计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

   关闭 [复制链接 Copy URL]

153

帖子

0

威望

1683

eV
积分
1836

Level 5 (御坂)

16021#
发表于 Post on 2022-7-20 09:48:02 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-7-19 15:29
以后如果自己解决了自己提出的问题,一定要把解决方案也发上来,这样别人遇到相同问题、搜到这个帖子,可 ...

收到大佬,已经附上了解决方案,是属于小众问题,昨天搜索论坛没有发现之前有关讨论就来询问大家了。
Lure Over Love

62

帖子

0

威望

252

eV
积分
314

Level 3 能力者

16022#
发表于 Post on 2022-7-20 10:36:16 | 只看该作者 Only view this author
请教老师:
      我之前学过VASP,但是想计算自定义晶胞基矢,VASP难以实现,也找不到任何资料,所以来请教您,如图所示,原坐标为蓝色,我想改成黑色的,就是坐标原点在体心的,进行态密度计算,用什么计算程序能实现啊?

202207201036136371..jpg (108.41 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

202207201036136371..jpg

62

帖子

0

威望

252

eV
积分
314

Level 3 能力者

16023#
发表于 Post on 2022-7-20 10:38:26 | 只看该作者 Only view this author
第二个问题,如果计算一个界面结构的析氢反应过渡态,原子数100左右,用VASP和Gussian哪个计算效率更高?计算精度有多大差异?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

16024#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-21 11:20:37 | 只看该作者 Only view this author
lora2021 发表于 2022-7-20 10:38
第二个问题,如果计算一个界面结构的析氢反应过渡态,原子数100左右,用VASP和Gussian哪个计算效率更高?计 ...

没有叫Gussian的程序

我不知道你的原子数怎么确定的,以及具体是什么界面,把信息交代具体
如果当周期性体系算,追求效率用CP2K,而不是VASP
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

16025#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-21 11:21:01 | 只看该作者 Only view this author
lora2021 发表于 2022-7-20 10:36
请教老师:
      我之前学过VASP,但是想计算自定义晶胞基矢,VASP难以实现,也找不到任何资料,所以来请 ...

本帖仅限于回答量子化学问题
第一性原理相关问题到第一性原理板块问
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

16026#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-21 11:21:57 | 只看该作者 Only view this author
aser 发表于 2022-7-19 19:18
本人在用GAUSSIAN给charge=0的体系做NBO分析时发现计算结果中的电荷综合不为零。为什么会这样呢,这样正常 ...

这是开壳层体系,total、alpha和beta电子会单独分析。要看就看total的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125155

管理员

公社社长

16027#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-21 11:23:02 | 只看该作者 Only view this author
wyqms 发表于 2022-7-19 14:20
我之前把簇模型全优化了,结构与优化之前差别挺大的,那这组计算的数据是不是需要重新在限制性条件下跑? ...


不做冻结的话边缘的重原子位置往往会和体相结构有极大差异,模型什么也说明不了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

13

帖子

0

威望

45

eV
积分
58

Level 2 能力者

16028#
发表于 Post on 2022-7-21 16:34:01 | 只看该作者 Only view this author

l202错误想麻烦各位老师看下应该怎么解决

本帖最后由 494085639 于 2022-7-21 16:44 编辑

初学高斯,遇到一个分子出现了l202错误,在论坛没能找到解决方法,麻烦各位老师给看下应该怎么解决,附件有输出文件

C3G-BETTER.LOG

39.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

210

帖子

1

威望

4358

eV
积分
4588

Level 6 (一方通行)

16029#
发表于 Post on 2022-7-21 16:53:15 | 只看该作者 Only view this author
23号原子和33号原子太近了,都几乎重合了,调整初期结构重新计算一下能解决。
Ph.D., Asst. Prof. at UOsaka.
Homepage: wongzit.github.io

13

帖子

0

威望

45

eV
积分
58

Level 2 能力者

16030#
发表于 Post on 2022-7-21 18:07:26 | 只看该作者 Only view this author
wangzhe 发表于 2022-7-21 16:53
23号原子和33号原子太近了,都几乎重合了,调整初期结构重新计算一下能解决。

谢谢老师,自动加氢没注意结构问题,修改后就正常了

62

帖子

0

威望

252

eV
积分
314

Level 3 能力者

16031#
发表于 Post on 2022-7-22 09:05:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-7-21 11:20
没有叫Gussian的程序

我不知道你的原子数怎么确定的,以及具体是什么界面,把信息交代具体

好的,谢谢老师!第一个问题我也找到解决办法了,多谢!

153

帖子

0

威望

1683

eV
积分
1836

Level 5 (御坂)

16032#
发表于 Post on 2022-7-22 09:38:27 | 只看该作者 Only view this author
卢老师您好,请问找过渡态过程中涉及到了最终产物自旋多重度为1的开壳层体系,但是反应物是闭壳层的话,是否需要使用非限制性开壳层计算寻找过渡态?
Lure Over Love

3

帖子

0

威望

353

eV
积分
356

Level 3 能力者

16033#
发表于 Post on 2022-7-22 14:23:11 | 只看该作者 Only view this author
请问各位大佬,这种图是用什么软件画出来的?

202207221422568031..jpg (114.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

202207221422568031..jpg

5

帖子

0

威望

57

eV
积分
62

Level 2 能力者

16034#
发表于 Post on 2022-7-22 14:48:57 | 只看该作者 Only view this author

格式转化问题。

请问各位老师,我刚刚算出的单点,chk格式转化为fchk出现了图片的问题,这是什么原因。

1658472470792.jpg (21.72 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

1658472470792.jpg

1万

帖子

0

威望

9888

eV
积分
22133

Level 6 (一方通行)

16035#
发表于 Post on 2022-7-22 15:23:40 | 只看该作者 Only view this author
Gzh_NJ 发表于 2022-7-22 02:38
卢老师您好,请问找过渡态过程中涉及到了最终产物自旋多重度为1的开壳层体系,但是反应物是闭壳层的话,是 ...

Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-24 16:18 , Processed in 0.306573 second(s), 28 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list