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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-3-15 04:27:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-13 20:38
“原子的电子密度”这种说法就不对
看本帖3170L,以及此文第6节
《量子化学中的一些常见不良写法和用词 ...

老师您好:
我其实是想比较金属在配体交换后的亲核能力对比,老师就提出了电子密度这一看法。
所以想问社长这个问题应该怎样计算?

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发表于 Post on 2017-3-15 09:59:56 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wrtgcn 于 2017-3-15 13:40 编辑

sob老师,我最近看到一个“调整初猜轨道占据方式”的概念,想问您一下:
1.电子态与波函数的态有相关性(一致性)吗?
2.用stable可否检验电子态是否基态?
3.是否总是需要在计算前用guess=only对轨道合理性进行判断?(感觉这个的可行性似乎不是太强)
麻烦您了!
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-15 13:01:00 | 只看该作者 Only view this author
misaki 发表于 2017-3-15 04:27
老师您好:
我其实是想比较金属在配体交换后的亲核能力对比,老师就提出了电子密度这一看法。
所以想问 ...

计算原子电荷
不知道什么是原子电荷的话看《原子电荷计算方法的对比》(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-3-16 03:21:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-15 13:01
计算原子电荷
不知道什么是原子电荷的话看《原子电荷计算方法的对比》(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/ ...

我的体系比较大,而且主要是关于金属的原子电荷,看文章没有做金属方法的比较。
社长能不能推荐下计算方法?

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发表于 Post on 2017-3-16 16:34:41 | 只看该作者 Only view this author
向大家请教一个简单问题:读文献的时候看到“the order of stability for CeO2(111) and (110) surfaces is protonated surfaces >stoichiometric surfaces > hydroxylated surfaces”这样一句,请问其中stoichiometric surfaces是什么表面...难道就是字面意思上的化学计量表面吗,这是什么意思啊...
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发表于 Post on 2017-3-16 17:59:53 | 只看该作者 Only view this author

关于GASS计算优化的问题

之前优化一直出现虚频或9999错误,读了sob老师的这篇文章,http://sobereva.com/278,加了如下红框的关键词,之后虚频消除,正常结束,就想问下加上int=ultrafine和不加对最后的能量有影响吗? 因为我要用不同的方法和基组进行结合能对比,其他方法没加int=ultrafine,无虚频计算出了结合能,和这个加了的计算结合能会不会进行比较有什么影响?谢谢!



G)K]LR_]QNI@W1G%CRMOJ11.png (28.87 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)

输入坐标

输入坐标

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发表于 Post on 2017-3-16 22:07:19 | 只看该作者 Only view this author

锕系元素计算

有谁对锕系元素计算的比较多的啊?研究过自由基对锕系元素水解的影响没?优化总是不收敛呢,求经验

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-16 23:22:02 | 只看该作者 Only view this author
misaki 发表于 2017-3-16 03:21
我的体系比较大,而且主要是关于金属的原子电荷,看文章没有做金属方法的比较。
社长能不能推荐下计算方 ...

NPA或ADCH
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-16 23:32:18 | 只看该作者 Only view this author
jiangxia0909 发表于 2017-3-16 22:07
有谁对锕系元素计算的比较多的啊?研究过自由基对锕系元素水解的影响没?优化总是不收敛呢,求经验

有具体问题直接问,看置顶的新人必读,勿用“有人XXX”的句式
对这种体系优化并没有什么特殊性
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-16 23:40:32 | 只看该作者 Only view this author
SuHe 发表于 2017-3-16 17:59
之前优化一直出现虚频或9999错误,读了sob老师的这篇文章,http://sobereva.com/278,加了如下红框的关键词 ...

对能量有影响
对能量横向对比的时候,如果一个用了ultrafine,其它就都得用
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发表于 Post on 2017-3-17 03:51:08 | 只看该作者 Only view this author
请问四个原子torsion的one fold/two fold/three fold是什么意思?在crystal maker中直接测量出来的是哪一个呢?谢谢!

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发表于 Post on 2017-3-17 08:46:43 | 只看该作者 Only view this author

out文件是否还能调节坐标轴

请问大家,opt和freq的out文件是否还能调节坐标轴 若能 该怎么调节

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发表于 Post on 2017-3-17 10:27:24 | 只看该作者 Only view this author
看不懂什么意思。。。

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发表于 Post on 2017-3-17 14:05:02 | 只看该作者 Only view this author
(1)首先应该指明是什么软件的out文件(不过看你的描述,应该是Gaussian的out或log文件);(2)调节坐标轴干嘛,反正坐标轴用不到,而且也不会自动显示出来;(3)就算真的要调坐标轴,取出直角坐标,写个小程序随便怎么平移旋转都可以啊···

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自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2017-3-17 17:26:18 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 hzfish 于 2017-3-17 17:29 编辑

如IR图,请问摩尔吸收系数单位(L/mol/cm)和IR活性单位(km/mol)之间有没有换算关系?
谢谢!

IR.png (136.58 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

IR

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