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楼主 Author: sobereva
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发表于 Post on 2016-1-16 22:47:38 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好!想请教您:高斯能不能对混合溶剂进行SCRF计算?应该如何计算?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-16 22:50:05 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2016-1-16 22:47
sob老师您好!想请教您:高斯能不能对混合溶剂进行SCRF计算?应该如何计算?

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-1-16 22:51:35 | 只看该作者 Only view this author
IRC路径分析,设定为#p irc=(lqa,maxpoints=60,calcall,stepsize=10,maxcyc=400) b3lyp/6-31g(d) nosymm 。明显没有走完,请问这个怎么解决呢?

Y~F_%C@C8RE6LHA`CGG]0MX.png (10.81 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

IRC

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-16 22:52:46 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2016-1-16 22:51
IRC路径分析,设定为#p irc=(lqa,maxpoints=60,calcall,stepsize=10,maxcyc=400) b3lyp/6-31g(d) nosymm 。 ...


怎么叫“明显”?
明显几乎已经走完了才对。

PS:
maxcyc=400是完全多余的
nosymm也是多余的,走IRC本身就默认用nosymm
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发表于 Post on 2016-1-17 09:22:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-16 22:52
怎么叫“明显”?
明显几乎已经走完了才对。

PS内容学生谨记,对于IRC路径曲线,我设定各走30步,但是图中只是走了几个点,所有我认为是不是没走完啊?

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发表于 Post on 2016-1-17 09:23:47 | 只看该作者 Only view this author
sob老师!如何按照体积混合比例来自定义溶剂,输入文件该怎么写?(比如甲醇和乙醇以1:2的体积混合)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-17 10:16:03 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2016-1-17 09:23
sob老师!如何按照体积混合比例来自定义溶剂,输入文件该怎么写?(比如甲醇和乙醇以1:2的体积混合)

混合溶剂的eps=甲醇的eps *1/3 + 乙醇的eps*2/3
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-17 10:17:01 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2016-1-17 09:22
PS内容学生谨记,对于IRC路径曲线,我设定各走30步,但是图中只是走了几个点,所有我认为是不是没走完啊 ...

IRC是连接两个相邻极小点的,总长度是有限的,所以走到你设的步数之前发现已经走到极小点自动就结束了
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发表于 Post on 2016-1-17 11:15:09 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好!能不能再问您一个问题:过渡金属配合物基态优化有时出现L502错误,如果使用scf=xqc,网上说可能优化得到的态不是能量最低的基态,这该怎么办?它对优化的结构有没有影响?对催化反应能垒有没有影响?

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发表于 Post on 2016-1-17 15:19:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-17 10:17
IRC是连接两个相邻极小点的,总长度是有限的,所以走到你设的步数之前发现已经走到极小点自动就结束了

我还以为走到极小值点后那个曲线会是平坦的直线呢?这样一目了然走到极小值点了。现在明白了,谢谢老师!

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发表于 Post on 2016-1-17 15:44:35 | 只看该作者 Only view this author

打开chk文件出错

请教:
打开chk文件出错,出错信息如下图:
[img]file:///C:\Documents and Settings\Administrator\Application Data\Tencent\Users\137871525\QQ\WinTemp\RichOle\`$I[RP~375Z65J5Y$}K5YVM.png[/img]
请问是什么原因?怎么解决呢?
谢谢

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发表于 Post on 2016-1-17 18:01:59 | 只看该作者 Only view this author
你要打开CHK文件干啥?

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发表于 Post on 2016-1-17 22:17:29 | 只看该作者 Only view this author

希望大家指点

本帖最后由 498746012 于 2016-4-8 14:35 编辑

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发表于 Post on 2016-1-17 23:49:44 | 只看该作者 Only view this author
1. 打开文献时用菜单里的 file-open,弹出的OpenFiles对话框中选中最下方Read Intermediate...复选框
2. 阅读http://sobereva.com/269 第五节

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-18 00:14:59 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2016-1-17 22:17
各位计算量化的前辈
        好!我想请教两个问题:一是,如何得到中间体优化过程中的优化曲线,我gaussv ...

cube文件是一种容器格式,可以记录各种三维实空间函数,如分子轨道、电子密度、ELF、静电势在空间中的分布,见
Gaussian型cube文件简介及读、写方法和简单应用
http://sobereva.com/125

问题不在于生成cube文件,而是生成记录了什么样函数的cube文件。
Multiwfn是计算格点数据、生成cube文件最好的工具,见Multiwfn手册4.5节的一些例子。进主功能5,选择要计算的函数以及格点设定,算完后有选项可以将格点数据导出为cube文件
虽然高斯自带的cubegen也能计算一些实空间函数并输出cube文件,但是速度比Multiwfn慢得多,支持的函数还少,用起来还麻烦。

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