简单量子化学问题答疑专帖（旧版，已关帖）

小翟w · 发表于 Post on 2022-11-25 20:10:13

老师们，想请教一下，nbo时，想让他出来chk文件，我加了第一行关键词，出来成这样了，麻烦老师们指导一下！chk文件里的用图片截取了

chands · 发表于 Post on 2022-11-25 20:19:35

chk是二进制文件，打开是乱码。将chk转换成fchk（或fch）文件。

sobereva · 发表于 Post on 2022-11-25 20:28:04

小翟w 发表于 2022-11-25 20:10
老师们，想请教一下，nbo时，想让他出来chk文件，我加了第一行关键词，出来成这样了，麻烦老师们指导一下！ ...

跟NBO毫无联系
二进制文件显然不能用文本编辑器打开，而且打开它作甚

zqq19930303 · 发表于 Post on 2022-11-25 22:13:36

计算一个TADF小分子，使用PBE0/TZVP去优化三重态，得到T2态的能量低于T1态是什么原因？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-25 22:15:04

参见http://sobereva.com/468

KCM@SHU · 发表于 Post on 2022-11-26 11:50:01

本帖最后由 KCM@SHU 于 2022-11-26 11:52 编辑

我想请问一下各位老师有没有用Gaussian算过氧化石墨烯的结构优化呢？我想节选氧化石墨烯的一部分作为代表对其进行结构优化，但是算完之后发现他out文件显示的成键有点奇怪，所以想问一下各位老师是不是我建模有问题还是什么原因呢？我的输入输出文件在下面

graphene.rar (2.68 MB, 下载次数 Times of downloads: 2)

KCM@SHU · 发表于 Post on 2022-11-26 15:23:03

我想请问一下各位老师，比如说我在用opt+freq计算结构的时候，最开始我用的时PBE1PBE方法，然后优化成功后输出文件的summary里面显示的方法时upbe1pbe我想问一下像这种前面带u，r这些字母的具体是什么含义呢？如果我想进一步计算能量，那我是应该在结构优化得出的upbe1pbe这种方法下进行计算，还是用原来的pbe1pbe算呢？

chands · 发表于 Post on 2022-11-26 15:48:47

本帖最后由 chands 于 2022-11-26 15:50 编辑

KCM@SHU 发表于 2022-11-26 15:23
我想请问一下各位老师，比如说我在用opt+freq计算结构的时候，最开始我用的时PBE1PBE方法，然后优化成功后 ...

r=restricted，自旋向上和自旋向下的电子两两匹配，闭壳层的结构默认r
u=unrestricted，对电子两两匹配不作限制，开壳层的结构默认u
一般用默认的r或u（即不用设置），除非开壳层单重态这类结构（系统默认r，但是实际上是u，所以要指定u）。

Yjc · 发表于 Post on 2022-11-26 23:59:58

本帖最后由 Yjc 于 2022-11-27 00:27 编辑

请问各位老师，同一体系在同一级别下用不同电脑计算结果是一样的吗？
对于氨基甲酰烯酮体系的优化和振动分析，我尝试了很多遍，就是无法在同一计算级别下优化到与实验室其他同学的结果（我算出的能量比他高4KJ/mol）,而且振动分析中频率也有较大差异，请问这是什么原因？谢谢！注：我最后算出的各原子受力都是近似为零的。

sobereva · 发表于 Post on 2022-11-27 01:06:15

Yjc 发表于 2022-11-26 23:59
请问各位老师，同一体系在同一级别下用不同电脑计算结果是一样的吗？
对于氨基甲酰烯酮体系的优化和振动分 ...

看此文了解可能影响结果的各种因素
谈谈不同量子化学程序计算结果的差异问题
http://sobereva.com/573（http://bbs.keinsci.com/thread-20122-1-1.html）

sobereva · 发表于 Post on 2022-11-27 01:08:20

KCM@SHU 发表于 2022-11-26 11:50
我想请问一下各位老师有没有用Gaussian算过氧化石墨烯的结构优化呢？我想节选氧化石墨烯的一部分作为代表对 ...

边缘都没加氢，毫无意义
而且这么小一块根本代表不了氧化石墨烯。把下文看了
18碳环（cyclo[18]carbon）与石墨烯的相互作用：基于簇模型的研究一例
http://sobereva.com/615（http://bbs.keinsci.com/thread-25306-1-1.html）

以后别上传chk文件，对别人没意义，还白浪费服务器空间

bxpu · 发表于 Post on 2022-11-27 09:51:36

各位老师好，我想问一下我在写Molpro输入文件时，在CASSCF部分已经写了活性空间，请问在后面的RS2部分还需要写活性空间吗？

忘不掉的回忆 · 发表于 Post on 2022-11-27 11:47:14

各位老师好，想问一个问题。图1是我在网站上下载的环丁枫分子结构。图2是我优化完了之后的，优化完了为什么变成了三部分？
优化的关键词：# opt b3lyp/6-311g(d,p) em=gd3bj geom=connectivity

护卫天使 · 发表于 Post on 2022-11-27 13:23:35

老师好，我设置了两个片段作为初猜，在G09的计算结果如图，为什么片段二的电荷和多重度设定与输入文件不同？此外在G16计算，则是直接报错片段总电荷为4，而系统总电荷为2。该如何解决？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-27 16:31:25

忘不掉的回忆发表于 2022-11-27 04:47
各位老师好，想问一个问题。图1是我在网站上下载的环丁枫分子结构。图2是我优化完了之后的，优化完了为什么 ...

初始结构硫的键角错误。按化学常识重新画初猜结构，再算。不要轻信某些数据库里的三维分子结构，那些是用软件自动生成的、为了给人看的，达不到做计算的要求。

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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖（旧版，已关帖）

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三重态的能量