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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-31 19:10:38 | 只看该作者 Only view this author
luoshan393 发表于 2017-8-31 11:07
sob老师,请问用MS晶体表面建模,被吸附分子怎么较准确放置在表面上,只能笛卡尔转分数坐标吗?  还有文献 ...

这个属于第一性原理讨论的范畴,请在第一性原理版块发帖咨询
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-31 19:14:31 | 只看该作者 Only view this author
ABetaCarw 发表于 2017-8-31 09:59
卢老师好,请问有没有什么期刊或者研究团体支撑信息给得比较丰富的?求老师点拨一两个。
我苦于没有太多研 ...

没有期刊强制要求非得给坐标。但是较好期刊的较新的理论计算文章,越来越多在SI提供坐标了。但这基本都是看作者自觉。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-31 19:15:30 | 只看该作者 Only view this author
chrishuo 发表于 2017-8-31 09:44
sob老师,IRC没有跑到头就显示PES minimum detected on this side of the pathway.结束运算了,是我想要的 ...

可以
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-31 19:18:47 | 只看该作者 Only view this author
my_aman 发表于 2017-8-31 18:33
我想按着文献做一个benchmark,步骤如下 1. 异构体在tpss下优化,无虚频。2.取优化后的结构,在不同泛函(含 ...

可以
如果不同泛函下的freq也要做,那还得在不同泛函下分别优化才行。优化和freq级别必须相同。
有没有必要这么做看想对比什么问题。
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发表于 Post on 2017-8-31 19:53:19 | 只看该作者 Only view this author
请问sob 老师,guess=read 是如何从chk里读取已收敛的函数?它和把上一步的输出文件直接转变输入文件再计算有什么区别?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-31 20:22:23 | 只看该作者 Only view this author
qcn 发表于 2017-8-31 19:53
请问sob 老师,guess=read 是如何从chk里读取已收敛的函数?它和把上一步的输出文件直接转变输入文件再计算 ...

量化计算得提供初猜波函数,用guess=read读取之前收敛的波函数,可以在这次计算时候更容易收敛,或者在特殊情况时可帮助来指定收敛到某个状态。
你说的后者的做法只是用之前的结构而已。
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发表于 Post on 2017-8-31 21:23:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-8-31 20:22
量化计算得提供初猜波函数,用guess=read读取之前收敛的波函数,可以在这次计算时候更容易收敛,或者在特 ...

把上一步的输出文件直接转变输入文件,加关键词guess=read就会自动读取收敛的波函数?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-1 02:41:19 | 只看该作者 Only view this author
qcn 发表于 2017-8-31 21:23
把上一步的输出文件直接转变输入文件,加关键词guess=read就会自动读取收敛的波函数?

对,但%chk必须指向之前生成的chk
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发表于 Post on 2017-9-1 11:23:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-9-1 02:41
对,但%chk必须指向之前生成的chk

这和把上一步的chk文件转变成输入文件再做计算,是一样的效果吗?

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发表于 Post on 2017-9-1 12:28:18 | 只看该作者 Only view this author
sob 老师,在GaussView 中我想看二面角,选择H-H-C-C和C-C--H-H的二面角显示的值是不一样的,是什么问题呢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-1 22:18:20 | 只看该作者 Only view this author
qcn 发表于 2017-9-1 11:23
这和把上一步的chk文件转变成输入文件再做计算,是一样的效果吗?

显然不一样。你用gview载入chk再产生的输入文件里,默认没有guess=read
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-1 22:20:31 | 只看该作者 Only view this author
qcn 发表于 2017-9-1 12:28
sob 老师,在GaussView 中我想看二面角,选择H-H-C-C和C-C--H-H的二面角显示的值是不一样的,是什么问题呢

没具体情况没法说。凭基本逻辑、直觉和二面角的定义就能弄明白怎么回事
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发表于 Post on 2017-9-1 23:29:25 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,最近碰到了一个问题无法想通,想请教您一下:
一个带+2电荷且电子为奇数的体系,设置自旋多重度为2时进行优化,得到一个没有虚频的结构,此时进行stable计算显示为内部不稳定。(internal instability);设置自旋多重度为4时进行优化,也可以得到一个无虚频的结构,且stable计算显示波函数稳定。但是我实际对比了二者的能量,却发现前者的能量比后者的能量更低。我想请教您的是:
1.这种情况下选取哪个自旋多重度更合理呢?
2.既然stable计算会放宽条件,自动搜索相邻势能面的能量,为什么还会出现这样的情况呢?难道stable计算本身也不是非常可靠的吗?
麻烦老师了!
It's my life and it's now or never

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-2 07:42:15 | 只看该作者 Only view this author
wrtgcn 发表于 2017-9-1 23:29
sob老师,最近碰到了一个问题无法想通,想请教您一下:
一个带+2电荷且电子为奇数的体系,设置自旋多重度 ...

结构不同所致。有的结构下可能二重态能量低,有的结构下也可能四重态能量低

你在自旋多重度为2优化的结构下,改用自旋多重度为4测试stable,如果此时是stable,以此结构为初始结构优化四重态。由于优化过程中能量会继续降低,所以最终四重态优化完的结构的四重态能量肯定会小于一开始二重态优化的结构下的二重态能量。
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发表于 Post on 2017-9-2 08:13:51 | 只看该作者 Only view this author
kyuu 发表于 2017-8-31 17:17
您知道的哪些程序是支持OLCAO方法的?

有个程序就叫OLCAO
https://github.com/UMKC-CPG/olcao/wiki
日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。不做培*,不接代*,不接*发谢谢。

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