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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2018-1-16 10:22:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-1-16 09:39
G09w明明是运行输入文件的,怎么是创建输入文件的?
gview保存输入文件,然后让G09运行,搞明白这个基 ...

嗯明白了,谢谢老师。

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发表于 Post on 2018-1-16 11:03:49 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,分析原子轨道,要怎样确定原子轨道朝向呢?是不是在优化时关键词加上nosymm就好了? 已经优化好了的结构但没有加nosymm,能不能提取结构再算个单点呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-16 15:12:31 | 只看该作者 Only view this author
不懂计算 发表于 2018-1-16 11:03
sob老师,分析原子轨道,要怎样确定原子轨道朝向呢?是不是在优化时关键词加上nosymm就好了? 已经优化好了 ...

我不清楚你打算以何种方式分析原子轨道、具体分析什么、原子轨道以什么方式表现。这跟nosymm没直接关系
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2018-1-16 16:30:41 | 只看该作者 Only view this author

有关def2-svp的问题

想请教各位老师,本人最近在计算的时候,用到b3lyp/def2-svp这个基组泛函,但是在高斯上面计算的时候,写成b3lyp/def2-svp就无法正常结束,而写成b3lyp/def2svp的时候就可以,个人感觉中间的横线是没有影响的,但是为啥会出现这样的现象呢,还望指导,谢谢!

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发表于 Post on 2018-1-16 16:34:36 | 只看该作者 Only view this author
def2-SVP不符合高斯的语法

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发表于 Post on 2018-1-16 16:39:18 | 只看该作者 Only view this author
你应该好好看看Gaussian的说明书,关键词该怎么写就怎么写。Gaussian不区分大小写,但不代表你就可以乱写!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-16 17:34:56 | 只看该作者 Only view this author
小小财 发表于 2018-1-16 16:30
想请教各位老师,本人最近在计算的时候,用到b3lyp/def2-svp这个基组泛函,但是在高斯上面计算的时候,写成 ...

不要瞎猜,仔细看手册,不要自编关键词
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发表于 Post on 2018-1-16 20:38:00 | 只看该作者 Only view this author
老师,我最近在研究键的强弱。我看课题组发的文章是用的wiberg键级。1.我已经优化了结构,但是没有保留chk文件。我现在是重新计算一下freq,导出fchk,然后再mulitiwfn查看,还是直接算一个wiberg呢?关键词是直接用pop=NBO么?2.wiberg bond order和wiberg bond index不一样么?我怎么有点分不清楚呢。

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发表于 Post on 2018-1-16 20:54:18 | 只看该作者 Only view this author
请问下g09里的PCM模型可以使用混合溶剂吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-16 21:03:08 | 只看该作者 Only view this author
函数与激情 发表于 2018-1-16 20:54
请问下g09里的PCM模型可以使用混合溶剂吗?

可。看
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-16 21:04:31 | 只看该作者 Only view this author
329678001 发表于 2018-1-16 20:38
老师,我最近在研究键的强弱。我看课题组发的文章是用的wiberg键级。1.我已经优化了结构,但是没有保留chk ...

重算个单点就有fch文件了
wiberg bond order和wiberg bond index完全是一码事
键级的基础知识看Multiwfn手册3.11节
算Mayer键级,甭算Wiberg键级,计算例子看Multiwfn手册4.8节
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发表于 Post on 2018-1-16 23:18:00 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,使用gentor、molclus等程序时,对应不同的基底和泛函所找到势能面上的各种极小点是不是会不同?如果不同的话怎么处理比较好?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-16 23:24:08 | 只看该作者 Only view this author
ccccn345 发表于 2018-1-16 23:18
请问老师,使用gentor、molclus等程序时,对应不同的基底和泛函所找到势能面上的各种极小点是不是会不同? ...

那叫基组不叫基底
显然会不同,根据基本知识、经验,选择对当前体系性可靠而且耗时可以接受的计算级别
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发表于 Post on 2018-1-17 00:01:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-1-16 23:24
那叫基组不叫基底
显然会不同,根据基本知识、经验,选择对当前体系性可靠而且耗时可以接受的计算级别

不好意思,打错了,谢谢老师

那如果先选用耗时少的小基组,再换用大基组时出现了极小点变化而几何结构也变化的情况,是不是就只能直接从大基组试起了?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-17 10:20:40 | 只看该作者 Only view this author
ccccn345 发表于 2018-1-17 00:01
不好意思,打错了,谢谢老师

那如果先选用耗时少的小基组,再换用大基组时出现了极小点变化而几何结构 ...

“小基组”指的是能给你定性正确的较小的基组,如果连6-31G这样定性正确都难以保证,都没法作为“小基组”来在实际中用。
几何优化不需要大基组,具体看
浅谈为什么优化和振动分析不需要用大基组
http://sobereva.com/387
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