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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2016-6-21 17:32:46 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 liyuanhe211 于 2016-6-21 18:08 编辑

出错的原因是内存不够,200个原子,12核才给1G内存,无合理性,能给多少给多少。带着5/13=1报502显然和楼上给的 sobereva.com/61 里面的东西无关

这就是个有机体系,带几个Br,用M06干啥?

基组6-311+G(2d,2p)十分糟糕,Br用LanL08(d)、其他原子TZVP先试试,还承受不了就降到def2-SV(P)

scrf=pcm是默认的,其他阅读:
常见的多余的和被滥用的Gaussian关键词
http://sobereva.com/331

5/13=1 参见:http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=3344

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-21 18:09:06 | 只看该作者 Only view this author
浮云里的阳光 发表于 2016-6-21 15:42
sob老师,gaussian可以计算分子的光谱常数吗?比如        vibrational constant – first term ,vibrational con ...

转动常数做freq计算时直接就输出出来。
至于你说的各个term我不清楚,得看具体怎么定义的,从freq或freq=anharmonic的输出中应该能获得对应的
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发表于 Post on 2016-6-21 18:28:55 | 只看该作者 Only view this author

二面角扭转过渡态虚频

我是作反应机理新手,尝试做了个二面角扭转的反应,通过柔性扫描获得过渡态初猜,然后ts优化得到过渡态。
验证频率有且只有一个虚频,但虚频非常小,几十左右。
请教各位,虚频这么小,可以认为是过渡态吗?有跑irc的必要吗?谢谢

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发表于 Post on 2016-6-21 18:47:27 | 只看该作者 Only view this author
9成把握不是过渡态

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-21 18:51:36 | 只看该作者 Only view this author
nunup5 发表于 2016-6-21 18:28
我是作反应机理新手,尝试做了个二面角扭转的反应,通过柔性扫描获得过渡态初猜,然后ts优化得到过渡态。
...


既然你柔性扫描都算得动,做个IRC的计算量完全可以接受,一试就知道。
这么小的虚频一般就是柔性基团的转动过渡态。
这个称不上反应的过渡态,只不过是构象变化的过渡态而已
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发表于 Post on 2016-6-22 16:55:41 | 只看该作者 Only view this author

求助光学计算方面的一个重要理论参数,求助这个是怎么来的?




小弟不才,看到一个发光计算中,计算紫外可见光光谱的,是一个有机物的深度计算。
其图片如上,请各位高手和专家帮忙分析一下这个f和Ri表示了什么意思,是如何与高斯的计算结果相结合的?

好想学习,摸索了半天就是不懂,盼指导。







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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-22 18:56:13 | 只看该作者 Only view this author
iamlongwei 发表于 2016-6-22 16:55
小弟不才,看到一个发光计算中,计算紫外可见光光谱的,是一个有机物的深度计算。
其图片如上,请各 ...

f就是振子强度,R就是坐标变量
仔细看此文,里面都讲了
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314
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发表于 Post on 2016-6-23 08:55:42 | 只看该作者 Only view this author
          .--------------------.
          ----------------------|Geometry convergence|---------------------
          Item                value                 Tolerance   Converged
          -----------------------------------------------------------------
          Energy change      -0.00000138            0.00000500      YES
          RMS gradient        0.00007452            0.00010000      YES
          MAX gradient        0.00040498            0.00030000      NO
          RMS step            0.00014565            0.00200000      YES
          MAX step            0.00092772            0.00400000      YES
          ....................................................
          Max(Bonds)      0.0000      Max(Angles)    0.01
          Max(Dihed)        0.05      Max(Improp)    0.00
          -----------------------------------------------------------------

       The step convergence is overachieved with
       reasonable convergence on the gradient
       Convergence will therefore be signaled now
请教各位老师,上面这个结果能不能算成功收敛?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-24 03:41:38 | 只看该作者 Only view this author
dingliping1108 发表于 2016-6-23 08:55
.--------------------.
          ----------------------|Geometry convergence|------------ ...

基本算
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发表于 Post on 2016-6-24 10:34:28 | 只看该作者 Only view this author

g09B01/l301错误

请问  Atomic number out of range for 6-31G basis set.                                      Error termination via Lnk1e in /vol6/home/hn_zjl/software/Gaussion09/g09B01/l301.exe
这个错误怎么解决?谢谢!

这是输入及输出文件


管理员注:回复在1662L

P-bu3-OH-I.gjf

3.32 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

P-bu3-OH-I.zip

16.73 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

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发表于 Post on 2016-6-24 11:02:10 | 只看该作者 Only view this author

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2016-6-24 11:09:17 | 只看该作者 Only view this author
  1. #p opt Freq(noraman) b3pw91/6-31g(d,p) maxdisk=80GB  iop(1/8=10) scf=maxcycle=500
复制代码


6-31G(d,p)没有对碘定义,应用混合基组/赝势处理。

输入格式见:
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
http://sobereva.com/60

对照下文看写了哪些垃圾关键词:
常见的多余的和被滥用的Gaussian关键词
http://sobereva.com/331

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发表于 Post on 2016-6-29 09:38:15 | 只看该作者 Only view this author

S1态发射波长计算

请问算S1态的发射波长输入文件怎么写?我算出来的是吸收的,这是怎么回事啊?谢谢各位了!!!

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发表于 Post on 2016-6-29 09:57:22 | 只看该作者 Only view this author
优化激发态,然后得到的就是发射的波长

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-29 10:08:53 | 只看该作者 Only view this author
min 发表于 2016-6-29 09:38
请问算S1态的发射波长输入文件怎么写?我算出来的是吸收的,这是怎么回事啊?谢谢各位了!!!

看此文计算荧光的步骤
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
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