简单量子化学问题答疑专帖（旧版，已关帖）

498746012 · 发表于 Post on 2022-5-27 08:31:35

sobereva 发表于 2022-5-18 21:40
涉及到键的形成和断裂问题，一般的力场（非反应力场），以及Tinker等程序，都没法算。
不是粗糙不粗糙， ...

谢谢sob老师

糖糖糖豆9988 · 发表于 Post on 2022-5-27 08:58:24

本帖最后由糖糖糖豆9988 于 2022-5-27 09:01 编辑

sobereva 发表于 2022-5-27 03:22
没必要做势能面扫描，用gentor+molclus做个构象搜索，所有极小点结构、能量全都出来了，看
使用molclus ...

谢谢sob老师回复，老师追问您一下如果按照作者的思路非要扫描找构象，①对于乙基环己烷自由基采用M062X/6-311G(2d,p)扫描可以不？或者您有什么推荐的更适合的方法和基组吗？②我提问中关于论文作者势能面扫描找构象的理解正确吗？谢谢老师~

sobereva · 发表于 Post on 2022-5-27 09:08:43

糖糖糖豆9988 发表于 2022-5-27 08:58
谢谢sob老师回复，老师追问您一下如果按照作者的思路非要扫描找构象，①对于乙基环己烷自由基采用M062X/6 ...

1 可以

2 如果不需要得到势能面（局部）全貌，没必要势能面扫描，直接找极小点和过渡态就完了，足矣讨论构象相关问题

护卫天使 · 发表于 Post on 2022-5-27 09:31:00

老师好，我在GaussView5.0断开了与La原子的所有键，设置原子的输入是按片段的，如图二。当我再把保存的.gif文件放进GaussView5.0里面，确发现现与N相关的键都断开了如图一。这是为什么？会影响后面的最后要计算的电荷分解吗？

溪临昭煌 · 发表于 Post on 2022-5-27 09:31:02

本帖最后由溪临昭煌于 2022-5-27 10:14 编辑

请问各位老师，初猜结构仅有一个虚频，且振动方向符合预期，但一进行optTS就会优化回接近底物的状态，可能的因素有哪些？（软件为ORCA）

sobereva · 发表于 Post on 2022-5-27 09:41:51

发帖时绝对不要用“断键”这种敷衍了事的标题，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html

分清楚gif和gjf

仔细看此文
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414（http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html）

“电荷分解”语义不明，不要自己造词

无敌菠萝派 · 发表于 Post on 2022-5-27 11:12:52

老师好，我想用gaussview构建锆配位乐果的模型，但是我无法确定锆在空间上会在乐果的哪个地方，如果锆位置不对是不是会影响我后续用Gaussian做自由能计算。而且后续如果做锆与乐果其他配位比的建模，我也不清楚锆和多个乐果之间的空间关系。不知道该怎么解决，请老师指教一下

小庄师弟 · 发表于 Post on 2022-5-27 12:35:17

各位老师，我在计算时写的是20个核计算，在服务器上使用top查看任务时发现只用了1个cpu，使用率却是2000%。以往计算的时候是显示20个cpu工作，使用率是99%左右。这是服务器出问题了吗？

RuShi · 发表于 Post on 2022-5-27 14:10:18

各位老师好！我在做Gaussian计算时，报错一直是link9999，把得到坐标优化，调整结构，还是link 9999，请问要怎么解决？请老师解答，谢谢您！
请老师解答，谢谢您！
输入文件已上传附件。输出文件过大，只截取了最后面的一部分。

输出文件：
---------------------------------------------------------------------------------
            Anisotropic Spin Dipole Couplings in Principal Axis System
---------------------------------------------------------------------------------

   Atom          a.u. MegaHertz Gauss  10(-4) cm-1       Axes

            Baa -0.0008 -0.103 -0.037 -0.035  0.6959  0.7128  0.0869
   1 C(13)  Bbb -0.0007 -0.095 -0.034 -0.032  0.0604 -0.1786  0.9821
            Bcc    0.0015    0.199    0.071    0.066  0.7156 -0.6782 -0.1674

            Baa -0.0004 -0.056 -0.020 -0.019 -0.0973 -0.3323  0.9381
   2 C(13)  Bbb -0.0004 -0.048 -0.017 -0.016  0.6714  0.6739  0.3083
            Bcc    0.0008    0.104    0.037    0.035  0.7346 -0.6599 -0.1576

            Baa -0.0004 -0.049 -0.018 -0.016  0.6652  0.6550  0.3586
   3 C(13)  Bbb -0.0003 -0.039 -0.014 -0.013 -0.2581 -0.2489  0.9335
            Bcc    0.0007    0.088    0.031    0.029 -0.7007  0.7135 -0.0035

            Baa -0.0004 -0.056 -0.020 -0.019 -0.3566 -0.1095  0.9278
   4 C(13)  Bbb -0.0003 -0.046 -0.017 -0.015  0.6671  0.6655  0.3350
            Bcc    0.0008    0.102    0.036    0.034 -0.6541  0.7384 -0.1643

            Baa -0.0008 -0.104 -0.037 -0.035  0.7439  0.6385 -0.1974
   5 C(13)  Bbb -0.0007 -0.091 -0.032 -0.030  0.0207  0.2732  0.9617
            Bcc    0.0015    0.195    0.070    0.065 -0.6680  0.7195 -0.1900

            Baa -0.0013 -0.176 -0.063 -0.059 -0.2252 -0.2040  0.9527
   6 C(13)  Bbb -0.0011 -0.144 -0.051 -0.048  0.6734  0.6741  0.3035
            Bcc    0.0024    0.320    0.114    0.107 -0.7041  0.7099 -0.0144

            Baa -0.0016 -0.221 -0.079 -0.074  0.2985  0.9356  0.1884
   7 C(13)  Bbb -0.0015 -0.200 -0.071 -0.067 -0.0211 -0.1909  0.9814
            Bcc    0.0031    0.420    0.150    0.140  0.9542 -0.2969 -0.0372

            Baa -0.0018 -0.244 -0.087 -0.082 -0.2331  0.9656  0.1155
   8 C(13)  Bbb -0.0011 -0.154 -0.055 -0.051  0.0273 -0.1122  0.9933
            Bcc    0.0030    0.399    0.142    0.133  0.9721  0.2347 -0.0002

            Baa -0.0059 -0.796 -0.284 -0.266 -0.2554  0.9651  0.0574
   9 C(13)  Bbb -0.0018 -0.241 -0.086 -0.081  0.0453 -0.0473  0.9979
            Bcc    0.0077    1.037    0.370    0.346  0.9658  0.2575 -0.0316

            Baa -0.0022 -0.087 -0.031 -0.029  0.0374  0.9991  0.0194
10 N(14)  Bbb -0.0007 -0.028 -0.010 -0.009  0.9979 -0.0383  0.0520
            Bcc    0.0030    0.115    0.041    0.038 -0.0527 -0.0174  0.9985

            Baa -0.0061 -0.812 -0.290 -0.271  0.3158  0.9486 -0.0193
11 C(13)  Bbb -0.0016 -0.208 -0.074 -0.069  0.0159  0.0151  0.9998
            Bcc    0.0076    1.020    0.364    0.340  0.9487 -0.3161 -0.0104

            Baa -0.0060 -0.808 -0.288 -0.269  0.9378 -0.3471  0.0012
12 C(13)  Bbb -0.0018 -0.237 -0.085 -0.079  0.3466  0.9360 -0.0610
            Bcc    0.0078    1.045    0.373    0.349  0.0200  0.0577  0.9981

            Baa -0.0057 -0.760 -0.271 -0.254  0.9571  0.2877 -0.0346
13 C(13)  Bbb -0.0014 -0.193 -0.069 -0.064 -0.2889  0.9567 -0.0355
            Bcc    0.0071    0.953    0.340    0.318  0.0229  0.0440  0.9988

            Baa -0.0099 -1.335 -0.476 -0.445  0.9750  0.2126 -0.0647
14 C(13)  Bbb    0.0039    0.522    0.186    0.174 -0.2133  0.9770 -0.0041
            Bcc    0.0061    0.812    0.290    0.271  0.0623  0.0178  0.9979

            Baa -0.0157 -0.607 -0.216 -0.202  0.0235  0.0314  0.9992
15 N(14)  Bbb    0.0063    0.244    0.087    0.081  0.9990 -0.0379 -0.0223
            Bcc    0.0094    0.363    0.130    0.121  0.0372  0.9988 -0.0323

            Baa -0.0097 -1.299 -0.463 -0.433  0.9615 -0.2735  0.0251
16 C(13)  Bbb    0.0040    0.542    0.193    0.181  0.2677  0.9131 -0.3076
            Bcc    0.0056    0.757    0.270    0.253  0.0612  0.3025  0.9512

            Baa -0.0075 -1.002 -0.358 -0.334  0.0215  0.0028  0.9998
17 C(13)  Bbb -0.0017 -0.227 -0.081 -0.076  0.7237  0.6899 -0.0175
            Bcc    0.0092    1.230    0.439    0.410 -0.6898  0.7239  0.0128

            Baa -0.0017 -0.225 -0.080 -0.075  0.2466  0.8212  0.5147
18 C(13)  Bbb -0.0015 -0.199 -0.071 -0.066 -0.1613 -0.4889  0.8573
            Bcc    0.0032    0.425    0.151    0.142  0.9556 -0.2944  0.0119

            Baa -0.0018 -0.244 -0.087 -0.081 -0.2380  0.9711  0.0176
19 C(13)  Bbb -0.0011 -0.153 -0.055 -0.051 -0.0272 -0.0248  0.9993
            Bcc    0.0030    0.398    0.142    0.133  0.9709  0.2373  0.0323

            Baa -0.0059 -0.792 -0.283 -0.264 -0.2553  0.9654 -0.0531
20 C(13)  Bbb -0.0019 -0.257 -0.092 -0.086 -0.0137  0.0513  0.9986
            Bcc    0.0078    1.049    0.374    0.350  0.9668  0.2557  0.0001

            Baa -0.0023 -0.088 -0.031 -0.029  0.1045  0.9945 -0.0089
21 N(14)  Bbb -0.0007 -0.028 -0.010 -0.009  0.9936 -0.1048 -0.0429
            Bcc    0.0030    0.116    0.041    0.039  0.0436  0.0044  0.9990

            Baa -0.0060 -0.807 -0.288 -0.269  0.3160  0.9485  0.0225
22 C(13)  Bbb -0.0016 -0.211 -0.075 -0.070 -0.0497 -0.0072  0.9987
            Bcc    0.0076    1.018    0.363    0.340  0.9474 -0.3168  0.0449

            Baa -0.0074 -0.989 -0.353 -0.330  0.0050  0.0245  0.9997
23 C(13)  Bbb -0.0017 -0.235 -0.084 -0.078 -0.6788  0.7342 -0.0146
            Bcc    0.0091    1.224    0.437    0.408  0.7343  0.6785 -0.0203

            Baa -0.0060 -0.808 -0.288 -0.270  0.9372 -0.3462 -0.0414
24 C(13)  Bbb -0.0018 -0.242 -0.086 -0.081  0.3482  0.9228  0.1650
            Bcc    0.0078    1.050    0.375    0.350 -0.0189 -0.1691  0.9854

            Baa -0.0057 -0.768 -0.274 -0.256  0.9546  0.2864  0.0823
25 C(13)  Bbb -0.0015 -0.204 -0.073 -0.068 -0.2961  0.9428  0.1530
            Bcc    0.0072    0.973    0.347    0.324 -0.0337 -0.1704  0.9848

            Baa -0.0099 -1.334 -0.476 -0.445  0.9762  0.2133  0.0401
26 C(13)  Bbb    0.0030    0.403    0.144    0.135 -0.2010  0.8189  0.5375
            Bcc    0.0069    0.930    0.332    0.310  0.0818 -0.5328  0.8423

            Baa -0.0154 -0.595 -0.212 -0.198 -0.0276  0.0106  0.9996
27 N(14)  Bbb    0.0060    0.231    0.083    0.077  0.9992 -0.0274  0.0279
            Bcc    0.0094    0.364    0.130    0.121  0.0277  0.9996 -0.0099

            Baa -0.0097 -1.308 -0.467 -0.436  0.9613 -0.2751  0.0148
28 C(13)  Bbb    0.0026    0.353    0.126    0.118  0.2008  0.7364  0.6461
            Bcc    0.0071    0.955    0.341    0.318 -0.1886 -0.6181  0.7631

            Baa -0.0072 -0.969 -0.346 -0.323  0.0365 -0.0674  0.9971
29 C(13)  Bbb -0.0018 -0.245 -0.088 -0.082 -0.6776  0.7317  0.0743
            Bcc    0.0091    1.215    0.433    0.405  0.7345  0.6783  0.0190

            Baa -0.0072 -0.973 -0.347 -0.324 -0.0786 -0.0483  0.9957
30 C(13)  Bbb -0.0018 -0.241 -0.086 -0.081  0.7201  0.6880  0.0902
            Bcc    0.0090    1.214    0.433    0.405 -0.6894  0.7241 -0.0193

            Baa -0.0008 -0.104 -0.037 -0.035  0.6102 -0.4832  0.6278
31 C(13)  Bbb -0.0007 -0.095 -0.034 -0.032 -0.3415  0.5546  0.7588
            Bcc    0.0015    0.199    0.071    0.066  0.7149  0.6774 -0.1734

            Baa -0.0004 -0.054 -0.019 -0.018 -0.0637  0.2878  0.9556
32 C(13)  Bbb -0.0004 -0.053 -0.019 -0.018  0.7101 -0.6597  0.2460
            Bcc    0.0008    0.107    0.038    0.036  0.7012  0.6942 -0.1624

            Baa -0.0003 -0.046 -0.016 -0.015 -0.6269  0.6831  0.3746
33 C(13)  Bbb -0.0003 -0.041 -0.014 -0.014  0.2490 -0.2800  0.9272
            Bcc    0.0006    0.086    0.031    0.029  0.7382  0.6745  0.0054

            Baa -0.0004 -0.053 -0.019 -0.018 -0.5187  0.4381  0.7342
34 C(13)  Bbb -0.0004 -0.052 -0.019 -0.017  0.3877 -0.6448  0.6587
            Bcc    0.0008    0.105    0.037    0.035  0.7620  0.6263  0.1646

            Baa -0.0007 -0.099 -0.035 -0.033 -0.6186  0.7719 -0.1464
35 C(13)  Bbb -0.0007 -0.093 -0.033 -0.031 -0.2411 -0.0092  0.9704
            Bcc    0.0014    0.191    0.068    0.064  0.7478  0.6356  0.1918

            Baa -0.0013 -0.173 -0.062 -0.058  0.1801 -0.2251  0.9575
36 C(13)  Bbb -0.0011 -0.148 -0.053 -0.049 -0.6403  0.7121  0.2879
            Bcc    0.0024    0.321    0.115    0.107  0.7467  0.6650  0.0159

            Baa -0.0007 -0.100 -0.036 -0.033  0.6606  0.7276  0.1848
37 C(13)  Bbb -0.0007 -0.097 -0.035 -0.032 -0.2483 -0.0205  0.9685
            Bcc    0.0015    0.197    0.070    0.066  0.7084 -0.6857  0.1671

            Baa -0.0004 -0.055 -0.020 -0.018  0.0073  0.2428  0.9700
38 C(13)  Bbb -0.0004 -0.050 -0.018 -0.017  0.6904  0.7006 -0.1805
            Bcc    0.0008    0.105    0.037    0.035  0.7234 -0.6710  0.1626

            Baa -0.0003 -0.046 -0.017 -0.015  0.6834  0.6771 -0.2729
39 C(13)  Bbb -0.0003 -0.040 -0.014 -0.013  0.1974  0.1885  0.9620
            Bcc    0.0006    0.086    0.031    0.029 -0.7028  0.7114  0.0049

            Baa -0.0004 -0.055 -0.020 -0.018  0.3018  0.0558  0.9517
40 C(13)  Bbb -0.0004 -0.048 -0.017 -0.016  0.6820  0.6849 -0.2565
            Bcc    0.0008    0.103    0.037    0.034 -0.6661  0.7265  0.1686

            Baa -0.0008 -0.101 -0.036 -0.034  0.7075  0.5589  0.4326
41 C(13)  Bbb -0.0007 -0.092 -0.033 -0.031 -0.2026 -0.4261  0.8817
            Bcc    0.0014    0.193    0.069    0.064 -0.6771  0.7114  0.1883

            Baa -0.0013 -0.174 -0.062 -0.058  0.1526  0.1338  0.9792
42 C(13)  Bbb -0.0011 -0.147 -0.052 -0.049  0.6934  0.6915 -0.2026
            Bcc    0.0024    0.321    0.115    0.107 -0.7042  0.7099  0.0128

            Baa -0.0008 -0.103 -0.037 -0.034 -0.6024  0.4778  0.6394
43 C(13)  Bbb -0.0007 -0.094 -0.034 -0.031  0.3458 -0.5657  0.7486
            Bcc    0.0015    0.197    0.070    0.066  0.7194  0.6721  0.1755

            Baa -0.0004 -0.054 -0.019 -0.018 -0.0453 -0.1893  0.9809
44 C(13)  Bbb -0.0004 -0.053 -0.019 -0.018  0.7062 -0.7005 -0.1026
            Bcc    0.0008    0.107    0.038    0.036  0.7066  0.6880  0.1654

            Baa -0.0003 -0.046 -0.016 -0.015 -0.6273  0.6919 -0.3574
45 C(13)  Bbb -0.0003 -0.041 -0.014 -0.014 -0.2374  0.2672  0.9339
            Bcc    0.0006    0.086    0.031    0.029  0.7417  0.6707 -0.0033

            Baa -0.0004 -0.053 -0.019 -0.018  0.4859 -0.3882  0.7831
46 C(13)  Bbb -0.0004 -0.052 -0.019 -0.017 -0.4267  0.6766  0.6002
            Bcc    0.0008    0.105    0.037    0.035  0.7628  0.6257 -0.1631

            Baa -0.0007 -0.099 -0.035 -0.033 -0.6089  0.7694  0.1933
47 C(13)  Bbb -0.0007 -0.093 -0.033 -0.031  0.2673 -0.0304  0.9631
            Bcc    0.0014    0.192    0.068    0.064  0.7469  0.6381 -0.1872

            Baa -0.0013 -0.173 -0.062 -0.058 -0.1580  0.1968  0.9676
48 C(13)  Bbb -0.0011 -0.148 -0.053 -0.050 -0.6453  0.7212 -0.2520
            Bcc    0.0024    0.321    0.115    0.107  0.7474  0.6642 -0.0131

            Baa -0.0010 -0.052 -0.019 -0.017  0.8198  0.5334  0.2081
49 Cl(35) Bbb -0.0006 -0.033 -0.012 -0.011 -0.4047  0.2827  0.8696
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            Baa -0.0008 -0.042 -0.015 -0.014  0.1666  0.5959  0.7856
50 Cl(35) Bbb -0.0007 -0.035 -0.012 -0.012  0.7020 -0.6312  0.3298
            Bcc    0.0015    0.077    0.027    0.026  0.6924  0.4966 -0.5235

            Baa -0.0009 -0.049 -0.018 -0.016  0.7912  0.5923 -0.1524
51 Cl(35) Bbb -0.0006 -0.033 -0.012 -0.011  0.4039 -0.3190  0.8574
            Bcc    0.0016    0.083    0.030    0.028 -0.4592  0.7399  0.4916

            Baa -0.0008 -0.043 -0.015 -0.014 -0.2083 -0.5600  0.8019
52 Cl(35) Bbb -0.0007 -0.036 -0.013 -0.012  0.6974 -0.6599 -0.2797
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            Baa -0.0002 -0.012 -0.004 -0.004 -0.4860  0.1026  0.8679
53 Cl(35) Bbb -0.0002 -0.012 -0.004 -0.004 -0.5870  0.6974 -0.4112
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            Baa -0.0002 -0.013 -0.005 -0.004 -0.0549 -0.4560  0.8883
54 Cl(35) Bbb -0.0002 -0.011 -0.004 -0.004  0.6765  0.6373  0.3690
            Bcc    0.0005    0.024    0.009    0.008  0.7344 -0.6212 -0.2735

            Baa -0.0002 -0.012 -0.004 -0.004  0.5078 -0.1246  0.8524
55 Cl(35) Bbb -0.0002 -0.012 -0.004 -0.004 -0.5785  0.6839  0.4446
            Bcc    0.0005    0.025    0.009    0.008  0.6384  0.7189 -0.2752

            Baa -0.0002 -0.013 -0.005 -0.004 -0.0418  0.3588  0.9325
56 Cl(35) Bbb -0.0002 -0.011 -0.004 -0.004  0.6975  0.6787 -0.2298
            Bcc    0.0005    0.024    0.009    0.008  0.7153 -0.6408  0.2787

            Baa -0.0009 -0.477 -0.170 -0.159  0.2236 -0.2754  0.9350
57 H(1) Bbb -0.0009 -0.458 -0.163 -0.153  0.6336  0.7700  0.0752
            Bcc    0.0018    0.935    0.334    0.312  0.7406 -0.5756 -0.3466

            Baa -0.0002 -0.113 -0.040 -0.038  0.5799  0.5653  0.5866
58 H(1) Bbb -0.0002 -0.112 -0.040 -0.038 -0.4197 -0.4098  0.8099
            Bcc    0.0004    0.226    0.081    0.075 -0.6982  0.7159  0.0004

            Baa -0.0003 -0.161 -0.057 -0.054 -0.4682 -0.0732  0.8806
59 H(1) Bbb -0.0003 -0.156 -0.056 -0.052  0.6421  0.6564  0.3960
            Bcc    0.0006    0.316    0.113    0.106 -0.6070  0.7508 -0.2604

            Baa -0.0011 -0.574 -0.205 -0.192  0.2505  0.9681 -0.0094
60 H(1) Bbb -0.0009 -0.496 -0.177 -0.165  0.0488 -0.0029  0.9988
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            Baa -0.0011 -0.582 -0.208 -0.194 -0.1947  0.9797  0.0486
61 H(1) Bbb -0.0009 -0.496 -0.177 -0.166  0.0448 -0.0406  0.9982
            Bcc    0.0020    1.079    0.385    0.360  0.9798  0.1965 -0.0360

            Baa -0.0013 -0.714 -0.255 -0.238  0.8918 -0.4518  0.0226
62 H(1) Bbb -0.0010 -0.547 -0.195 -0.183 -0.0005  0.0488  0.9988
            Bcc    0.0024    1.261    0.450    0.421  0.4524  0.8908 -0.0433

            Baa -0.0013 -0.692 -0.247 -0.231  0.9190  0.3922 -0.0415
63 H(1) Bbb -0.0010 -0.549 -0.196 -0.183  0.0282  0.0395  0.9988
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            Baa -0.0011 -0.572 -0.204 -0.191  0.2492  0.9683  0.0173
64 H(1) Bbb -0.0009 -0.496 -0.177 -0.165 -0.0568 -0.0033  0.9984
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            Baa -0.0011 -0.582 -0.208 -0.194 -0.1944  0.9794 -0.0540
65 H(1) Bbb -0.0009 -0.496 -0.177 -0.165 -0.0539  0.0443  0.9976
            Bcc    0.0020    1.078    0.385    0.360  0.9794  0.1968  0.0441

            Baa -0.0013 -0.716 -0.256 -0.239  0.8855 -0.4396 -0.1502
66 H(1) Bbb -0.0010 -0.547 -0.195 -0.183  0.1080 -0.1197  0.9869
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            Baa -0.0013 -0.699 -0.249 -0.233  0.9050  0.3793  0.1925
67 H(1) Bbb -0.0010 -0.548 -0.196 -0.183 -0.1622 -0.1107  0.9805
            Bcc    0.0023    1.247    0.445    0.416 -0.3932  0.9186  0.0387

            Baa -0.0009 -0.498 -0.178 -0.166  0.5963 -0.1182  0.7940
68 H(1) Bbb -0.0008 -0.445 -0.159 -0.148 -0.5171  0.7000  0.4926
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            Baa -0.0002 -0.114 -0.041 -0.038 -0.0041  0.0013  1.0000
69 H(1) Bbb -0.0002 -0.113 -0.040 -0.038 -0.6754  0.7375 -0.0037
            Bcc    0.0004    0.227    0.081    0.076  0.7375  0.6754  0.0021

            Baa -0.0003 -0.159 -0.057 -0.053 -0.2859 -0.0531  0.9568
70 H(1) Bbb -0.0003 -0.155 -0.055 -0.052 -0.5782  0.8058 -0.1280
            Bcc    0.0006    0.314    0.112    0.105  0.7642  0.5898  0.2611

            Baa -0.0009 -0.478 -0.171 -0.160 -0.3023  0.1946  0.9331
71 H(1) Bbb -0.0009 -0.454 -0.162 -0.152  0.6304  0.7751  0.0426
            Bcc    0.0017    0.933    0.333    0.311  0.7150 -0.6011  0.3570

            Baa -0.0002 -0.113 -0.040 -0.038 -0.2444 -0.2421  0.9390
72 H(1) Bbb -0.0002 -0.113 -0.040 -0.038  0.6706  0.6573  0.3440
            Bcc    0.0004    0.226    0.081    0.076 -0.7004  0.7137  0.0017

            Baa -0.0003 -0.160 -0.057 -0.054  0.4275  0.0349  0.9034
73 H(1) Bbb -0.0003 -0.156 -0.056 -0.052  0.6508  0.6817 -0.3343
            Bcc    0.0006    0.316    0.113    0.106 -0.6275  0.7308  0.2686

            Baa -0.0009 -0.492 -0.176 -0.164 -0.5765  0.0938  0.8117
74 H(1) Bbb -0.0008 -0.441 -0.157 -0.147 -0.5311  0.7119 -0.4594
            Bcc    0.0017    0.934    0.333    0.311  0.6210  0.6960  0.3606

            Baa -0.0002 -0.114 -0.041 -0.038  0.0944 -0.1037  0.9901
75 H(1) Bbb -0.0002 -0.113 -0.040 -0.038 -0.6643  0.7342  0.1402
            Bcc    0.0004    0.226    0.081    0.075  0.7415  0.6710 -0.0004

            Baa -0.0003 -0.160 -0.057 -0.053  0.3195  0.0052  0.9476
76 H(1) Bbb -0.0003 -0.156 -0.056 -0.052 -0.5610  0.8069  0.1848
            Bcc    0.0006    0.315    0.113    0.105  0.7637  0.5906 -0.2607

            Baa -2.0761  -262.163 -93.546 -87.448  0.9995 -0.0326  0.0033
77 Co(59) Bbb    0.2832 35.766 12.762 11.930  0.0327  0.9936 -0.1079
            Bcc    1.7928 226.397 80.784 75.518  0.0003  0.1080  0.9942

---------------------------------------------------------------------------------

SI MONUMENTUM REQUIRIS, CIRCUMSPICE
   -- FROM SIR CHRISTOPHER WREN'S TOMBSTONE
Error termination request processed by link 9999.
Error termination via Lnk1e in /public3/home/scg4962/software-scg4962/g09D01/l9999.exe at Fri May 27 02:56:17 2022.
Job cpu time:    5 days 17 hours 45 minutes 28.9 seconds.
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糖糖糖豆9988 · 发表于 Post on 2022-5-27 14:49:56

请教老师，一定温度范围内不同构象的玻尔兹曼分布是如何计算得到呢？谢谢

wangy0822 · 发表于 Post on 2022-5-27 15:23:04

请教一下大家，这个虚线的化学键是什么意思，碳原子已经饱和了，这是一个团簇模型，从晶体结构扩胞抠出来的，晶体结构中貌似没有这个虚线的键

chands · 发表于 Post on 2022-5-27 15:27:13

本帖最后由 chands 于 2022-5-27 15:29 编辑

wangy0822 发表于 2022-5-27 15:23
请教一下大家，这个虚线的化学键是什么意思，碳原子已经饱和了，这是一个团簇模型，从晶体结构扩胞抠出来的 ...

完全不影响计算，可以忽略。谈谈原子间是否成键的判断问题 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)

wangy0822 · 发表于 Post on 2022-5-27 15:30:08

chands 发表于 2022-5-27 15:27
完全不影响计算，可以忽略。谈谈原子间是否成键的判断问题 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二 ...

好的，感谢您的解答。可不可以告知这个键是什么意思

chands · 发表于 Post on 2022-5-27 15:31:39

本帖最后由 chands 于 2022-5-27 15:35 编辑

糖糖糖豆9988 发表于 2022-5-27 14:49
请教老师，一定温度范围内不同构象的玻尔兹曼分布是如何计算得到呢？谢谢

你把几个构象的自由能G算出来，relative fraction 正比于exp(-G/RT)。根据Boltzmann分布计算分子不同构象所占比例 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)

chands · 发表于 Post on 2022-5-27 15:38:09

wangy0822 发表于 2022-5-27 15:30
好的，感谢您的解答。可不可以告知这个键是什么意思

有可能是这个键比通常的单键略短，又比通常的双键略长，所以软件自动判断键级为1.5。

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