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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-3-7 15:46:41 | 只看该作者 Only view this author
我先重新算一遍单点能再试试!

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发表于 Post on 2017-3-7 16:12:56 | 只看该作者 Only view this author
log正常结束了?
https://www.x-mol.com/groups/fan_jianzhong

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发表于 Post on 2017-3-7 22:12:42 | 只看该作者 Only view this author
已经看过sob老师关于过渡态搜索方法的描述,感觉对过渡态搜索的算法理解不深,比如什么是置信区间。不知道有没有必要好好研究一下相关的数学方法?但是找了半天,没有相关资料,老师能不能发布一点关于Newton-raphson,augmented hessian等相关方法的数学知识。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-8 10:52:36 | 只看该作者 Only view this author
lily19830130 发表于 2017-3-7 22:12
已经看过sob老师关于过渡态搜索方法的描述,感觉对过渡态搜索的算法理解不深,比如什么是置信区间。不知道 ...

过渡态、反应路径的计算方法及相关问题
http://sobereva.com/44
这里面已经说得很充分了,如果还想从数学上了解更多,看
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=105
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-3-8 11:43:19 | 只看该作者 Only view this author

为什么fch 文件和log文件的 HOMOLUMO只是不一样的 

本帖最后由 zhangyina 于 2017-3-8 14:40 编辑

[img]file:///C:\Users\Administrator\AppData\Roaming\Tencent\Users\971019579\QQ\WinTemp\RichOle\A5P@R}2JHD5YUQ[XX@JL44Q.png[/img][img=0,1]file:///C:\Users\Administrator\AppData\Roaming\Tencent\Users\971019579\QQ\WinTemp\RichOle\A5P@R}2JHD5YUQ[XX@JL44Q.png[/img]为什么fch   文件和log文件的 HOMOLUMO值是不一样的  
log文件

fch文件


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-8 11:49:54 | 只看该作者 Only view this author
zhangyina 发表于 2017-3-8 11:43
为什么fch   文件和log文件的 HOMOLUMO只是不一样的  
log文件

“只是不一样的”病句
同一个任务产生的fch文件和log文件里的轨道能量一定相同。不相同肯定是哪搞错了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-3-8 13:57:40 | 只看该作者 Only view this author

log正常结束了!

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发表于 Post on 2017-3-8 13:59:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-7 15:37
重新算一遍单点之后再转换再试

Sob老师,我按照您的建议重新计算了一遍单点能计算,然后转化时还是出现之前的错误,不知该怎么办?

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发表于 Post on 2017-3-8 14:45:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-8 11:49
“只是不一样的”病句
同一个任务产生的fch文件和log文件里的轨道能量一定相同。不相同肯定是哪搞错了

是先生成的log文件 ,然后通过高斯在相同基组下生成的fch  文件,我也不知道是哪里出问题了。那么当两个值不一样时,哪个是准确的?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-8 16:47:18 | 只看该作者 Only view this author
darknesseye 发表于 2017-3-8 13:59
Sob老师,我按照您的建议重新计算了一遍单点能计算,然后转化时还是出现之前的错误,不知该怎么办?

计算前,确定之前的chk已经删掉了
并且确定freqchk和计算时是同一个机子里的高斯
如果以上都确认了,换个高斯版本再试
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-8 16:48:07 | 只看该作者 Only view this author
zhangyina 发表于 2017-3-8 14:45
是先生成的log文件 ,然后通过高斯在相同基组下生成的fch  文件,我也不知道是哪里出问题了。那 ...

不一样绝对是你数值没找对。直接把输出文件和fch文件压缩后传上来
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发表于 Post on 2017-3-8 17:05:05 | 只看该作者 Only view this author
麻烦你帮我看看   谢谢老师。

ppe.zip

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zhangyina 发表于 2017-3-8 17:05
麻烦你帮我看看   谢谢老师。

别用其它关键词,尤其5/13=1绝对不能用,这里强调了
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

就直接做个单点任务,别用任何其它多余的关键词,直接对比.fch和.log,能量绝对一样
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发表于 Post on 2017-3-8 20:21:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-8 18:47
别用其它关键词,尤其5/13=1绝对不能用,这里强调了
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61
...

是优化后做个单点吗?    是在优化时关键词 只写  opt  b3lyp/6-31g*? 然后对优化后的结构 做单点   再由单点的log  文件生成 fch      然后  对比log和fch 的结果吗?  老师 我这样理解对吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-8 21:34:41 | 只看该作者 Only view this author
zhangyina 发表于 2017-3-8 20:21
是优化后做个单点吗?    是在优化时关键词 只写  opt  b3lyp/6-31g*? 然后对优化后的结构 做单点   再 ...


gview载入你优化完的结构,保存成新的gjf文件,里面就写一个B3LYP/6-31G*,其它都甭写,然后对比fch和log里的轨道能
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