哪个可以吗？②如果采用1 的自旋多重度，需要按照自旋极化单重态的处理方式计算吗？就是先构造对称破缺的稳定波函数，再读取计算呢？谢谢老师

糖糖糖豆9988 · 发表于 Post on 2023-3-10 16:24:58

本帖最后由糖糖糖豆9988 于 2023-3-10 16:44 编辑

请教一下各位老师，图示结构在寻找OO基提取C4\C5上的H原子TS时，通过扫描的方式找TS初始结构，但是扫描曲线的极大点进一步优化后的结构并不能连接正确的反应物和产物；但是对于OO过氧基位于1号C上的结构是可以找到OO抽取C3上的H，即OO位于C1时的R1OO自由基可以发生1，5氢迁移反应。请问：①对于图示的过氧基位于C2的R2OO，这两种1，5氢迁移反应路径是不存在还是自己没找对呢？②R1OO发生1，5氢迁移时，C1可以向下弯曲以便于H迁移，但是R2OO会受到三元环的限制，因此发生H迁移会导致结构破裂，所以不容易发生我设想的氢迁移反应？感谢老师们解答

chands · 发表于 Post on 2023-3-10 16:44:55

糖糖糖豆9988 发表于 2023-3-10 16:08
老师，这个反应确实有点意外，但是既然TS连接着我的反应物所以我还是考虑这个反应，也说不准优化之后发现 ...

（1）是，除非某些反应需要激发态卡宾。（2）不用自旋极化单重态，因为是孤对电子。

NGC626 · 发表于 Post on 2023-3-10 18:11:43

不好意思老师，这是我的输入和输出文件，请问需要如何修改输入参数呢？@wzkchem5

慢半拍的小陈 · 发表于 Post on 2023-3-10 21:15:54

请问一下老师，氧气与某分子发生氢提取反应生成两个自由基。此时的氧气作为反应物是三重态还是单重态呢？过渡态是单重态还是多重态?

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-3-11 00:18:27

慢半拍的小陈发表于 2023-3-10 14:15
请问一下老师，氧气与某分子发生氢提取反应生成两个自由基。此时的氧气作为反应物是三重态还是单重态呢？过 ...

都有可能。应该从实验上确认是单线态氧参与反应还是三线态氧参与反应

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-3-11 00:21:07

NGC626 发表于 2023-3-10 11:11
不好意思老师，这是我的输入和输出文件，请问需要如何修改输入参数呢？@wzkchem5

Negative eigenvalue found in transformed Hamiltonian
说明基态波函数不稳定
按https://bdf-manual.readthedocs.i ... r%20Guide.html#id72的方法解决

NGC626 · 发表于 Post on 2023-3-11 08:25:14

wzkchem5 发表于 2023-3-11 00:21
Negative eigenvalue found in transformed Hamiltonian
说明基态波函数不稳定
按https://bdf-manual.r ...

清楚了，谢谢老师

tingfengting · 发表于 Post on 2023-3-11 10:08:48

老师们好，我要计算的分子里面含S、Se、Te，但是6-31G*基组最大只能算到Se，是不是就不能用标度法算NMR了呢？

雾雨魔理沙daze · 发表于 Post on 2023-3-11 12:43:25

本帖最后由雾雨魔理沙daze 于 2023-3-11 12:44 编辑

各位老师，我在用Gaussian计算过渡态的时候，提交的几个任务全都在跑了一段时间之后结束，out文件均以这样的形式结尾，但好像没有报错。请问这是什么原因，该怎么解决？谢谢各位老师

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-3-11 16:47:45

tingfengting 发表于 2023-3-11 03:08
老师们好，我要计算的分子里面含S、Se、Te，但是6-31G*基组最大只能算到Se，是不是就不能用标度法算NMR了呢 ...

对，即便6-31G*能支持到Te，也不好说结果是否靠谱，毕竟Te的相对论效应大。
建议用双杂化泛函等即使不做标度法也足够准的方法来算

tingfengting · 发表于 Post on 2023-3-11 17:29:38

wzkchem5 发表于 2023-3-11 16:47
对，即便6-31G*能支持到Te，也不好说结果是否靠谱，毕竟Te的相对论效应大。
建议用双杂化泛函等即使不做 ...

好的老师，谢谢您

NGC626 · 发表于 Post on 2023-3-11 18:59:50

各位老师好，我使用wB97X-D3/ma-def2-TZVP在激发态下对一个体系做optfreq时出现了报错，这是我的计算参数和输入输出文件，请问应如何修改参数呢？
! wB97X-D3 ma-def2-TZVP tightSCF opt freq noautostart miniprint nopop
%maxcore 1000
%pal nprocs 12 end
%tddft
nroots 30
dosoc true
TDA false
end

Excaliburyo · 发表于 Post on 2023-3-11 19:42:07

想请教一下各位老师，这个在文献上找到的化合物，有多个最大吸收波长，但是通过Gaussian的TD-DFT计算，改变相应溶剂后没有办法获得这些数据，最多只能接近这个453nm。请问类似这样的情况如何解释，如何解决呢？

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