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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-20 21:20:19 | 只看该作者 Only view this author
Lym 发表于 2022-8-20 15:48
the Lorentz–Lorenz equation方程中的摩尔体积如何得到呢Vm?并且为什么文献中给出的Vm/a.u.(单位为什么 ...

已知质量密度(查实验值,或分子动力学模拟得到)和分子摩尔质量,自然知道每摩尔分子体积是多少,中学化学计算题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-8-21 08:57:32 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-8-19 20:28
https://www.youtube.com/watch?v=t0kTVRXXi84

收到,谢谢老师

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发表于 Post on 2022-8-21 08:59:18 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-8-19 20:26
报错信息已经写得很清楚了,6-31++g(d,p)不支持La、Th。
看http://sobereva.com/336了解应该给La、Th选 ...

老师我只是想算一下金属络合物的结合能,算单纯金属离子在水中的自由能也要用显示溶剂吗?

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发表于 Post on 2022-8-21 09:04:10 | 只看该作者 Only view this author
KCM@SHU 发表于 2022-8-21 08:59
老师我只是想算一下金属络合物的结合能,算单纯金属离子在水中的自由能也要用显示溶剂吗?

要。过程很麻烦,见sob老师博文里提到的文章。所以首先查一下文献里是否有算好的。
ORCA大法好!CP2K大法好!
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发表于 Post on 2022-8-21 13:37:38 | 只看该作者 Only view this author
老师,想问一下,过渡金属催化脱质子化的逆过程能垒很高怎么办?按照实验文献中提供的机制图,算出来的结果能垒高达40kcal/mol

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发表于 Post on 2022-8-21 13:49:36 | 只看该作者 Only view this author
化小白 发表于 2022-8-21 13:37
老师,想问一下,过渡金属催化脱质子化的逆过程能垒很高怎么办?按照实验文献中提供的机制图,算出来的结果 ...

给出文献机制图,给出计算过程。
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发表于 Post on 2022-8-21 14:28:57 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-8-20 18:09
升级你的GaussView

谢谢

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发表于 Post on 2022-8-21 18:17:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-8-20 21:18
formchk这样的Gaussian自带工具需要用GAUSS_MEMDEF环境变量指定可调用的内存上限,参看http://sobereva.c ...

感谢老师的回复。我有尝试将GAUSS_MEMDEF变量值设为3GB、5GB,但依然还是同样报错。我只是把chk文件拖到了Gaussian里,就已经报错了,还没有到用formchk的步骤。请问该怎样解决呢?

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发表于 Post on 2022-8-21 19:04:52 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好我在用Gaussian计算高价过渡金属离子(H2O配位)的VEA,选择理论方法的时候遇到了点问题,我算的是四价铁[Fe=O(H2O)5]2+和四价钴这两个物质[Co=O(H2O)5]2+,前期已经在PBE1PBE/TZVP基组下优化了几何结构,并且在PBE1PBE下用加了弥散函数的ma-TZVP基组计算单点能是可以的,现在想用MN15或者TPSSh计算单点能但是电脑确报错了这是为什么啊?

202208211901162796..png (37.47 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

202208211901162796..png

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发表于 Post on 2022-8-21 19:27:19 | 只看该作者 Only view this author
white-album 发表于 2022-8-21 19:04
各位老师好我在用Gaussian计算高价过渡金属离子(H2O配位)的VEA,选择理论方法的时候遇到了点问题,我算的 ...

TPSSh不能直接用em=gd3bj,要用IOp定义色散校正的参数
http://sobereva.com/210
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发表于 Post on 2022-8-21 20:33:53 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-8-21 19:27
TPSSh不能直接用em=gd3bj,要用IOp定义色散校正的参数
http://sobereva.com/210

啊好的谢谢老师!

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发表于 Post on 2022-8-21 20:35:34 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-8-21 09:04
要。过程很麻烦,见sob老师博文里提到的文章。所以首先查一下文献里是否有算好的。

好的,谢谢

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发表于 Post on 2022-8-21 21:32:10 | 只看该作者 Only view this author
各位老师我在用赝势算La的频率优化的时候出现读取不了基组的报错,请问可能是什么原因呢?下面是输入文件
%chk=C:\Users\lenovo\Desktop\123.chk
# freq ub3lyp/genecp
Title Card Required

3 0
La                 0.14056225    2.06827306    0.00000000

LA     0
LA-ECP     3     46
f POTENTIAL
  1
2      4.02860000          -36.01001600
s-f POTENTIAL
  3
2      3.30990000           91.93217700
2      1.65500000           -3.78876400
2      4.02860000           36.01001600
p-f POTENTIAL
  3
2      2.83680000           63.75948600
2      1.41840000           -0.64795800
2      4.02860000           36.01001600
d-f POTENTIAL
  3
2      2.02130000           36.11617300
2      1.01070000            0.21911400
2      4.02860000           36.01001600

202208212132053939..jpg (67.75 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

202208212132053939..jpg

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发表于 Post on 2022-8-22 08:42:03 | 只看该作者 Only view this author
KCM@SHU 发表于 2022-8-21 21:32
各位老师我在用赝势算La的频率优化的时候出现读取不了基组的报错,请问可能是什么原因呢?下面是输入文件
...

详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
http://sobereva.com/60

赝势定义不全,只有赝势定义没有赝势基组定义

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发表于 Post on 2022-8-22 13:49:59 | 只看该作者 Only view this author
各位老师我想问一下如果我要算离子在水溶液中的自由能的时候,离子与水的准确配位数我不知道,我可不可以通过加过多的显式的水配体,再加隐式的水溶剂进行计算,比如说k+离子的最优水配位数在6左右,现在我不知道k+的配位数是6,我用Gaussian给K+加上8个水配位,再加上隐式的水溶剂进行结构优化,单点能计算,他最后算出来的结果会不会把K+优化到6配位呢?,还是说他只能在我给出的构型基础上找到能量最优的点呢?

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