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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2022-11-9 08:44:59 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-11-8 20:55
对称性怎么写取决于你的C4H8双自由基的构象。分子属于C2v点群、C2h点群或者其他点群时,对称性相关的关键 ...

老师,之前我只涉及过电荷与自旋多重度0 1的情况,所以wf 第二个参数写的是单电子所在的轨道不可约表示;现在对这种有俩单电子的双自由基(两个双自由基分别是属于C1和C2h点群;),①请问这两种点群的双自由基第二个参数如何设置呢?,第二个参数我就有点迷惑;而且这俩双自由基在结构优化的时候我没有在gview设置允许点群对称性。②为了在out文件有不可约表示,我是不是要勾选再做一次结构优化?谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-9 12:38:17 | 只看该作者 Only view this author
KCM@SHU 发表于 2022-11-8 17:33
老师我想问一下虚拟机和双系统那个会好一点呢?

有专门跑计算的机子就装实体linux,需要兼顾windows下程序的使用就虚拟机
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-9 12:39:41 | 只看该作者 Only view this author
好兄弟 发表于 2022-11-8 16:04
各位老师好,我用shermo计算能量,将计算频率没有优化结构的高斯log文件作为输入,setting.ini中的校正没有 ...

看不懂你的描述
振动分析任务只计算一次电子能量,哪有第一次和最后一次之分
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发表于 Post on 2022-11-9 14:13:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-9 12:39
看不懂你的描述
振动分析任务只计算一次电子能量,哪有第一次和最后一次之分

嗯嗯我自己解决了,是我在一个提交文件中分成两次计算了所以输出了两次

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发表于 Post on 2022-11-9 14:32:22 | 只看该作者 Only view this author

求助高斯计算时混合溶剂如何定义

求助,高斯计算时,考虑溶剂化,溶剂为混合溶剂该如何描述?比如DMSO/DMF, v/v, 4/1的混合溶剂。

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发表于 Post on 2022-11-9 14:46:30 | 只看该作者 Only view this author
http://sobereva.com/327
1.5.2自定义溶剂和混合溶剂
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

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发表于 Post on 2022-11-9 15:03:21 | 只看该作者 Only view this author
请问我要计算磷光分子零场分裂能zfs是应该用基态结构还是激发态结构来计算?具体原因是什么呢?

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发表于 Post on 2022-11-9 15:21:02 | 只看该作者 Only view this author
好兄弟 发表于 2022-11-9 08:03
请问我要计算磷光分子零场分裂能zfs是应该用基态结构还是激发态结构来计算?具体原因是什么呢?

没有唯一答案,取决于你计算ZFS的目的。
例如,如果研究磷光或激发态EPR,又或者是RISC里面Boltzmann因子的贡献,应该用T1结构;如果为了研究SOC校正的吸收光谱,应该用S0结构。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-9 15:48:15 | 只看该作者 Only view this author
lizn 发表于 2022-11-9 14:32
求助,高斯计算时,考虑溶剂化,溶剂为混合溶剂该如何描述?比如DMSO/DMF, v/v, 4/1的混合溶剂。

看17046L
以后有什么问题都先用论坛首页google框搜索,如果找不到答案再问
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发表于 Post on 2022-11-9 16:47:50 | 只看该作者 Only view this author
C-TS-D-0805.gjf (3.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 2) ,老师们,这个基组怎么看,想在后面加Cd的宴势,gen是一个基组?

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发表于 Post on 2022-11-9 16:48:26 | 只看该作者 Only view this author
请教一下,辛苦各位老师

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发表于 Post on 2022-11-9 18:46:41 | 只看该作者 Only view this author
小翟w 发表于 2022-11-9 16:47
,老师们,这个基组怎么看,想在后面加Cd的宴势,gen是一个基组?

gen的意思是你另外定义基组。别用pseudo=read, 定义赝势和基组直接用genecp,
http://sobereva.com/60
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发表于 Post on 2022-11-9 18:56:14 | 只看该作者 Only view this author
老师好,我在用ORCA进行tddft SOC计算时,出现报错:

[file orca_tools/qcmem.cpp, line 998, Process 1]: OUT OF MEMORY ERROR!

[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 465]:
   . . . . absorting the run

我设置的内存数是24000MB(%maxcore 24000),机器内存是32G的,并且在运行ORCA时并未运行任何其他程序。
使用的泛函基组是 PBE0/def2-tzvp 和辅助基组def2/J 使用了RIJCOSX加速

之前用PBE0/TZVP 的组合,24000MB内存分配是正常运行的,但是换了def2-tzvp基组就出现了这种情况。请问这是基组的更换导致的吗?还是我其他设置可能出现错误呢?

微信截图_20221109185608.png (140.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

微信截图_20221109185608.png

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发表于 Post on 2022-11-9 19:56:48 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2022-11-9 11:56
老师好,我在用ORCA进行tddft SOC计算时,出现报错:

[file orca_tools/qcmem.cpp, line 998, Process 1 ...

maxcore指的是每个核最多允许用多少内存,不是总内存。
所以应该让maxcore*nprocs小于机器内存,光让maxcore小于机器内存是不够的,程序可能会误以为你的内存很大,结果实际计算才发现机器没有那么多内存,报错退出。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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发表于 Post on 2022-11-9 20:05:39 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-11-9 19:56
maxcore指的是每个核最多允许用多少内存,不是总内存。
所以应该让maxcore*nprocs小于机器内存,光让max ...

原来如此,感谢老师指导!

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