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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-8-29 21:14:20 | 只看该作者 Only view this author
大家好!请问高斯报错 157254214 words are not enough for AlAXAO是什么问题呢?(以下输入文件命令成功优化了三个分子,第四个分子的分子量较前三者大300—500,未能优化成功,报错如上。)
输入文件命令:%chk=D4-1A.chk
%mem=150MW
%rwf=loc1,2000mb,loc2,2000mb,loc3,2000mb,loc4,2000mb,loc5,2000mb,loc6,2000mb,loc7,2000mb,loc8,2000mb
%nprocshared=3
# opt freq b3lyp/6-31g(d)
输出文件报错: NEqPCM:  Using equilibrium solvation (IEInf=0, Eps=   7.4257, EpsInf=   1.9740)
          Differentiating once with respect to electric field.
                with respect to dipole field.
          Differentiating once with respect to nuclear coordinates.
AlAXAO:  NMat=   495 NPMax=    3 NPMax1=    0 MaxMat=    72.
   157254214 words are not enough for AlAXAO.
Error termination via Lnk1e in d:\G09W\l1002.exe at Tue Aug 29 20:28:35 2017.
Job cpu time:  0 days  2 hours 48 minutes 50.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=  10982 Int=      0 D2E=      0 Chk=    146 Scr=      1

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-29 21:23:26 | 只看该作者 Only view this author
安衎然 发表于 2017-8-29 21:14
大家好!请问高斯报错 157254214 words are not enough for AlAXAO是什么问题呢?(以下输入文件命令成功优 ...

内存给大点
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-8-29 21:26:01 | 只看该作者 Only view this author

请问是电脑内存还是输入文件中的设置内存呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-29 21:26:33 | 只看该作者 Only view this author
安衎然 发表于 2017-8-29 21:26
请问是电脑内存还是输入文件中的设置内存呢?

%mem
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发表于 Post on 2017-8-29 21:27:34 | 只看该作者 Only view this author

恩恩,谢谢老师

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发表于 Post on 2017-8-30 21:35:15 | 只看该作者 Only view this author
热力学组合方法,如cbs-qb3,可以设置温度、压力参数吗?另外采用热力学组合方法结合opt(ts,calcfc,noeigen)计算过渡态能量的方法是否被广泛接受?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-30 22:26:50 | 只看该作者 Only view this author
subway110 发表于 2017-8-30 21:35
热力学组合方法,如cbs-qb3,可以设置温度、压力参数吗?另外采用热力学组合方法结合opt(ts,calcfc,noeig ...


可以

虽然不算广为接受,毕竟本来这样用的人就很少,但是你那么用,结果可靠度不成问题,虽然不敢打保票说质量能和极小点计算一样。
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发表于 Post on 2017-8-30 22:32:08 | 只看该作者 Only view this author
老师,gaussian中有没有potential energy这样一个参数?好像老出现,但又不知道在输出文件中和哪个对应?
文献中有这样句话不知道怎么理解:E(pot/sol) is the potential energy including non-electrostatic energy in solution.这里面的non-electrostatic energy是什么意思?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-30 23:04:12 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2017-8-30 22:32
老师,gaussian中有没有potential energy这样一个参数?好像老出现,但又不知道在输出文件中和哪个对应?
...


这一般就是指单点能

溶剂效应有极性和非极性部分,看
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327
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发表于 Post on 2017-8-31 09:44:24 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,IRC没有跑到头就显示PES minimum detected on this side of the pathway.结束运算了,是我想要的方向。这种情况下,我可以不继续计算,拿出最后一步的结构进行优化得到一个反应的中间的结构吗?

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发表于 Post on 2017-8-31 09:59:47 | 只看该作者 Only view this author
卢老师好,请问有没有什么期刊或者研究团体支撑信息给得比较丰富的?求老师点拨一两个。
我苦于没有太多研究实际反应的例子进行学习。就是一个问题从提出到解决,其中经历的多步过程都能给出个细节的那种。我看了好多文章都是给个截图,然后告诉你这个就是TS,是不是造假都无从得知。
现在见到支撑信息里面带XYZ坐标的 都能感动到流泪。
实验文章,总有trap存在担心后人模仿超越,你不去质询,他就是不说,等到这个方向被自己课题组榨干了,都不一定会把trap补上。计算化学是本身就没有提供细节的传统还是……感觉自己在恶意揣度别人了。
谢谢老师。
恍惚月余,深谙人与人之间的差距。以后还应努力学习,才能与强者比肩。

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发表于 Post on 2017-8-31 11:07:00 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,请问用MS晶体表面建模,被吸附分子怎么较准确放置在表面上,只能笛卡尔转分数坐标吗?  还有文献里的top bridge位置有较精确的要求吗?感激不尽!

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发表于 Post on 2017-8-31 17:17:04 | 只看该作者 Only view this author
您知道的哪些程序是支持OLCAO方法的?
圣诞刨坟忙

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发表于 Post on 2017-8-31 18:33:24 | 只看该作者 Only view this author

benchmark求教

我想按着文献做一个benchmark,步骤如下 1. 异构体在tpss下优化,无虚频。2.取优化后的结构,在不同泛函(含矫正的)下直接算能量。
请问按着这种步骤可以吗?
还有,这个时候我还需要算异构体在不同泛函下的freq吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-31 19:10:19 | 只看该作者 Only view this author
kyuu 发表于 2017-8-31 17:17
您知道的哪些程序是支持OLCAO方法的?

没听说过OLCAO
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