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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-12-23 21:44:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-23 21:41
二维柔性扫描虽然可以,但是很昂贵。
也有可能不是一步就能转变的过程
如果两个构象能量差别不大,也 ...

好的.
多谢老师的解答!

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发表于 Post on 2017-12-24 10:37:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-23 21:43
高斯能做得任务类型太多了,要说完整的讲,只有在北京科音办的量化培训班里,会讲得十分系统全面

某 ...

谢谢老师的回复   争取去上你的培训班

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发表于 Post on 2017-12-24 22:08:57 | 只看该作者 Only view this author
老师,请教您一下 X光衍射测出的重原子位置是"振动平均结构"吗? 否则是什么?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-25 01:30:38 | 只看该作者 Only view this author
steven 发表于 2017-12-24 22:08
老师,请教您一下 X光衍射测出的重原子位置是"振动平均结构"吗? 否则是什么?

一定程度是,但也不完全是。X光衍射测的是电子密度分布,把电子密度峰的位置作为原子核位置,但对于柔性大体系也往往有因为热运动过大或者晶体有序度不佳等情况造成局部区域原子核位置难以断定,因此有时候还会借助一些其它辅助手段比如MD帮助得到最终原子核位置。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-12-25 01:51:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-25 01:30
一定程度是,但也不完全是。X光衍射测的是电子密度分布,把电子密度峰的位置作为原子核位置,但对于柔性 ...

学习了.谢谢老师解答!

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发表于 Post on 2017-12-25 15:01:03 | 只看该作者 Only view this author
sob 老师  我用GV打开分子轨道图 (如图)  会显示pi轨道  和sg轨道(以前都不显示,不知道自己点了哪)请问老师   怎样让这个显示出来的

1514184989(1).jpg (108.17 KB, 下载次数 Times of downloads: 23)

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发表于 Post on 2017-12-25 15:33:55 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lily19830130 于 2017-12-25 15:36 编辑

老师,我设置opt 循环是800,为什么到120就停止了。如下图所示:
另外,如果接着这个计算,如何修改关键词?查了资料说guess,geom=check 什么的,但是说的不清楚,不知道加这些是什么意思。

11111.jpg (31.38 KB, 下载次数 Times of downloads: 32)

11111.jpg

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发表于 Post on 2017-12-25 16:00:07 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,如果S1向T1系间窜越,二者沿着某个参量进行势能曲线扫描时,这两条势能曲线一定会存在交叉点吗?还是说可能存在也可能不存在?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-25 16:29:59 | 只看该作者 Only view this author
Theor_Comp 发表于 2017-12-25 16:00
sob老师,如果S1向T1系间窜越,二者沿着某个参量进行势能曲线扫描时,这两条势能曲线一定会存在交叉点吗? ...

看具体是什么参量,参量选取合适,会交叉,否则不会。一般都是通过搜索MECP来讨论
使用MECP程序结合Gaussian程序搜索极小能量交叉点
http://sobereva.com/286
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-25 16:32:24 | 只看该作者 Only view this author
lily19830130 发表于 2017-12-25 15:33
老师,我设置opt 循环是800,为什么到120就停止了。如下图所示:
另外,如果接着这个计算,如何修改关键词 ...

g09对步数上限有内部的限制,和原子数有关,即便自己把maxcyc设巨大也没用
直接用最后一帧结构重新算就完了,别看乱七八糟资料
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-25 16:32:53 | 只看该作者 Only view this author
yangjianfeng 发表于 2017-12-25 15:01
sob 老师  我用GV打开分子轨道图 (如图)  会显示pi轨道  和sg轨道(以前都不显示,不知道自己点了哪)请 ...


你的体系是线型分子,所以才会显示
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发表于 Post on 2017-12-25 17:41:53 | 只看该作者 Only view this author
求问老师一个基础问题,对于基态是开壳层的分子,我算了垂直激发态优化可以怎么分析呢。轨道贡献值都不用算了可以从结果文件看出来……优化基态分子以后算了它的垂直激发能。感觉做不了什么分析啊,也没有相应的实验值作对照。谢谢老师的指点啦
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发表于 Post on 2017-12-25 21:26:56 | 只看该作者 Only view this author
大家晚上好,请问吸收谱的半峰宽大小根据什么来调?调多大合适?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-25 22:13:18 | 只看该作者 Only view this author
安衎然 发表于 2017-12-25 21:26
大家晚上好,请问吸收谱的半峰宽大小根据什么来调?调多大合适?

没特殊情况就用默认值,有实验光谱要和实验光谱对比就逐渐调到对得最好的情况
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-25 22:14:26 | 只看该作者 Only view this author
QuantumHan 发表于 2017-12-25 17:41
求问老师一个基础问题,对于基态是开壳层的分子,我算了垂直激发态优化可以怎么分析呢。轨道贡献值都不用算 ...


“垂直激发态优化”意义不明。垂直激发干嘛优化?
你可以考察激发的特征,诸如电荷怎么转移的(密度差图、空穴-电子分析)、键强度怎么变化的之类的
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