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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2015-11-8 14:12:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-6 18:02
如提示所示,你得定义epsinf

哦,到了这个计算的时候就需要这个参数了,好的,我查一下,谢谢老师

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发表于 Post on 2015-11-8 14:21:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-6 18:02
如提示所示,你得定义epsinf

sob老师,我之前看您的帖子,可以近似认为eps=epsinf,对于乙二胺溶剂,我是否可以都设定为
Eps=  13.8200, EpsInf=  13.82?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-8 15:51:28 | 只看该作者 Only view this author
哈哈宝 发表于 2015-11-8 14:21
sob老师,我之前看您的帖子,可以近似认为eps=epsinf,对于乙二胺溶剂,我是否可以都设定为
Eps=  13.8 ...


不能。乙二胺是有极性的溶剂,这个近似不奏效。

但是虽然NMR计算需要提供epsinf,计算结果并不受其影响,你可以随便设个值。

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2015-11-9 09:38:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-8 15:51
不能。乙二胺是有极性的溶剂,这个近似不奏效。

但是虽然NMR计算需要提供epsinf,计算结果并不受其 ...

每次Sob老师都很快的回复,真是太感动,也太感激了!

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发表于 Post on 2015-11-9 13:54:34 | 只看该作者 Only view this author

gaussian09中MP2优化出错

用gaussian09中的MP2进行优化时,出现下面的错误,请问如何解决呢?谢谢
E(PUHF)=      -0.65054858921D+03        E(PMP2)=      -0.65168093021D+03
ANorm=    0.1162742682D+01
E2 =    -0.1132352046D+01 EUMP2 =    -0.65168091795023D+03
Erroneous write. Write -1 instead of 320032.
fd = 5
orig len = 320032 left = 320032
g_write





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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-9 13:59:49 | 只看该作者 Only view this author
lianghua飘 发表于 2015-11-9 13:54
用gaussian09中的MP2进行优化时,出现下面的错误,请问如何解决呢?谢谢
E(PUHF)=      -0.65054858921D+03 ...

硬盘剩余空间不足,rwf文件写着写着发现没地方了。
MP2在优化时若无特殊必要别用,精度比合适的DFT泛函没任何优势,计算量和对资源消耗量还大得多。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2015-11-9 14:05:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-9 13:59
硬盘剩余空间不足,rwf文件写着写着发现没地方了。
MP2在优化时若无特殊必要别用,精度比合适的DFT泛函 ...

感谢sob迅速有力的回复,非常感谢

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发表于 Post on 2015-11-10 09:57:57 | 只看该作者 Only view this author
向各位高手求助,
LMO和NLMO是不是同一个概念?
我做NLMO,用已经优化好的结构,使用pop=saveNLMOs命令,开始计算,但是不能正常结束,为什么最高占据NBO不在NBO list里面呢?
log文件显示如下:
NATURAL LOCALIZED MOLECULAR ORBITAL (NLMO) ANALYSIS:
  Highest occupied NBOs are not at the beginning of the NBO list;
The NLMO program is not currently set up to handle this.
Illegal range for read:  IUnit=  7 Address=      -256 Length=            -256 File length=        17078784.
Error termination in NtrErr:
NtrErr called from NtrIO.

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-10 13:57:54 | 只看该作者 Only view this author
哈哈宝 发表于 2015-11-10 09:57
向各位高手求助,
LMO和NLMO是不是同一个概念?
我做NLMO,用已经优化好的结构,使用pop=saveNLMOs命令, ...

NLMO是LMO的一种。
这是NBO3.1的局限性,你得调整输入文件里的原子顺序,使得找出来的占据数高的NBO在NBO列表前头。或者用NBO更新版本产生NLMO。
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发表于 Post on 2015-11-11 01:51:48 | 只看该作者 Only view this author
SOB老师您好,我试图用multiwfn 计算激发态间的transition dipole moment,用的是cam-b3lyp泛函和6-311+g(d)基组算双分子电子转移。 得到的结果,相同激发态之间的transition dipole moment和gaussian density=rhoci 的结果是一致的,可是和density=current 的结果相差太大了。 所以我想知道这两个关键词有什么区别?我大致查了一下,rhoci的结果应该就是对波函数直接积分得到电子密度,而您说density=current 是弛豫之后的密度,这个“弛豫”是什么的弛豫呢?谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-11 03:26:57 | 只看该作者 Only view this author
wbn 发表于 2015-11-11 01:51
SOB老师您好,我试图用multiwfn 计算激发态间的transition dipole moment,用的是cam-b3lyp泛函和6-311+g(d ...


没弄明白你到底算的是什么。
相同激发态之间是什么意思?既然算跃迁偶极矩,应该算两个不同态之间的。
而且density=rhoci这个和计算激发态之间的跃迁偶极矩没有直接关系啊。仅当你考察某一个激发态密度的时候density=rhoci和density=current才是不同的。
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发表于 Post on 2015-11-11 03:53:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-11 03:26
没弄明白你到底算的是什么。
相同激发态之间是什么意思?既然算跃迁偶极矩,应该算两个不同态之间的。 ...

谢谢回复!抱歉,语文不好没有表述清楚。我想得到的是transition dipole moment, 不过multiwfn 也输出了所有激发态本身的偶极距。由于这个结果和density=current得到的相差太大,我不太理解其中的原因,有点担心这是不是会影响transition dipole moment的计算?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-11 04:01:31 | 只看该作者 Only view this author
wbn 发表于 2015-11-11 03:53
谢谢回复!抱歉,语文不好没有表述清楚。我想得到的是transition dipole moment, 不过multiwfn 也输出了 ...

Multiwfn产生的跃迁偶极矩和每个激发态的偶极矩是基于输出文件里的组态系数和基态轨道获得的,激发态偶极矩和density=rhoci是一致的。density=current默认情况下用的是弛豫的密度,这会通过Z-vector方法多做一步,虽然较耗时,但会使得激发态偶极矩更精确。你可以把rhoci对应的激发态密度当成是实际激发态密度的一阶近似,是激发的瞬间激发态的密度,但之后马上密度分布又会自发地调节。
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发表于 Post on 2015-11-11 04:49:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-11 04:01
Multiwfn产生的跃迁偶极矩和每个激发态的偶极矩是基于输出文件里的组态系数和基态轨道获得的,激发态偶极 ...

明白了。谢谢SOB老师

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发表于 Post on 2015-11-11 08:26:46 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 小书童 于 2015-11-11 15:55 编辑

用高斯算Hg S C H O 这几个元素的反应,做结构优化 频率分析    和能量计算  用什么方法和基组合适呢?麻烦老师了!

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