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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-6-27 09:20:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-6-26 22:27
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379
仔细看里面关于chk转 ...

谢谢老师 我看一下

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发表于 Post on 2017-6-27 09:20:36 | 只看该作者 Only view this author
Frank 发表于 2017-6-26 19:01
如果是Linux中计算得到的.chk要在Linux上转

确实是这个问题 已经解决了  谢谢

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发表于 Post on 2017-6-27 09:20:58 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-6-26 09:41
什么机器、什么版本Gaussian用什么Formchk。
确认上一点的话重新算一遍单点再产生一次chk

好的 试一试

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发表于 Post on 2017-6-27 16:00:35 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好!能不能打扰您一下,self interaction correction是什么?b3lyp,m06含有这个校正吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-27 17:54:15 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2017-6-27 16:00
sob老师您好!能不能打扰您一下,self interaction correction是什么?b3lyp,m06含有这个校正吗?


随便找本像样的介绍DFT的书都会讲,比如A Chemist's Guide to Density Functional Theory 2ed里搜self-interaction
b3lyp,m06等没有SIC
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-6-27 19:42:18 | 只看该作者 Only view this author
sob老师 请教两个问题:

1 几何优化的收敛限 RMS gradient Norm 是不是代表原子核们的受力的模的均方根?它代表的不单纯是模长的代数平均值,而是单个原子核受力相对于平均值的弥散程度

2 在反应机理的研究中,有的结构是用GEDIIS优化出来的,有的结构是用GDIIS优化出来的,能直接比较能量嘛?其他设定都相同。

谢谢您

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发表于 Post on 2017-6-27 19:59:41 | 只看该作者 Only view this author
再补充一个:在频率分析之后我发现有的振动模式力常数比其他模式大,但频率却比校小呢? 我原来是按谐振子模型理解的,那样是力常数越大,开根号也越大的。请问老师我错在哪里?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-27 21:38:16 | 只看该作者 Only view this author
steven 发表于 2017-6-27 19:42
sob老师 请教两个问题:

1 几何优化的收敛限 RMS gradient Norm 是不是代表原子核们的受力的模的均方根 ...

1 你就姑且理解为是整个体系所有原子平均受力就行了。用RMS而不用平均值,更能把较大的受力“强调”出来

2 能比较
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-27 21:38:34 | 只看该作者 Only view this author
steven 发表于 2017-6-27 19:59
再补充一个:在频率分析之后我发现有的振动模式力常数比其他模式大,但频率却比校小呢? 我原来是按谐振子 ...

还得考虑约化质量
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发表于 Post on 2017-6-27 21:44:04 | 只看该作者 Only view this author
完全解决
非常感谢您的指点

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发表于 Post on 2017-6-27 22:24:19 | 只看该作者 Only view this author
求推荐:G03中水合铝离子精确单点能计算泛函和基组。

谢谢!

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发表于 Post on 2017-6-27 23:39:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-6-27 17:54
随便找本像样的介绍DFT的书都会讲,比如A Chemist's Guide to Density Functional Theory 2ed里搜self- ...

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2017-6-28 00:47:15 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好!学生愚钝能不能再请教一下:M06中包含动能密度是不是说的是第一个括号(附件中)?问题二:网上讲DFT中的hybrid:explicit occupied orbital information,是不是指的是第二个括号中的泛函的自变量含有occupied orbital?

DFT.PNG (9.3 KB, 下载次数 Times of downloads: 18)

DFT.PNG

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-28 03:12:50 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2017-6-27 22:24
求推荐:G03中水合铝离子精确单点能计算泛函和基组。

谢谢!

B3LYP/def2TZVP
不过体系这么小,不如用CCSD(T)/cc-pVTZ
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498746012 发表于 2017-6-28 00:47
sob老师您好!学生愚钝能不能再请教一下:M06中包含动能密度是不是说的是第一个括号(附件中)?问题二:网 ...


1 不是。即便是其它非meta系列的泛函,其交换相关能也把对独立粒子近似下的动能(Ts)的修正考虑进去了。因此光从这个式子还没法说这个泛函包含动能密度

2 这种说法也不确切。杂化泛函依赖占据轨道信息是因为引入了HF交换项,而不管是不是杂化泛函,对于你给的图都成立

你这个图不够具体,只是给了个基本框架。还是得从交换相关泛函的更具体形式上才能区分泛函的类型
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