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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-27 19:14:25 | 只看该作者 Only view this author
李宏俊 发表于 2017-12-27 16:28
Sob老师,我想请问一下,在gaussianD01 32位Windows版本下,在配置文件中设置参数时,调用核数可以有多少核 ...

往往可以更高,多数情况设1500MB也能跑,但是如果发现运行一开始就出错,就需要设低点
32bit Gaussian最多调用4核
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-27 19:15:21 | 只看该作者 Only view this author
mumeizili 发表于 2017-12-27 11:46
请问为什么在运行时总出现这样的提示
qsub: Job exceeds queue resource limits MSG=cannot locate feasib ...

我对qsub不怎么熟悉,看提示,貌似是可能提交任务的时候所有节点都在占着。建议联系管理员
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-27 19:29:45 | 只看该作者 Only view this author
好好学习 发表于 2017-12-27 16:01
请问老师,在计算td时,设计两种或多种溶液,时输入文件该怎样书写?

里面提了
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327
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发表于 Post on 2017-12-27 20:43:29 | 只看该作者 Only view this author
我在文献中看到氧空位形成能,1.不太清楚这个形成能到底是用什么能量算的、2算形成能是把氧原子扣掉,然后用的能量是结构优化的还是没优化的呢?  感谢老师

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发表于 Post on 2017-12-27 21:18:35 | 只看该作者 Only view this author
在opt后在同等水平下做freq计算,有一个虚频,但是虚频较小(频率为-7.76,infrared为0.0438),请问这个时候得出来的虚频是否可以认为是方法本身或计算精度造成的,从而可以认为优化出来的结构为稳定结构?谢谢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-27 22:35:06 | 只看该作者 Only view this author
whtu 发表于 2017-12-27 21:18
在opt后在同等水平下做freq计算,有一个虚频,但是虚频较小(频率为-7.76,infrared为0.0438),请问这个时 ...

不能。说明优化不够充分,看
Gaussian中几何优化收敛后Freq时出现NO或虚频的原因和解决方法
http://sobereva.com/278
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-27 22:35:31 | 只看该作者 Only view this author
329678001 发表于 2017-12-27 20:43
我在文献中看到氧空位形成能,1.不太清楚这个形成能到底是用什么能量算的、2算形成能是把氧原子扣掉,然后 ...

这属于固体问题,在第一性原理版发帖问为宜
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发表于 Post on 2017-12-27 23:59:23 | 只看该作者 Only view this author
卢老师,请问您一个问题
我在用casscf计算一个结构基态(UNO2,其中U三个单电子,O2两个单电子),结果能量震荡,一直在E-4 ~ E-5之间震荡。
体系有五个单原子,分别分布在五个轨道中。
请问应该如何才能收敛
谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-28 03:22:33 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2017-12-27 23:59
卢老师,请问您一个问题
我在用casscf计算一个结构基态(UNO2,其中U三个单电子,O2两个单电子),结果能 ...

没有什么方法能保证绝对收敛
尝试不同活性空间,用不同初猜轨道等都可能有帮助
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发表于 Post on 2017-12-28 10:45:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-28 03:22
没有什么方法能保证绝对收敛
尝试不同活性空间,用不同初猜轨道等都可能有帮助

谢谢老师

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发表于 Post on 2017-12-29 09:55:29 | 只看该作者 Only view this author
sob老师   高斯用CCSD/cc-pvtz能算单点能嘛   为啥其算出来的能量比我用密度泛函算的能量还要高  我算的是六重态的Feo+

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发表于 Post on 2017-12-29 11:24:22 | 只看该作者 Only view this author
sob好,研究单个药物分子的结构特性,可以从哪些方面进行分析呢?谢谢老师

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发表于 Post on 2017-12-29 11:33:59 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 steven 于 2017-12-29 12:54 编辑

老师,我在气相下优化出一个分子,然后加上隐式溶剂模型水中算一个单点,我可以说该分子在水中的电子能量大概是多少。
那同样情况如果我用显式溶剂模型或者杂化溶剂模型的话,这时它们变成了一个整体,我该怎么得出(或者说能得出么)单独这个分子在水中的电子能量呢?

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发表于 Post on 2017-12-29 15:15:22 | 只看该作者 Only view this author

三重态能量怎么计算?

新手想请问下类似如图,三线态能量2.9eV是怎么计算得到的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-29 19:07:35 | 只看该作者 Only view this author
w33 发表于 2017-12-29 15:15
新手想请问下类似如图,三线态能量2.9eV是怎么计算得到的

这种表述极为不严谨,混淆了三重态的绝对能量和三重态的发射能。
如果指T1->S0的发射(磷光),怎么算看
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314
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