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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-10 18:59:31 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2017-3-10 16:48
sob老师,gaussian09手册里的有些关键词的解释自己理解不清楚,不知道有没有例子?比如,下图中modredundan ...


没必要用这个
关注计算化学公社和思想家公社群里别人的讨论。另外在科音的量化培训班里凡是有用的关键词也都会详细讲
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-3-10 19:51:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-10 11:11
拖到gview里看,要么文本编辑器自行打开看里面的信息
显然是分子振动频率

谢谢老师

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发表于 Post on 2017-3-10 22:21:18 | 只看该作者 Only view this author

扫描设置变量参数时为什么会出错?

请问这个输入文件哪里出错了?为什么老是报错?

2.gjf

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2.log

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-10 23:17:24 | 只看该作者 Only view this author
1215052330 发表于 2017-3-10 22:21
请问这个输入文件哪里出错了?为什么老是报错?

定义扫描的步数和步长要写在第一次定义B3的位置,不要单独在后面空一行来定义
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发表于 Post on 2017-3-11 09:01:16 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢老师。

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发表于 Post on 2017-3-11 09:02:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-10 23:17
定义扫描的步数和步长要写在第一次定义B3的位置,不要单独在后面空一行来定义

好的,谢谢老师。

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发表于 Post on 2017-3-11 16:25:47 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 erya123 于 2017-3-11 16:42 编辑

从checkpoint file文件中读取一些信息时,比如guess=read,opt=ReadFC的时候怎么确定这个checkpoint file是哪个?怎么添加这个chk文件?我查了网上的资料,好像上面都不需要指定这个checkpoint file,例如:
%NProc=1%Mem=32MW%Chk=dmf_min.chk# HF/6-31G(d) Freq=NoRaman Guess=Check Geom=Check

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-11 18:33:15 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2017-3-11 16:25
从checkpoint file文件中读取一些信息时,比如guess=read,opt=ReadFC的时候怎么确定这个checkpoint file是 ...


%chk写哪个就从哪个文件里读取信息
别信网上乱七八糟资料(除了本论坛、思想家公社QQ群和我的blog以外),否则只会被坑
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发表于 Post on 2017-3-12 10:08:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-11 18:33
%chk写哪个就从哪个文件里读取信息
别信网上乱七八糟资料(除了本论坛、思想家公社QQ群和我的blog以外 ...

老师,如果是%chk是哪个就写那个,是不是新提交的计算生产的chk文件内容就补充在%chk文件后面?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-12 12:49:15 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2017-3-12 10:08
老师,如果是%chk是哪个就写那个,是不是新提交的计算生产的chk文件内容就补充在%chk文件后面?

你若要从老的chk里读取信息,必须用%chk或%oldchk来指定那个chk在哪里
新的计算会创建或改写%chk指定的chk文件
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发表于 Post on 2017-3-12 13:54:28 | 只看该作者 Only view this author
再请教老师一个计算操作问题:
图中计算文件最后一句命令:(1 14 0.8 S 30 0.1)是将1号碳原子和14号氢原子的键长从0.8开始,步长0.1,步数30,最终得到31帧,这样的结果就是得到了“固定两原子键长,同时其余坐标优化的文件了”对吧?
请老师指教!谢谢!

2017-03-12_120348.jpg (80.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

2017-03-12_120348.jpg

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-12 14:49:11 | 只看该作者 Only view this author
clvn 发表于 2017-3-12 13:54
再请教老师一个计算操作问题:
图中计算文件最后一句命令:(1 14 0.8 S 30 0.1)是将1号碳原子和14号氢原 ...

是。
注意g09后期版本已经不允许直接定义初值了,初值直接就是输入坐标里的
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发表于 Post on 2017-3-12 14:55:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-12 14:49
是。
注意g09后期版本已经不允许直接定义初值了,初值直接就是输入坐标里的

再请老师看一个问题,下图是我计算opt=modredundant时出的错,没有报错,但是没有出现很多帧,请问是老师说的初值问题吗?是的话应该怎么解决呢?(上传的是输入文件和输出文件)

c6h12-bh-30.gjf

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c6h12-bh-30.log

188.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-12 15:06:13 | 只看该作者 Only view this author
clvn 发表于 2017-3-12 14:55
再请老师看一个问题,下图是我计算opt=modredundant时出的错,没有报错,但是没有出现很多帧,请问是老师 ...

就是初值问题
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发表于 Post on 2017-3-12 15:15:33 | 只看该作者 Only view this author

很诡异的是,之前我用同一台机器算出来,有很多帧,只是算法和基组不同
那请教老师应该怎么修改我的输入文件呢?

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