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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-6 11:23:49 | 只看该作者 Only view this author
14xlliu 发表于 2015-11-5 22:23
用优化好T1态做激发,哪个态才是T1到S0的呢(假设是第一个激发态,那后面那些激发态对应的是什么呢),另外 ...


这个问题很奇怪。当前情况,S0是基态,T1是激发态,既然是激发,应该是S0->T1,怎么会反过来?不明白你的情况。“假设是第一个激发态”这句话无法理解,S0这里的0就是代表这个态是基态,怎么成了激发态?
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-6 11:33:28 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2015-11-6 08:58
计算单独一个金属原子的焓值,计算了单点能Eele,然后OPT+Freq计算,焓值修正加Eele得到了H焓值。计算中发 ...

基础一团糟,要好好看看仔细深入理解这两篇http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=123

热力学校正是由平动、转动、振动贡献的,平动、转动都没有ZPE,振动才有ZPE,单个原子哪有振动?显然没有ZPE。

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发表于 Post on 2015-11-6 12:37:08 | 只看该作者 Only view this author
请问一下,如何把log文件变成out文件?我一直使用MAC版的高斯,没用过out文件,谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-6 15:25:33 | 只看该作者 Only view this author
一只耳 发表于 2015-11-6 12:37
请问一下,如何把log文件变成out文件?我一直使用MAC版的高斯,没用过out文件,谢谢

一码事,改个后缀就行了。
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发表于 Post on 2015-11-6 16:45:50 | 只看该作者 Only view this author
我不用溶剂对开壳层稀土阴离子团簇做了基态优化,想对体系中一个非平面环进行NICS的计算,不加溶剂的时候,一切OK,但是加了溶剂之后(CPCM模型,eps=13.82)就无法正常结束,提示我:
**** Warning!!: The largest alpha MO coefficient is  0.30204407D+03
**** Warning!!: The smallest alpha delta epsilon is  0.88447585D-01
**** Warning!!: The largest beta MO coefficient is  0.30099143D+03
**** Warning!!: The smallest beta delta epsilon is  0.91819897D-01
Leave Link  801 at Fri Nov  6 19:09:46 2015, MaxMem= 1048576000 cpu:       0.3
(Enter /software/gs09/g09/l1002.exe)
Minotr:  UHF open shell wavefunction.
NEqPCM:  Using equilibrium solvation (IEInf=0, Eps=  13.8200, EpsInf=   0.0000)
EpsInf not defined for this solvent.
我该怎么办呢?不加入溶剂效应的话,这个NICS(1)—zz可信么?求各位高手指教,谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-6 18:02:49 | 只看该作者 Only view this author
哈哈宝 发表于 2015-11-6 16:45
我不用溶剂对开壳层稀土阴离子团簇做了基态优化,想对体系中一个非平面环进行NICS的计算,不加溶剂的时候, ...

如提示所示,你得定义epsinf
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发表于 Post on 2015-11-6 21:42:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-6 11:33
基础一团糟,要好好看看仔细深入理解这两篇http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=123

...

懂了,谢谢老师

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发表于 Post on 2015-11-6 23:14:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-6 11:23
这个问题很奇怪。当前情况,S0是基态,T1是激发态,既然是激发,应该是S0->T1,怎么会反过来?不明白你 ...

就是SO—TN的激发过程完成后,优化T1态,不是还有基于T1态做T1到SO的跃迁计算吗?然后计算结果就会有Excited1,2,3之类和相对应激发态下轨道跃迁78A-79A之类的输出。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-6 23:20:15 | 只看该作者 Only view this author
14xlliu 发表于 2015-11-6 23:14
就是SO—TN的激发过程完成后,优化T1态,不是还有基于T1态做T1到SO的跃迁计算吗?然后计算结果就会有Exci ...


“T1到SO的跃迁计算”是怎么回事?如果你的符号没用错,S0的0就代表基态是单重态,T1的1代表这是第一激发三重态。此时你做TDDFT计算肯定基态是0 1用闭壳层算,这个时候程序不会单独按照自旋轨道来输出跃迁的。
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发表于 Post on 2015-11-7 10:20:29 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,我一个输入卡看上木有问题,捣鼓了一个上午了还木有搞定,投作业都是秒杀,能否帮我看看?

yu-Co.gjf

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发表于 Post on 2015-11-7 10:22:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-6 23:20
“T1到SO的跃迁计算”是怎么回事?如果你的符号没用错,S0的0就代表基态是单重态,T1的1代表这是第一激 ...

计算的目的是想得到T1到S0的过程(磷光发射过程),不知这样的做法对不对(或者说做了SO到TN的过程就没有必要又做T1到S0的过程),对于结果也很疑惑。

1.png (19.72 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

S0-TN计算

S0-TN计算

2.png (7.21 KB, 下载次数 Times of downloads: 18)

SO-TN计算的某个结果表示,优化T1态(用UPBE0方法优化,多重度为3),

SO-TN计算的某个结果表示,优化T1态(用UPBE0方法优化,多重度为3),

3.png (19.81 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

同样的方法基于优化的T1态做激发,多重度为1

同样的方法基于优化的T1态做激发,多重度为1

~OCQB2]R~WQTF4[LD$JV]}3.png (19.1 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)

基于T1计算的某个结果

基于T1计算的某个结果

6~BZNP%DS0YP%PA3~@Q3C45.png (1.92 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

轨道图

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发表于 Post on 2015-11-7 10:49:50 | 只看该作者 Only view this author

oniom能量计算

我的输入文件是:
%chk=HMimBr-oniom-ts1-4.chk
%nprocshared=16
%mem=100MW
#p opt=(calcfc,quadmac,ts,maxcycle=1000,noeigentest) freq(noraman) oniom(b3lyp/6-31g:uff)=embedcharge

现在要统计能量,怎么看能量?ONIOM: extrapolated energy =   -5868.304777630162这个能量就是总的能量吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-7 14:27:55 | 只看该作者 Only view this author
那年·时光飞 发表于 2015-11-7 10:49
我的输入文件是:
%chk=HMimBr-oniom-ts1-4.chk
%nprocshared=16

就是这个能量
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-7 14:47:45 | 只看该作者 Only view this author
vangogh 发表于 2015-11-7 10:20
Sob老师,我一个输入卡看上木有问题,捣鼓了一个上午了还木有搞定,投作业都是秒杀,能否帮我看看?


当前奇数个电子,肯定自旋多重度不为1
而且你自定义基组的时候没给氧设定基组
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14xlliu 发表于 2015-11-7 10:22
计算的目的是想得到T1到S0的过程(磷光发射过程),不知这样的做法对不对(或者说做了SO到TN的过程就没有 ...


3.png在计算的时候,别写guess=read

还有,万恶的5/13=1绝对不要写!!!!!!!!!!!!!!!
maxcyc这那么大没有丝毫意义
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