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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-10-15 11:50:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-14 23:02
如果是非线型分子,前6个应当为0或非常接近于0,因为对应的是整体平动、转动。如果其它的还有虚频,说明 ...

谢谢老师,我再做一次优化~

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发表于 Post on 2017-10-15 14:59:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-14 22:59
没有“擦写文件”一说
要么scratch file,要么read-write file,后者属于前者
不知道你哪里听来的乱七 ...

谢谢老师的解答   我是在zork翻译的G09用户手册看到的

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发表于 Post on 2017-10-15 15:03:01 | 只看该作者 Only view this author
sob 老师 请问下图中(附件)的基函数个数怎么算的

1508050485(1).jpg (25.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

1508050485(1).jpg

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-15 15:27:45 | 只看该作者 Only view this author
yangjianfeng 发表于 2017-10-15 14:59
谢谢老师的解答   我是在zork翻译的G09用户手册看到的

zork对手册翻译的质量没问题,但是同一个词不同的人翻译成不同名字,给交流带来麻烦。
个人建议还是看英文手册。g16的官网上有,g09的看sobereva.com/g09
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-15 15:29:12 | 只看该作者 Only view this author
yangjianfeng 发表于 2017-10-15 15:03
sob 老师 请问下图中(附件)的基函数个数怎么算的

供参考



北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-10-15 17:44:18 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lily19830130 于 2017-10-16 09:47 编辑
lily19830130 发表于 2017-10-13 17:44
老师,基函数拟合轨道的时候是如何描述原子轨道的?是不是按照学过的1s2s2p3s3p等,每一个对应的原子轨道用 ...

谢谢老师的回复!看完之后发现,分子轨道的系数实际上是基函数的系数,不知道对不?第一行原子(Li-Ne)的6-311G(d)的基函数描述可以把1S2S2P分为内外层进行一一对照(图一,碳原子),但是第二行原子的氯原子的基函数就无法一一对照(图二,氯原子),没有办法按照6-31G(d)的方法计算基函数数量。另外,分子轨道的图是不是依据各个分子轨道里面各原子轨道基函数的系数(图三)组合成的函数,把电子密度相同的点连起来构成面就是画出的分子轨道图形。

1.jpg (82.92 KB, 下载次数 Times of downloads: 19)

1.jpg

2.jpg (133.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

2.jpg

3.jpg (171.56 KB, 下载次数 Times of downloads: 21)

3.jpg

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发表于 Post on 2017-10-15 20:35:23 | 只看该作者 Only view this author
大家晚上好,请问为什么我把“# td=(nstates=30) b3lyp/6-31G(d)”改成“# td=(nstates=30) m062x/6-31G(d)”,程序就不能运行了呢?

D1-1-TD-M062X.gjf

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D1-1-TD-M062X.log

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发表于 Post on 2017-10-15 22:10:08 | 只看该作者 Only view this author
老师,你好!想请教一下M06-2X和wb97xd两种方法的区别是什么?有没有相关的文献可以推荐?万分感谢

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发表于 Post on 2017-10-15 23:04:43 | 只看该作者 Only view this author
sob 老师  请问Slater形的轨道和s p d 等价键轨道有什么联系  我看书说 sto-3G 是用三个高斯函数来描述Slater轨道。

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发表于 Post on 2017-10-16 10:45:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-14 16:17
ircmax是用于在低级别产生的IRC上面找高级别对应的过渡态位置,没有什么意义,不用管它

谢谢sob老师。

另外想问一下,geom=connectivity 这个关键词在优化过渡态结构时是否建议使用?还是将输入文件分子结构部分的成键说明一并删去?

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发表于 Post on 2017-10-16 10:54:23 | 只看该作者 Only view this author

sob 老师   ①   6-31+G**对碳的基函数中,怎么看其笛卡尔极化d型极化函数为6个 ( 那要是换成6-31+G*的笛卡尔极化函数又变成几个了呢),其弥散函数为1+3(S型弥散函数和PX  PY  PZ 型弥散函数),那换成6-31+G*弥散函数就成3(PX  PY  PZ 型弥散函数)了吧  
               ② 6-31+G**对氢的基函数中,极化函数为什么变成3(PX PY PZ)了  ,此外 弥散函数为什么变成0了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-16 11:01:02 | 只看该作者 Only view this author
flumense 发表于 2017-10-16 10:45
谢谢sob老师。

另外想问一下,geom=connectivity 这个关键词在优化过渡态结构时是否建议使用?还是将 ...

不影响优化结果
如果图清净,就和连接关系一起删了
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xujiazhen 发表于 2017-10-15 22:10
老师,你好!想请教一下M06-2X和wb97xd两种方法的区别是什么?有没有相关的文献可以推荐?万分感谢

简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272

区别、原理看原文就知道
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-16 11:02:08 | 只看该作者 Only view this author
安衎然 发表于 2017-10-15 20:35
大家晚上好,请问为什么我把“# td=(nstates=30) b3lyp/6-31G(d)”改成“# td=(nstates=30) m062x/6-31G(d) ...

版本太老。从g09才支持M06-2X
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-16 11:05:33 | 只看该作者 Only view this author
yangjianfeng 发表于 2017-10-15 23:04
sob 老师  请问Slater形的轨道和s p d 等价键轨道有什么联系  我看书说 sto-3G 是用三个高斯函数来描述Slat ...

Slater轨道和实际原子轨道径向特征相同或很相似,比起高斯函数更像,因此结果更好。但是用slater轨道计算时候双电子积分远比用高斯函数作为基函数难算。因此pople提出的STO-3G用3个高斯函数收缩成一个基函数,通过向slater轨道拟合来确定收缩系数和指数,达到精度和计算复杂度的权衡。
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