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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-7-28 21:42:46 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2015-7-28 21:32
谢谢老师
请问用什么关键词?pop(nbo)?
那个fch文件如何得到

用formchk将chk转换就得到了fch
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2015-7-28 21:54:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-7-28 21:42
用formchk将chk转换就得到了fch

我是说在计算前输入的关键词用什么?是不是
pop(nboread full)?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-7-29 09:17:36 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2015-7-28 21:54
我是说在计算前输入的关键词用什么?是不是
pop(nboread full)?

写上%chk就有了chk,一转换就有了fch,放到multiwfn里一算就有了你要的。非要用NBO作甚?
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发表于 Post on 2015-7-29 13:19:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-7-29 09:17
写上%chk就有了chk,一转换就有了fch,放到multiwfn里一算就有了你要的。非要用NBO作甚?

哦,懂了,就是直接把结构优化后的chk文件转换成fch文件,用multiwfn计算啊。
谢谢老师

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发表于 Post on 2015-8-1 21:59:14 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 fankui1990129 于 2015-8-1 22:36 编辑

sob老师您好,今天计算的时候出现了2066错误,直接连输出文件都没有办法生成。但是我的路径里都是纯英文啊,请问这是怎么回事呢?最诡异的地方是,我用同样的输入文件在别的计算机上计算就没事。


另外还有一个问题,我知道如何计算活化能,但是如何计算反应速率常数呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-8-2 01:22:09 | 只看该作者 Only view this author
fankui1990129 发表于 2015-8-1 21:59
sob老师您好,今天计算的时候出现了2066错误,直接连输出文件都没有办法生成。但是我的路径里都是纯英文啊 ...

光从你的第一个问题的描述我也看不出什么来

第二个问题见此文
使用KiSThelP结合Gaussian基于过渡态理论计算反应速率常数
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发表于 Post on 2015-8-2 18:37:26 | 只看该作者 Only view this author
fankui1990129 发表于 2015-8-1 21:59
sob老师您好,今天计算的时候出现了2066错误,直接连输出文件都没有办法生成。但是我的路径里都是纯英文啊 ...

给gaussian管理员权限、换一下输出路径,试一下

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发表于 Post on 2015-8-2 23:25:09 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-8-2 18:37
给gaussian管理员权限、换一下输出路径,试一下

谢谢!!

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发表于 Post on 2015-8-11 12:05:50 | 只看该作者 Only view this author
请问用不同的基组找到的过渡态有没有可能不同呢?

我用一个小的机组很顺利的找到了文献里猜想的过渡态。现在用大的基组和TS找,运行了很长时间了都没有结果。我想知道换了基组之后除了过渡态的能量有变化,其他的可能会变么?谢谢sob老师

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发表于 Post on 2015-8-11 21:07:50 | 只看该作者 Only view this author
今天我搭一个过渡态的时候,第一次搭建自旋多重读默认为1,第二次搭建方式一样,自旋多重读却变成了2。请问GView确定自旋多重读的依据是什么呢?为什么两次得到的不一样呢?

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发表于 Post on 2015-8-11 21:45:10 | 只看该作者 Only view this author
fankui1990129 发表于 2015-8-11 21:07
今天我搭一个过渡态的时候,第一次搭建自旋多重读默认为1,第二次搭建方式一样,自旋多重读却变成了2。请问 ...

因为你第一次和第二次的电荷不一样

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发表于 Post on 2015-8-11 22:29:52 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-8-11 21:45
因为你第一次和第二次的电荷不一样

一样的,我反复确认过的。要不然我也不会来提问的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-8-11 22:59:49 | 只看该作者 Only view this author
fankui1990129 发表于 2015-8-11 12:05
请问用不同的基组找到的过渡态有没有可能不同呢?

我用一个小的机组很顺利的找到了文献里猜想的过渡态。 ...


如果你之前用的是中等级别的基组,那么加大基组一般不至于导致过渡态结构、存在性出现差异。尤其是当过渡态势垒较大,这样的话过渡态是显著的,不会因为基组增大而找不到过渡态。
找不到多半还是搜索过程中数值问题导致的。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-8-11 23:02:17 | 只看该作者 Only view this author
fankui1990129 发表于 2015-8-11 21:07
今天我搭一个过渡态的时候,第一次搭建自旋多重读默认为1,第二次搭建方式一样,自旋多重读却变成了2。请问 ...


可能是第二次搭的时候多了或少了一个氢之类
反正各种元素的原子数相同,总电荷也相同,那么gview自动判断的自旋多重度肯定是一致的
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发表于 Post on 2015-8-11 23:26:56 | 只看该作者 Only view this author
fankui1990129 发表于 2015-8-11 22:29
一样的,我反复确认过的。要不然我也不会来提问的

那就是你结构不一样。
GaussView的默认多重度就是偶数个电子为Singlet,奇数个电子为Doublet

本版积分规则 Credits rule

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