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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-10-21 16:18:35 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lufenghxu 于 2017-10-21 19:55 编辑
sobereva 发表于 2017-10-21 14:42
那种说法比较别扭,也没什么意思。强烈建议别看那些中文老文章(而且还是《大学化学》这种层次的,此类 ...

老师,定域轨道有没有什么对应的意义啊。可以用来分析哪些方面的性质?

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发表于 Post on 2017-10-21 17:20:26 | 只看该作者 Only view this author
那就是不是像IR和Raman那样了,不能直接算出某个元素的xps谱图来了。

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发表于 Post on 2017-10-21 17:22:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-21 14:34
需要提供过渡态的初猜结构
这种简单又很小的体系要确认有无过渡态,做个柔性扫描一看就清楚了。当然你也 ...

好的,多谢社长,柔性扫描不会,方便的时候教我下吧,当然我自己也搜搜学学。

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发表于 Post on 2017-10-21 22:41:58 | 只看该作者 Only view this author
老师,有个问题是一篇文献上关于Charge decomposition analysis,不知道问这样具体的问题是否合适,但是实在是不解。这是一个过渡态结构(TS1a-LA2,如图片1所示),分成两个片段Nicat和S-LA2,文献中讨论了电子的流向。具体内容如图片question1所示。问题:文献中有两个轨道电子变化值0.786e,1.249e,不知道怎么来的。图片2中的HOMO和LUMO的轨道能量值,用multiwfn计算后发现和图片中的一样。复合物、两个片段的gjf,fchk文件一并上传,文件较多,完结后自己删除这些文件。


1.jpg (7.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 4)

图片1

图片1

2.jpg (29.39 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

图片2

图片2

question1.jpg (58.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)

question1

question1

nimoiety.fchk

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nimoiety.gjf

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s-la2.fchk

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s-la2.gjf

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ts1a-la2.gjf

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-22 00:00:35 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2017-10-21 16:18
老师,定域轨道有没有什么对应的意义啊。可以用来分析哪些方面的性质?

怎么没意义?
Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比
http://sobereva.com/380
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-22 00:02:41 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2017-10-21 22:41
老师,有个问题是一篇文献上关于Charge decomposition analysis,不知道问这样具体的问题是否合适,但是实在 ...

从图上看牵扯不到CDA
只不过就是做个轨道成分分析,乘上轨道占据数,来得到轨道中不同片段所占的电子数
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发表于 Post on 2017-10-22 12:00:39 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 erya123 于 2017-10-22 12:16 编辑
sobereva 发表于 2017-10-22 00:02
从图上看牵扯不到CDA
只不过就是做个轨道成分分析,乘上轨道占据数,来得到轨道中不同片段所占的电子数

老师,能具体点吗?轨道成分分析看了,但是感觉还是没有怎么算的思路啊。不知道这上面的数字怎么来的。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-22 12:19:10 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2017-10-22 12:00
老师,能具体点吗?轨道成分分析看了,但是感觉还是没有怎么算的思路啊。不知道这上面的数字怎么来的。


某个片段所占轨道成份会求不?博文里明确写了。再乘上轨道占据数就完了,这是明确已知的。
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发表于 Post on 2017-10-22 13:31:00 | 只看该作者 Only view this author

我错了

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发表于 Post on 2017-10-22 13:35:48 | 只看该作者 Only view this author
sob老师好,想问一下关于高斯计算的能量结果及处理。
关于单点能、零点能和吉布斯自由能。
1.确定了优化后的构型后(计算了opt+freq),单电能是否需要额外计算?
2.另外,如果用于进行能垒比较,一般用的是什么能量?是吉布斯自由能吗?
3.还有一个问题,用G03在气相下计算得到的反应路径,是否需溶剂化处理后再进行溶剂化的计算?
问题有些多。。谢谢老师了!

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发表于 Post on 2017-10-22 13:42:45 | 只看该作者 Only view this author
大家下午好,我用泛函m052x在溶剂THF条件下算TD收敛失败,请问是什么原因呢?有什么解决办法么?(用m052x在真空条件下算TD收敛成功)

D1-1S-TD-M052X.gjf

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D1-1S-TD-M052X.log

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发表于 Post on 2017-10-22 14:46:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-19 17:03
溶剂里的溶质的gap本身也没有严格的精确不精确之说,毕竟HOMO-LUMO gap实验不可测,此时就用最常用的B3 ...

算gap,配合物有铜原子,高斯手册里没看到Lan2TZ,选个比Lanl2DZ好一点点的,只剩下SDD了吧
圣诞刨坟忙

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-22 15:08:53 | 只看该作者 Only view this author
kyuu 发表于 2017-10-22 14:46
算gap,配合物有铜原子,高斯手册里没看到Lan2TZ,选个比Lanl2DZ好一点点的,只剩下SDD了吧

lanl2TZ需要自行去EMSL拷定义。
用SDD就可以
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-22 15:10:13 | 只看该作者 Only view this author
安衎然 发表于 2017-10-22 13:42
大家下午好,我用泛函m052x在溶剂THF条件下算TD收敛失败,请问是什么原因呢?有什么解决办法么?(用m052x ...

guess=read,读取真空下收敛的波函数再试

其它的做法
解决SCF不收敛问题的方法
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发表于 Post on 2017-10-22 15:29:14 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,你好。我想问一下,当计算一个母体,非杂化泛函下单态能量低,杂化泛函下三态能量低,两种不同方法下单三态能量都比较相近,在计算应用如反应或者吸附等方面应该使用单态还是三态呢?

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