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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-10-23 09:41:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-22 15:10
guess=read,读取真空下收敛的波函数再试

其它的做法

请问老师除了guess=read,还需要加geom=checkpoint关键词么?

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发表于 Post on 2017-10-23 11:07:17 | 只看该作者 Only view this author
有些轨道的电子占据数是2,有些怎么不是整数?它们是怎么进行计算得到的?

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发表于 Post on 2017-10-23 11:25:31 | 只看该作者 Only view this author
让你变成回忆 发表于 2017-10-20 10:08
可以采用PCM模型,设置介电常数。

这是我的S0,S1,T1构型的输入文件,算出来的能量S0的比S1的还高,是不是有什么问题啊

S0.gjf

3.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

S1.gjf

3.51 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

T1.gjf

3.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

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发表于 Post on 2017-10-23 14:02:28 | 只看该作者 Only view this author
阳光总在风雨后 发表于 2017-10-23 11:25
这是我的S0,S1,T1构型的输入文件,算出来的能量S0的比S1的还高,是不是有什么问题啊

先不看别的 我觉得你的输入文件有些是多余的。
td计算的时候,默认算的激发态就是3个,其次优化的时候默认root=1,所以你td括号里面写的没任何意义。可以不写。
另外我不清楚你是否需要优化激发态来查看结构,我很少很遇到优化激发态的情况,太费时。  一般就是考虑激发就行。   
这是我个人的看法。

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发表于 Post on 2017-10-23 14:16:28 | 只看该作者 Only view this author
第一次使用MP2方法,请问,如果用MP2做单点能的时候,读能量,是读HF对应的数据还是MP2的呢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-23 14:34:15 | 只看该作者 Only view this author
安衎然 发表于 2017-10-23 09:25
大家上午好,请问guess=read是默认上一个CHK文件吗?怎么指定高斯读取很早以前的文件啊?

%chk或%oldchk指向哪个chk,就从哪个chk读
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-23 14:34:21 | 只看该作者 Only view this author
niubaotian85 发表于 2017-10-23 14:16
第一次使用MP2方法,请问,如果用MP2做单点能的时候,读能量,是读HF对应的数据还是MP2的呢

MP2
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-23 14:34:51 | 只看该作者 Only view this author
安衎然 发表于 2017-10-23 09:41
请问老师除了guess=read,还需要加geom=checkpoint关键词么?

输入文件里直接写了chk里的坐标就不需要geom=check,没写的话就得geom=check从chk里读取
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-23 14:35:52 | 只看该作者 Only view this author
终_焉 发表于 2017-10-22 22:35
Sob老师,我在新配置的电脑(WIN10 64位)上安装Gaussian 09 D.01跑任务,全都以
Two-electron integral sym ...


光看这些信息没法判断。
先算一个小体系,比如B3LYP/6-31G*算乙醇单点,能够正常跑完就说明高斯没问题。如果这个都跑不了,没准是软件冲突,机子里的安全程序阻碍程序运行之类。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-23 14:36:35 | 只看该作者 Only view this author
lily19830130 发表于 2017-10-23 11:07
有些轨道的电子占据数是2,有些怎么不是整数?它们是怎么进行计算得到的?

非整数的是自然轨道
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-23 14:37:22 | 只看该作者 Only view this author
安衎然 发表于 2017-10-22 15:45
谢谢老师,请问初猜为真空下收敛的波函数的相关命令怎么写呢?如何保证read的是指定的真空下收敛的波函数 ...

真空下单点算完了就有个chk文件,之后加了scrf的时候用guess=read,并且%chk还指向那个chk文件,就会从其中读取收敛的波函数作为初猜
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-23 14:39:29 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2017-10-22 22:08
请问老师,比较相互作用强度,用BCP处的电子密度有加和性吗?一个复合物A与B相互作用发生在3个位点,形成了 ...


1 不能,不是同类键
2 电子密度没法加和比较强度。即便是同类键,作用强度和BCP的密度虽然一般是正比的,但也不是线性关系。至于氢键相互作用强度,由于作用强度约为BCP处势能密度的一半,这时候多个BCP势能密度加和讨论总强度还说得过去。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-23 14:43:03 | 只看该作者 Only view this author
computational 发表于 2017-10-22 16:34
请问sob老师,我计算一个过多金属氧化物(含5个Fe原子)团簇与一些小分子的弱相互作用,用PBE/6-311++G(d ...


你的老师明显误导你
MP2算过渡金属明显不合适,远不如恰当选取的DFT泛函结果好,而且昂贵得多
什么泛函算过渡金属合适看
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272

MP2/6-311+(3df,3pd)这种组合更是超级恶心
用什么基组看具体情况,见
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336

一般来说,此体系建议B3LYP-D3或TPSSh-D3或M06-D3结合6-311+G**优化和振动分析,算相互作用能用那些泛函结合ma-TZVP或更贵的jun-cc-pVTZ(如果用得动双杂化泛函,对于高斯可以用B2PLYPD3)。

直接用PBE算弱相互作用结果很垃圾。除非加了D3校正
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发表于 Post on 2017-10-23 14:47:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-23 14:37
真空下单点算完了就有个chk文件,之后加了scrf的时候用guess=read,并且%chk还指向那个chk文件,就会从其 ...

谢谢耐心的老师,嘻嘻,我再试下~

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发表于 Post on 2017-10-23 14:49:45 | 只看该作者 Only view this author
老师您好我想要用molpro计算beo分子的两个1重xigema态,输入卡部分如下
{MULTI;
                        occ,7,2,2,1;
                        wf,12,1,0;state,2;
                        wf,12,1,2;state,1;
                        wf,12,2,0;state,1;
                        wf,12,3,0;state,1;
                        wf,12,2,2;state,1;
                        wf,12,3,2;state,1;
                       }
                        ecas1(i)=energy(1);
                        ecas2(i)=energy(2);
                        ecas3(i)=energy(3);
                        ecas4(i)=energy(4);
                        ecas5(i)=energy(5);
                        ecas6(i)=energy(6);
                        ecas7(i)=energy(7);
                        
                     {mrci;
                        occ,7,2,2,1;
                      wf,12,1,0;state,1;save,7111.1;maxiter,2000,2000;}
                       eci1(i)=energy(1);
                       eda1(i)=energd(1);
                       dipz1(i)=dmz(1);   
                     {mrci;
                        occ,7,2,2,1;
                      wf,12,1,0;state,1,2;save,7121.1;maxiter,2000,2000;}
                       eci2(i)=energy(1);
                       eda2(i)=energd(1);
                       dipz2(i)=dmz(1);
可是总是勉强过了第一个点就报错,报错信息是problem occours in readm,我明明已经把两个态的ci计算分开了,为什么还是会出现readm问题

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