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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-19 19:14:21 | 只看该作者 Only view this author
329678001 发表于 2017-12-19 08:25
sob老师,我做IRC的目的就是为了验证过渡态和对应的反应物和产物。。还想请教一下IRC还能做些什么?一直 ...

对于验证目的,你当前跑出来的结果就已经够了
如果把IRC用于文献里,那自然希望曲线比较光滑,别人看着舒服
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-12-19 20:33:46 | 只看该作者 Only view this author

频率计算

我是一个高斯计算新人在用优化好的分子计算频率的时候总会莫名掉下来,就好像没有算完一样,但是并不是服务器不稳定的原因,各位老师能否帮忙解答一下?

PYQ-Ph-PDIFreq.gjf

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PYQ-Ph-PDIFreq.out

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发表于 Post on 2017-12-19 20:43:23 | 只看该作者 Only view this author

gaussian16太大了,3.37G,准吗

gaussian16太大了,3.37G,是这样的吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-19 20:44:17 | 只看该作者 Only view this author
小潘潘 发表于 2017-12-19 20:33
我是一个高斯计算新人在用优化好的分子计算频率的时候总会莫名掉下来,就好像没有算完一样,但是并不是服务 ...

程序bug,或者程序与系统兼容问题都有可能造成。
重新算一遍。
如果还这样,尝试其它版本。
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发表于 Post on 2017-12-19 20:48:33 | 只看该作者 Only view this author
好的,非常感谢老师的解答

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发表于 Post on 2017-12-19 20:57:17 | 只看该作者 Only view this author

输入文件哪里错了,请指教,谢谢!

下面是我对Gaussview创建的乙烯分子模型进行优化,但问什么运行时
立刻就错误终止了呢?请问输入文件哪里有错误呢?谢谢。

%chk=1.chk
%mem=1GB
%NProcShared=4
%rwf=1,19900000mb,2,19900000mb,3,19900000mb,4,19900000mb
#p hf/6-31G(d) opt

c2h4

0 1
C                 -2.04691913    0.10971787    0.00000000
C                 -0.72100313    0.10971787    0.00000000
H                 -2.64050413    1.03375587    0.00000000
H                 -2.64053513   -0.81429613   -0.00002200
H                 -0.12741813   -0.81432013   -0.00001900
H                 -0.12738713    1.03373187    0.00002600

1 2 2.0 3 1.0 4 1.0
2 5 1.0 6 1.0
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-19 20:58:17 | 只看该作者 Only view this author
ironman_2 发表于 2017-12-19 20:43
gaussian16太大了,3.37G,是这样的吗

本来就这样
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-19 21:03:16 | 只看该作者 Only view this author
mumeizili 发表于 2017-12-19 20:57
下面是我对Gaussview创建的乙烯分子模型进行优化,但问什么运行时
立刻就错误终止了呢?请问输入文件哪里 ...

关键词没错
估计是%不恰当设定所致
没事不要%rwf分那么多,你当前的设置根本没意义,或者说根本设它就是多余的
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发表于 Post on 2017-12-19 21:13:08 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ironman_2 于 2017-12-19 21:27 编辑

高斯16现在到了什么版本?刚下载了一个是G16-A03-AVX2,怎么看我的电脑支持不支持这个版本呢?
另外问下大神,能用高斯计算荧光强度吗?

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发表于 Post on 2017-12-19 21:28:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-19 19:12
那只能利用ONIOM分层设定实现,高层和底层的显示方式不同。

sob老师,具体操作流程可以在哪里找到吗?谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-19 21:54:54 | 只看该作者 Only view this author
ironman_2 发表于 2017-12-19 21:13
高斯16现在到了什么版本?刚下载了一个是G16-A03-AVX2,怎么看我的电脑支持不支持这个版本呢?
另外问下 ...

用aida64或CPU-Z等程序查看CPU信息,如果显示支持AVX2就能用

荧光看
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-19 21:56:43 | 只看该作者 Only view this author
chrishuo 发表于 2017-12-19 21:28
sob老师,具体操作流程可以在哪里找到吗?谢谢老师


gview里Edit - Select layers,摸索两下就会了。low层是细线表示,high层是球棍表示
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发表于 Post on 2017-12-19 22:47:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-19 21:56
gview里Edit - Select layers,摸索两下就会了。low层是细线表示,high层是球棍表示

好的,谢谢sob老师!

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发表于 Post on 2017-12-20 10:14:45 | 只看该作者 Only view this author
1.%rwf是干嘛的?我们课题组都是带这个,一直也没懂干嘛的,前面sob老师说的不要把%rwf分那么多是什么意思啊呢,我之前看别人说有%rwf才能在断电后用restart续算。
2.我最近算任务总是通进去算很久没结果,群里大神告诉我RMS,Max变大就把任务杀死,可是我发现有时候这两个值增大最后还能变小,并且算出结果。如果我把任务杀死,可是我再算的时候还是会碰到这种情况啊,不知道应该怎么处理。。另外我之前算过一个任务,增大步长后,更快得到了结果,这是偶然的么?

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发表于 Post on 2017-12-20 11:09:03 | 只看该作者 Only view this author
群里各位大神,高斯16在计算速度各方面比09版快吗?想安装gaussian16,但是解压后已经高达7.59G

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