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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2022-5-18 22:56:43 | 只看该作者 Only view this author

gaussveiw6为什么安装完成之后打不开呢,打开他提示的是这个界面,这种情况要怎么弄呢


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-18 23:31:53 | 只看该作者 Only view this author

Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html

看此文搞清楚安装流程
甭把Gaussian装到带中文的路径下
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-5-18 23:54:16 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢

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发表于 Post on 2022-5-19 16:13:39 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 陈小北 于 2022-5-19 16:15 编辑

Sob老师好

我在计算一个金属配合物体系,gif文件里设置的自旋多重度是5,拿到fchk文件用高斯打开后,发现Gview里显示可以改变体系的电荷和自旋多重度,我想要HOMO和LUMO之间的gap,这样的改变无疑会使得gap变动,请问这个改变之后的数值可靠吗,可以用吗?




谢谢Sob老师

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15335#
发表于 Post on 2022-5-19 16:44:59 | 只看该作者 Only view this author
陈小北 发表于 2022-5-19 09:13
Sob老师好

我在计算一个金属配合物体系,gif文件里设置的自旋多重度是5,拿到fchk文件用高斯打开后,发 ...

必须根据化学常识确定体系的自旋多重度,而不是让GaussView帮你改。这个体系的自旋多重度要么本来就应该是5,要么不应该是5,如果是前者的情况,这里不能改;如果是后者的情况,应该改成正确的自旋多重度然后重新跑计算,不能只改自旋多重度就直接读gap,因为自旋多重度不仅影响哪些轨道占据电子,还会影响轨道能。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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发表于 Post on 2022-5-19 23:48:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-18 21:40
语义不明
MC态的激发态序号是大是小和轨道贡献没什么关系,我也不知道你说的轨道是什么轨道

老师我意思通过http://sobereva.com/284的方法,用tddft计算占据轨道虚轨道之间的跃迁贡献来找哪个激发态是mc,这个激发态在分子的所有激发态中靠后,占据轨道向虚轨道之间的跃迁的贡献很低,难以判断激发类型该如何去寻找mc?

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15337#
发表于 Post on 2022-5-20 16:42:10 | 只看该作者 Only view this author
各位老师,在cp2k中用pbe0计算TDDFT时,读取之前pbe计算产生的的.wfn or .tdwfn还是两个都读取

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-21 04:12:03 | 只看该作者 Only view this author
din5g 发表于 2022-5-20 16:42
各位老师,在cp2k中用pbe0计算TDDFT时,读取之前pbe计算产生的的.wfn or .tdwfn还是两个都读取

本帖是讨论量化相关问题的,CP2K的问题发到第一性原理版并选择CP2K分类
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-21 04:13:30 | 只看该作者 Only view this author
好兄弟 发表于 2022-5-19 23:48
老师我意思通过http://sobereva.com/284的方法,用tddft计算占据轨道虚轨道之间的跃迁贡献来找哪个激发态 ...

靠后就靠后呗

“占据轨道向虚轨道之间的跃迁的贡献很低”这话莫名其妙
哪个激发态不是占据轨道向虚轨道跃迁的,哪个激发态组态系数是不满足归一化的
你对TDDFT的原理理解有严重问题
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发表于 Post on 2022-5-21 09:45:49 | 只看该作者 Only view this author

这两种异体稳定性差异,除使用单点能差,吉布斯自由能差断定以外,还有什么参数可以用来进一步解释两者稳定性的差异。



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发表于 Post on 2022-5-21 13:45:07 | 只看该作者 Only view this author

分子结构优化出现震荡,希望大家能帮我看下问题所在

最近优化一个两性分子的分子结构,但是一直都优化不出来,这是我的计算条件: # opt b3lyp/6-31g(d') scrf=(solvent=water) Symbolic Z-matrix:
Charge =  0 Multiplicity = 1

两性.PNG (51.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

两性.PNG

捕获.PNG (17.94 KB, 下载次数 Times of downloads: 4)

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发表于 Post on 2022-5-21 16:46:18 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2022-5-21 02:45
这两种异体稳定性差异,除使用单点能差,吉布斯自由能差断定以外,还有什么参数可以用来进一步解释两者稳 ...

把第一个图的18位质子拿掉变成负离子,优化结构,算静电势,看看10号氮原子和17号氮原子哪个更负。然后对这个负离子做NRT分析,看各个共振式的比例,从共振式解释为什么观察到那个氮更负。
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2022-5-21 19:40:46 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-5-21 16:46
把第一个图的18位质子拿掉变成负离子,优化结构,算静电势,看看10号氮原子和17号氮原子哪个更负。然后对 ...

谢谢。
您这种方法是不是可以扩展为计算两个氮原子的质子亲和势来比较。
原理上能使用NBO的E(2)分析吗?

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发表于 Post on 2022-5-21 20:23:57 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2022-5-21 12:40
谢谢。
您这种方法是不是可以扩展为计算两个氮原子的质子亲和势来比较。
原理上能使用NBO的E(2)分析 ...

对,但比较质子亲和势等价于比较能量。
E(2)分析不太适合,因为质子化涉及的轨道相互作用太强了。再者即便能做E(2)分析,也只是能验证哪个异构体更稳定这个结论,不能揭示原因。相比之下,用NRT可以知道到底是因为哪个共振式的比例有区别,导致在相应的位点质子化更容易。
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2022-5-21 22:23:14 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 orangesea 于 2022-5-21 23:40 编辑

老师您好,在G16中使用了g09defaults关键词优化过渡态,但是出现了很小范围内的震荡,想尝试int=ultrafine,两个关键词一起写会冲突吗?能否实现其他参数为g09精度 以及int=untrafine?

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