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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-21 11:23:02 | 只看该作者 Only view this author
wyqms 发表于 2022-7-19 14:20
我之前把簇模型全优化了,结构与优化之前差别挺大的,那这组计算的数据是不是需要重新在限制性条件下跑? ...


不做冻结的话边缘的重原子位置往往会和体相结构有极大差异,模型什么也说明不了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2022-7-21 16:34:01 | 只看该作者 Only view this author

l202错误想麻烦各位老师看下应该怎么解决

本帖最后由 494085639 于 2022-7-21 16:44 编辑

初学高斯,遇到一个分子出现了l202错误,在论坛没能找到解决方法,麻烦各位老师给看下应该怎么解决,附件有输出文件

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发表于 Post on 2022-7-21 16:53:15 | 只看该作者 Only view this author
23号原子和33号原子太近了,都几乎重合了,调整初期结构重新计算一下能解决。
Ph.D., Asst. Prof. at UOsaka.
Homepage: wongzit.github.io

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发表于 Post on 2022-7-21 18:07:26 | 只看该作者 Only view this author
wangzhe 发表于 2022-7-21 16:53
23号原子和33号原子太近了,都几乎重合了,调整初期结构重新计算一下能解决。

谢谢老师,自动加氢没注意结构问题,修改后就正常了

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发表于 Post on 2022-7-22 09:05:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-7-21 11:20
没有叫Gussian的程序

我不知道你的原子数怎么确定的,以及具体是什么界面,把信息交代具体

好的,谢谢老师!第一个问题我也找到解决办法了,多谢!

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发表于 Post on 2022-7-22 09:38:27 | 只看该作者 Only view this author
卢老师您好,请问找过渡态过程中涉及到了最终产物自旋多重度为1的开壳层体系,但是反应物是闭壳层的话,是否需要使用非限制性开壳层计算寻找过渡态?
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发表于 Post on 2022-7-22 14:23:11 | 只看该作者 Only view this author
请问各位大佬,这种图是用什么软件画出来的?

202207221422568031..jpg (114.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

202207221422568031..jpg

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发表于 Post on 2022-7-22 14:48:57 | 只看该作者 Only view this author

格式转化问题。

请问各位老师,我刚刚算出的单点,chk格式转化为fchk出现了图片的问题,这是什么原因。

1658472470792.jpg (21.72 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

1658472470792.jpg

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发表于 Post on 2022-7-22 15:23:40 | 只看该作者 Only view this author
Gzh_NJ 发表于 2022-7-22 02:38
卢老师您好,请问找过渡态过程中涉及到了最终产物自旋多重度为1的开壳层体系,但是反应物是闭壳层的话,是 ...

Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

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发表于 Post on 2022-7-22 15:51:21 | 只看该作者 Only view this author
segmentation fault,N多原因,可能是访问越界了,或者访问了空地址,解决不了的话找管理员。
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-22 15:54:02 | 只看该作者 Only view this author
不喝可乐 发表于 2022-7-22 14:48
请问各位老师,我刚刚算出的单点,chk格式转化为fchk出现了图片的问题,这是什么原因。

把此文提到的和formchk有关的该注意的都注意了
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html

死活不行就重算一次单点再尝试转换
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发表于 Post on 2022-7-22 18:19:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 阿甘 于 2022-7-22 19:38 编辑

老师,请问我在用ORCA 5.0.3 算单点能的时候遇到了以下报错,SCF算了一次就跳出来了,请问是什么原因呢?以下是我的输入文件:
! wB97X-2 D3 ma-def2-QZVP def2/J def2-QZVPP/C RIJCOSX noautostart
%scf
thresh 1e-12
tcut 1e-14
HFTyp=UKS
end
%maxcore  3000
%pal nprocs  48 end
# DFT-D3(BJ) parameter for wB97X-2, see SI of PCCP, 20, 23175 (2018)
%method
D3S6 0.547
D3A1 3.520
D3S8 0.0
D3A2 7.795
end
* xyz   0   1

202207221821119142..png (12.85 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

202207221821119142..png

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阿甘 发表于 2022-7-22 18:19
老师,请问我在用ORCA 5.0.3 算单点能的时候遇到了以下报错,SCF算了一次就跳出来了,请问是什么原因呢?以 ...

先串行运行试试
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-22 20:00:41 | 只看该作者 Only view this author
aser 发表于 2022-7-22 14:23
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