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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-22 15:29:55 | 只看该作者 Only view this author
flumense 发表于 2017-10-22 13:35
sob老师好,想问一下关于高斯计算的能量结果及处理。
关于单点能、零点能和吉布斯自由能。
1.确定了优化 ...

1
通常建议再用更高的级别算单点,看
浅谈为什么优化和振动分析不需要用大基组
http://sobereva.com/387

2 是

3 “溶剂化处理”意义不明,说得太含糊
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-22 15:31:35 | 只看该作者 Only view this author
niubaotian85 发表于 2017-10-22 15:29
sob老师,你好。我想问一下,当计算一个母体,非杂化泛函下单态能量低,杂化泛函下三态能量低,两种不同方 ...


用个可靠点的,比如PWPB95-D3、B2PLYP-D3,能用CCSD(T)最好,考察到底哪个能量最低

除非是牵扯过渡金属,否则通常用合适的杂化泛函总比纯泛函要好。
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发表于 Post on 2017-10-22 15:33:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-22 15:31
用个可靠点的,比如PWPB95-D3、B2PLYP-D3,能用CCSD(T)最好,考察到底哪个能量最低

谢谢sob老师。另外想问一下,单三态能量相近能说明什么么?比如不稳定什么的?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-22 15:34:45 | 只看该作者 Only view this author
niubaotian85 发表于 2017-10-22 15:33
谢谢sob老师。另外想问一下,单三态能量相近能说明什么么?比如不稳定什么的?

和稳定性没直接关系。倒是说明容易自旋翻转
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发表于 Post on 2017-10-22 15:35:03 | 只看该作者 Only view this author
还有sob老师,体系中有三到四个过渡金属,是第四周期的,我没有用赝势,很不容易收敛,

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发表于 Post on 2017-10-22 15:38:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-22 15:34
和稳定性没直接关系。倒是说明容易自旋翻转

那容易自旋翻转对于母体应用来说有什么影响么?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-22 15:41:07 | 只看该作者 Only view this author
niubaotian85 发表于 2017-10-22 15:35
还有sob老师,体系中有三到四个过渡金属,是第四周期的,我没有用赝势,很不容易收敛,

过渡金属体系判断自旋多重度哪个能量低、能量差,适合用B3LYP*,看
Gaussian中非内置的理论方法和泛函的用法
http://sobereva.com/344
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-22 15:42:02 | 只看该作者 Only view this author
niubaotian85 发表于 2017-10-22 15:38
那容易自旋翻转对于母体应用来说有什么影响么?

多google Spin crossover查看相关资料
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发表于 Post on 2017-10-22 15:42:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-22 15:42
多google Spin crossover查看相关资料

非常感谢

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发表于 Post on 2017-10-22 15:45:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-22 15:10
guess=read,读取真空下收敛的波函数再试

其它的做法

谢谢老师,请问初猜为真空下收敛的波函数的相关命令怎么写呢?如何保证read的是指定的真空下收敛的波函数呢?

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发表于 Post on 2017-10-22 16:34:15 | 只看该作者 Only view this author
请问sob老师,我计算一个过多金属氧化物(含5个Fe原子)团簇与一些小分子的弱相互作用,用PBE/6-311++G(d)进行几何优化和能量计算,老师建议我用MP2方法并结合更大的基组计算。
请问sob老师,(1)对于我的研究体系,PBE/6-311++G(d)方法真的不适合吗?
(2)我在MP2/6-311+(3df,3pd)水平下计算结构和能量总是L502错误。
(3)对于我这个体系如果不用MP2,几何优化和能量计算分别选用什么方法和基组最合理?
谢谢老师!!!

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发表于 Post on 2017-10-22 21:07:05 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 erya123 于 2017-10-22 21:10 编辑
sobereva 发表于 2017-10-22 00:02
从图上看牵扯不到CDA
只不过就是做个轨道成分分析,乘上轨道占据数,来得到轨道中不同片段所占的电子数

sob老师,文献中说的是片段结构中LUMO轨道在独立和结合在一起的电子布局变化(我的理解是这样的)。求片段的电子可以吗?片段的电子数(orbital composition analysis,定义片段。。。)我计算出来是90.09226,整个片段(C*7+P*1+H*15+Ni*1=100),数字好像和文献里面的无法对应。还是我所错了。一个问题问了好几遍,希望老师不要发火啊。

1111.jpg (170.38 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

1111.jpg

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发表于 Post on 2017-10-22 22:08:35 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,比较相互作用强度,用BCP处的电子密度有加和性吗?一个复合物A与B相互作用发生在3个位点,形成了3个键(包括1个C-C键,和两个O-H...N氢键);另一个复合物C与D形成2个C-C键,一个O-H...N氢键。1.可以把两个复合物的3个BCP处电子密度加和比较作用强度吗?2.如果不同类型键不能加和,那么如果是同类型键可以加和比较吗?

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发表于 Post on 2017-10-22 22:35:50 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,我在新配置的电脑(WIN10 64位)上安装Gaussian 09 D.01跑任务,全都以
Two-electron integral symmetry is turned on.
或者
Regular integral format.
Two-electron integral symmetry is turned off
Do NDO integrals.
One-electron integrals computed using PRISM.
结尾。任务一直在进程中。请问是我的系统或者软件配置有问题吗?

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发表于 Post on 2017-10-23 09:25:06 | 只看该作者 Only view this author
大家上午好,请问guess=read是默认上一个CHK文件吗?怎么指定高斯读取很早以前的文件啊?

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