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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2015-11-11 08:31:13 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 哈哈宝 于 2015-11-11 10:11 编辑
sobereva 发表于 2015-11-10 13:57
NLMO是LMO的一种。
这是NBO3.1的局限性,你得调整输入文件里的原子顺序,使得找出来的占据数高的NBO在NB ...

谢谢老师,我试着用nboread,然后将*.37放到Multiwfn,按照您“使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道”中的方法试了试。可是界面显示File not found, input again,这是怎么回事呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-11 17:50:47 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2015-11-11 08:26
用高斯算Hg S C H O 这几个元素的反应,做结构优化 频率分析    和能量计算  用什么方法和基组合适呢?麻烦 ...

看要求
一般精度,Hg用Lanl2DZ,其它用6-31G*就够
要好点结果,Hg用Lanl2TZ或SDD,其它用6-311G**或稍好一点的TZVP。

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发表于 Post on 2015-11-11 19:51:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-11 17:50
看要求
一般精度,Hg用Lanl2DZ,其它用6-31G*就够
要好点结果,Hg用Lanl2TZ或SDD,其它用6-311G**或稍 ...

哦哦,老师您说的TZVP这个基组哪里有讲解呢?我想了解一下,看到很多文章中用到了,谢谢您了!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-11 19:56:27 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2015-11-11 19:51
哦哦,老师您说的TZVP这个基组哪里有讲解呢?我想了解一下,看到很多文章中用到了,谢谢您了!

原文JCP, 100, 5829
比6-311G**略大一丁点,但好得多

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发表于 Post on 2015-11-11 20:01:26 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 小书童 于 2015-11-11 20:05 编辑
sobereva 发表于 2015-11-11 19:56
原文JCP, 100, 5829
比6-311G**略大一丁点,但好得多

谢谢老师,老师有对于什么原子推荐什么基组这类应用型的文章吗?我不是化学的学生,看着有点头大,重点想应用,用准了即可。老师能推荐一下吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-11 20:08:02 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2015-11-11 20:01
谢谢老师,老师有对于什么原子推荐什么基组这类应用型的文章吗?我不是化学的学生,看着有点头 ...

没有那些什么文章
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发表于 Post on 2015-11-11 20:44:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-11 20:08
没有那些什么文章

哦哦,那老师您有这方面的总结吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-11 21:28:47 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2015-11-11 20:44
哦哦,那老师您有这方面的总结吗?

参加过8月份培训么?讲义上基组部分都介绍了
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发表于 Post on 2015-11-11 21:42:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-11 21:28
参加过8月份培训么?讲义上基组部分都介绍了

没参加八月份,师兄参加的是春季的,我有春季的讲义

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-12 03:11:57 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2015-11-11 21:42
没参加八月份,师兄参加的是春季的,我有春季的讲义

这些零零碎碎的东西不会写博文来总结的,都是放到培训班的时候一起讲
对于前四周期TZVP都能用,对于DFT属于中高质量基组,对于后HF属于中等质量基组。

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发表于 Post on 2015-11-12 06:05:15 | 只看该作者 Only view this author
SOB老师您好,和我的上一个问题相关,我想考察双分子间的光致电子转移,我的电子供体是一个阴离子dicyanamide, 受体是9,10-dicyanoanthracene, 构型通过md得到。我的目的是通过generalized Mulliken-Hush 方法计算electron coupling,需要计算transition dipole moments between excited states 和 electric dipole moment at ground and excited states. 我先在已经能通过g09 和multiwfn得到各个结果,通过visualize MO 和 electron -hole 以及计算 Delta_r 也能判断CT 和LE 态,但是还有几个小问题:
1. 因为我还是没经验,您能帮我看一下我的方法靠谱吗?有点害怕做错: # cam-b3lyp/6-311+g(d) td=(nstates=5,singlets,root=1) density=current
2. 我知道在有diffuse function的情况下Mulliken 布居的电荷切割会出现问题,但是 Mulliken 电荷算出的dipole moment 还靠谱吗?另外,我将供体上的Mulliken 电荷相加,发现CT态比LE态供体减少了0.9 个电子,我可不可以说这说明大致转移了0.9个电子?
3. 我还用了 INDO/S方法来算一下,输入是 # zindo=(nstates=5,singlets,root=1,AllTransitionDensities),我想问一下这个体系 INDO/S 方法误差大不大?
另外,ZINDO/S 有没有办法得到激发态的电偶极距?gaussian 对这个方法拒绝density关键词,我用mulitwfn 分析Mulliken电荷,结果是体系有五十几个负电荷。是不是ZINDO/S 方法没办法进行激发态的布居计算啊?


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发表于 Post on 2015-11-12 08:39:10 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lp2014 于 2015-11-12 09:03 编辑

请教一个问题,用PBE0优化分子结构,HOMO,LUMO能级相对而言更接近实验值(HOMO相差0.03-0.46 eV)(用B3LYP优化HOMO相差0.25-0.65),而用B3LYP优化分子结构HF值更负(更负3Hartree),分子更稳定,在这种情况下该用哪种方法优化结构进行接下来的计算更合理呢?谢谢

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发表于 Post on 2015-11-12 15:33:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-6 11:21
你可以对取代前后的状态对那个键的区域作密度差图,看看往哪边极化了。当然,用的结构必须相同否则无法作 ...

sob老师,请问可以利用LOL填色图和等值图来分析诱导效应对某个化学键例如O-H键的影响么?如果在O的另一侧存在吸电子基团,O原子和H原子中间的高定域区域是不是应该更偏向O原子一侧?谢谢!

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发表于 Post on 2015-11-12 16:37:54 | 只看该作者 Only view this author
高斯计算,不同基组和方法对气体的HOMO和LUMO得到的结算结果一样吗?不一样会差很多吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-12 18:50:32 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2015-11-12 16:37
高斯计算,不同基组和方法对气体的HOMO和LUMO得到的结算结果一样吗?不一样会差很多吗?

不一样,可能差不少
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