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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2022-6-13 14:36:10 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-6-13 09:42
不是。举例说,你要算气相的苯分子,就不用加溶剂模型,你要算溶解在乙醇中的苯分子,就要加溶剂模型,并 ...

如果我想计算气相分子时的结构优化和单点能,是不是不写scrf-(smd,solvent=***)这一部分就可以了

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发表于 Post on 2022-6-13 14:46:47 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 chands 于 2022-6-13 15:22 编辑
weifujing 发表于 2022-6-13 14:36
如果我想计算气相分子时的结构优化和单点能,是不是不写scrf-(smd,solvent=***)这一部分就可以了

如果要对气相分子作结构优化和计算单点能,不要加溶剂模型。
如果要计算分子的溶解自由能,由于分子在溶液中的结构可能与在气相中的结构不同,保险起见,建议优化时加溶剂模型。
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发表于 Post on 2022-6-13 14:59:12 | 只看该作者 Only view this author
请问怎么判断一个机组计算结果的精确性,比如6-311g**计算结果优于6-31g(d,p),怎么判断6-311g**的结果就更精确,用的什么方法,什么标准?

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发表于 Post on 2022-6-13 15:14:38 | 只看该作者 Only view this author
WOOOOWOOOO 发表于 2022-6-13 07:59
请问怎么判断一个机组计算结果的精确性,比如6-311g**计算结果优于6-31g(d,p),怎么判断6-311g**的结果就更 ...

方法1:6-311g**计算出来的能量比6-31g(d,p)低,根据变分原理,6-311g**算出来的总能量更准。但是这个不能必然推出6-311g**的能量差更准,只能推出6-311g**的能量差大概率更准。
方法2:用一个比两个基组都大的基组做一个计算,看看哪个基组和这个大基组的结果更接近。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2022-6-13 16:19:51 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-6-13 14:46
如果要对气相分子作结构优化和计算单点能,不要加溶剂模型。
如果要计算分子的溶解自由能,由于分子在溶 ...

明白了,谢谢

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发表于 Post on 2022-6-13 16:58:21 | 只看该作者 Only view this author

gaussian

博主大大 是不是属于闭壳层,因为它只是额外带了一个质子,不带电,画结构的时候需要多画一个氢对吗,设置计算的时候设置为+1价还是0价,自选多重度为1对吗

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发表于 Post on 2022-6-13 17:13:11 | 只看该作者 Only view this author
题目要具体,否则社长会过来教育你的
发帖时务必注意恰当填写标题
http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html
Et3NH+相当于NH4+。
不是设置价态而是整个分子的带电量,Et3NH+带一个单位正电荷,所以电荷数为1。电子都两两配对了,自旋多重度为1。
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发表于 Post on 2022-6-13 17:41:13 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 exity 于 2022-6-13 17:46 编辑

因为质子化导致的电荷数的增加的情况,99.99%不会改变自旋多重度,因为质子是没有电子的,所以质子化不会增加系统的电子数。
你这个情况写
1 1就好了

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发表于 Post on 2022-6-13 17:55:00 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-13 15:14
方法1:6-311g**计算出来的能量比6-31g(d,p)低,根据变分原理,6-311g**算出来的总能量更准。但是这个不 ...

明白了,谢谢您

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-13 20:03:43 | 只看该作者 Only view this author
lc5211314 发表于 2022-6-13 16:58
博主大大是不是属于闭壳层,因为它只是额外带了一个质子,不带电,画结构的时候需要多画一个氢对吗,设置计 ...

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html

下次发帖时标题如果再次只写个“gaussian”,直接删帖+扣分处理!
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2022-6-13 21:08:20 | 只看该作者 Only view this author

请教:关于DI(distortion-interaction)失真相互作用

“两种过渡态TS26和TS27进行了失真相互作用(DI)分析(图2d)”。想请教一下大家这个如何分析,由于是新手,大家可以推荐我相关Sob老师的博客地址我去自学

QQ截图20220613210614.png (159.64 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-13 22:01:20 | 只看该作者 Only view this author
此问题和Multiwfn没直接关系

提问前先用公社论坛首页全文搜索框搜索,论坛里早就有详细的回答:
http://bbs.keinsci.com/thread-23990-1-1.html
http://bbs.keinsci.com/thread-27703-1-1.html

提问时绝对不要随心所欲翻译名词,不翻译别人知道怎么回事,乱翻译完了,知道这方法的人都不知道你说的是什么方法
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2022-6-13 22:08:34 | 只看该作者 Only view this author
失真不是distortion的唯一翻译,此处不能翻译成失真。只要知道distortion-interaction analysis的定义就知道正确的翻译是什么。
学英语切忌认为每个英语词都有唯一的中文翻译,更不能认为普通英汉词典的释义一定也可以用来翻译专业名词。当然这也不是只有初学者才会犯的错误,像我之前看到有英语专业的人翻译生物、化学方向的科普书,把transition state翻译成“转换态”,编辑竟然也没看出来,就这么出版了,这种例子也是有的。
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2022-6-14 09:14:19 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-13 22:08
失真不是distortion的唯一翻译,此处不能翻译成失真。只要知道distortion-interaction analysis的定义就知 ...

请教下正确的翻译是什么?我都叫做 畸变相互作用

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发表于 Post on 2022-6-14 10:50:20 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-6-13 17:13
题目要具体,否则社长会过来教育你的
发帖时务必注意恰当填写标题
http://bbs.keinsci.com/thre ...

感谢大哥的回复,刚来不了解规矩,下次一定注意

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