简单量子化学问题答疑专帖（旧版，已关帖）

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-6-27 19:03:52

taotaoguo 发表于 2022-6-27 11:18
各位老师好，我计划进行改性淀粉材料对有机染料分子的吸附过程计算，我现在使用的是Gaussian计算软件，将改 ...

离子晶体/原子晶体/金属表面的计算，MS相比高斯确实有一定优势（但是至于高斯算的是不是差到不能用，那另说），原因是如果在高斯里算必须从晶体表面截出一块来作为团簇模型，这个截断引入的误差比较大。但是对于聚合物而言，基本上只要截断两根键就行了，而且重复单元可以选大一些也完全算得动，此时MS相比高斯没有明显优势。矿物浮选涉及的吸附过程，都是分子在离子晶体/原子晶体表面的吸附，所以那个老师说的话在矿物浮选这个小领域里是有道理的，但是不能不加前提地拓展到整个化学领域。

taotaoguo · 发表于 Post on 2022-6-27 19:06:17

wzkchem5 发表于 2022-6-27 19:03
离子晶体/原子晶体/金属表面的计算，MS相比高斯确实有一定优势（但是至于高斯算的是不是差到不能用，那另 ...

非常感谢老师的回答！

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-6-27 19:10:48

taotaoguo 发表于 2022-6-27 11:18
各位老师好，我计划进行改性淀粉材料对有机染料分子的吸附过程计算，我现在使用的是Gaussian计算软件，将改 ...

另外顺便一说，你这个纤维素-壳聚糖的结构建错了吧，怎么还有氧-氧键

taotaoguo · 发表于 Post on 2022-6-27 21:03:17

wzkchem5 发表于 2022-6-27 19:10
另外顺便一说，你这个纤维素-壳聚糖的结构建错了吧，怎么还有氧-氧键

这个是文献里面的，我也不了解这种材料的结构

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-6-27 21:06:14

taotaoguo 发表于 2022-6-27 14:03
这个是文献里面的，我也不了解这种材料的结构

确认文献没画错？多查几篇文献看看。不管是从有机化学角度还是生物化学角度，都不可能轻易合成出用O-O键连接的多糖（这种可能都未必能叫多糖），即使合成出来，也是拿锤子砸一下就炸的那种，因为是有机过氧化物。如果你确定你要研究的物质没有一锤就炸、一加热就炸的特点，那基本不太可能有过氧键。

ionexchangeC · 发表于 Post on 2022-6-27 23:40:39

据我的观察，不少教材在写淀粉、纤维素这类多糖以及它们的衍生物时，写的结构式都是错的，按照错误的结构式建模就会出现氧氧键

taotaoguo · 发表于 Post on 2022-6-27 23:42:26

wzkchem5 发表于 2022-6-27 21:06
确认文献没画错？多查几篇文献看看。不管是从有机化学角度还是生物化学角度，都不可能轻易合成出用O-O键 ...

好的，谢谢提醒

我没有使用这个结构，我的材料不是这个样子的

sai77 · 发表于 Post on 2022-6-28 09:17:23

本帖最后由 sai77 于 2022-6-28 09:38 编辑

请问二价铜络合物的结构优化，例如Cu(OAc)2，由于Cu上有未成对电子，电荷和自旋多重度设为0 2就可以了吗？

snljty2 · 发表于 Post on 2022-6-28 09:26:06

sai77 发表于 2022-6-28 09:17
请问二价铜络合物的结构优化，例如Cu(OAc)2，由于Cu上有未成对电子，电荷和自旋量子数设为0 2就可以了吗？

那个不叫自旋量子数，是自旋多重度，跟自旋量子数完全两码事。

北大-陶豫 · 发表于 Post on 2022-6-28 09:34:24

sai77 发表于 2022-6-28 09:17
请问二价铜络合物的结构优化，例如Cu(OAc)2，由于Cu上有未成对电子，电荷和自旋量子数设为0 2就可以了吗？

这玩意好像容易通过 Cu-Cu 键形成二聚体，确定要算的是单体吗

sai77 · 发表于 Post on 2022-6-28 09:42:09

snljty2 发表于 2022-6-28 09:26
那个不叫自旋量子数，是自旋多重度，跟自旋量子数完全两码事。

汗，最近在讨论各个元素的自旋量子数，搞混了~多谢指出

sai77 · 发表于 Post on 2022-6-28 09:56:06

北大-陶豫发表于 2022-6-28 09:34
这玩意好像容易通过 Cu-Cu 键形成二聚体，确定要算的是单体吗

我感觉我要算的体系也可能是二聚体催化，因为不涉及自由基的历程。
但是如果是二聚体，体系就太大了，算不动。

小小小白 · 发表于 Post on 2022-6-28 12:03:20

请教各位大佬，表面吸附两个分子，现在想计算这两个分子之间的相互作用能，对于这个体系，能量应该怎么算？只知道没有表面的时候是Eint=EAB-EA-EB，有了表面之后的两分子间相互作用能怎么算？

sai77 · 发表于 Post on 2022-6-28 12:24:19

北大-陶豫发表于 2022-6-28 09:34
这玩意好像容易通过 Cu-Cu 键形成二聚体，确定要算的是单体吗

再向您请教一下，形成二聚体除了Cu-Cu键这种结构，是不是还可以通过阴离子桥接的形式？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-6-28 13:59:46

sai77 发表于 2022-6-28 05:24
再向您请教一下，形成二聚体除了Cu-Cu键这种结构，是不是还可以通过阴离子桥接的形式？

四个OAc都是桥连配体，而且每个Cu上还额外多配一个水。
自己查一下水合醋酸铜的结构就知道了

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请教在吸附中两吸附质之间的相互作用能的计算问题