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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2022-6-15 18:03:43 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好!
我是做热解的,我这个主要是均裂反应,想绘制一个能量折线图,这个能量是应该取吉布斯自由能吗,还是焓值?我看ACS上的好多都取的吉布斯自由能,但我这个第一步是均裂,所以用的键能,键能sob老师说过是焓相减。所以我不太知道到底应该用焓还是吉布斯自由能。谢谢各位老师指点

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发表于 Post on 2022-6-15 19:32:38 | 只看该作者 Only view this author
Roonry 发表于 2022-6-15 18:03
各位老师好!
我是做热解的,我这个主要是均裂反应,想绘制一个能量折线图,这个能量是应该取吉布斯自由能 ...

能量折线图理论上既可以用焓,也可以用Gibbs自由能,但是Gibbs自由能告诉你更多东西,比如平衡常数,比如用过渡态理论计算速率常数,所以文献中用Gibbs自由能的多。键解离能和能量折线图是两回事,键解离能根据定义是是焓相减,这与能量折线图用Gibbs自由能绘制不冲突。
ORCA大法好!CP2K大法好!
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山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
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发表于 Post on 2022-6-15 20:17:30 | 只看该作者 Only view this author
Yin 发表于 2022-6-15 03:53
感谢老师的回复。根据您的建议我做了振动分辨光谱,计算得到的吸收光谱数据波数出现了负数的情况,而且强 ...

发射光谱应该用equilibrium solvation,参见http://sobereva.com/314。如果还是对不上的话,分析一下激发态成分,看看是不是不适合用这个泛函来算。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2022-6-15 20:19:14 | 只看该作者 Only view this author
Roonry 发表于 2022-6-15 11:03
各位老师好!
我是做热解的,我这个主要是均裂反应,想绘制一个能量折线图,这个能量是应该取吉布斯自由能 ...

“但我这个第一步是均裂,所以用的键能”这个逻辑不成立,均裂不是必须用键能,也可以用键解离自由能。同一条折线必须统一用焓或者Gibbs自由能,又因为只有Gibbs自由能是和速率常数、平衡常数挂钩的,所以如果没有特殊原因应该用Gibbs自由能
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2022-6-15 21:33:07 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-15 20:19
“但我这个第一步是均裂,所以用的键能”这个逻辑不成立,均裂不是必须用键能,也可以用键解离自由能。同 ...

谢谢指点,我还想问一下键解离自由能该如何计算?shermo里的G校正值加上电子能量?我这个不涉及速率常数之类的,是不是用哪个都可以?

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发表于 Post on 2022-6-15 21:35:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Roonry 于 2022-6-15 21:49 编辑
chands 发表于 2022-6-15 19:32
能量折线图理论上既可以用焓,也可以用Gibbs自由能,但是Gibbs自由能告诉你更多东西,比如平衡常数,比如 ...

谢谢指点,我看大部分都是吉布斯自由能;我想问您一下,一个物质在第一步断裂成两个自由基,分别优化计算电子能量,然后加上用shermo得到的G校正值,自由基的吉布斯自由能的和与原料的自由能的差值就是第一步的能量值对吧?

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发表于 Post on 2022-6-15 22:45:20 | 只看该作者 Only view this author
Roonry 发表于 2022-6-15 14:33
谢谢指点,我还想问一下键解离自由能该如何计算?shermo里的G校正值加上电子能量?我这个不涉及速率常数 ...


关键还是在于你到底要解释什么实验现象,因为你算这个肯定不是只要个没有意义的数字,肯定是为了解释实验现象的。如果是平衡常数、速率常数、反应产率、选择性之类的,要用Gibbs自由能;如果是反应的热效应,需要用焓。
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2022-6-16 07:10:04 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-15 22:45

关键还是在于你到底要解释什么实验现象,因为你算这个肯定不是只要个没有意义的数字,肯定是为了解释 ...

好的,万分感谢您的指点

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发表于 Post on 2022-6-16 08:48:19 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-15 20:17
发射光谱应该用equilibrium solvation,参见http://sobereva.com/314。如果还是对不上的话,分析一下激发 ...

好的,谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-16 10:19:07 | 只看该作者 Only view this author
Roonry 发表于 2022-6-15 18:03
各位老师好!
我是做热解的,我这个主要是均裂反应,想绘制一个能量折线图,这个能量是应该取吉布斯自由能 ...

吉布斯自由能

描述键解离又不是只有一种热力学量,当然也可以是解离自由能
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-6-16 19:06:40 | 只看该作者 Only view this author
想请问一下大家,我在用高斯计算一个分子体系,因为体系内涉及到过渡金属,因此自选多重度在我的体系里面有两种可能,2重态和四重态,想跟各位老师确定一下,通过比较能量选取稳定构型的时候,比较的是体系的电子能量么?

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发表于 Post on 2022-6-16 19:27:08 | 只看该作者 Only view this author
吴双 发表于 2022-6-16 12:06
想请问一下大家,我在用高斯计算一个分子体系,因为体系内涉及到过渡金属,因此自选多重度在我的体系里面有 ...

对。但是不能直接比同一个结构下的单点能,两个自旋多重度下的结构都必须优化以后,再算单点能,再比。严格来说自由能比能量更严格一些,不过能量差和自由能差一般很接近,所以不是必须用自由能
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发表于 Post on 2022-6-16 19:41:22 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-16 19:27
对。但是不能直接比同一个结构下的单点能,两个自旋多重度下的结构都必须优化以后,再算单点能,再比。严 ...

老师 还有一个问题我比较困惑想跟您请教一下,我想做一个团簇,CrMo6O18(OH)6整体化合价是-3价,其中Cr化合价是+3价,在用高斯计算的时候电荷和自选多重度是-3 4,想做一下这个团簇被H2O2氧化,Cr由+3价被氧化成+4价,团簇结构变为CrMo6O18(OH)2OOH,同时生成一分子水离去,,此时我看文献里电荷和自选多重度是-3 4,想请教一下您这块应该怎么理解呢?

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发表于 Post on 2022-6-16 19:50:00 | 只看该作者 Only view this author
吴双 发表于 2022-6-16 12:41
老师 还有一个问题我比较困惑想跟您请教一下,我想做一个团簇,CrMo6O18(OH)6整体化合价是-3价,其中Cr化 ...

自己数一下电子数就行了,一个一个地数电子,总核电荷减去总电子数等于电荷,alpha电子数减去beta电子数加1等于自旋多重度。这就是机械性的计算,谈不上什么怎么理解。
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2022-6-16 20:23:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-16 10:19
吉布斯自由能

描述键解离又不是只有一种热力学量,当然也可以是解离自由能

好的,谢谢sob老师

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