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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-10 01:34:35 | 只看该作者 Only view this author
yezhonghua 发表于 2016-1-9 22:53
我再计算UV或者S0优化的时候,高斯计算没有结束就终止了,log文件也没有报错:我总共遇到下面 ...

高斯bug或者机子不稳定
先换成D.01再试
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发表于 Post on 2016-1-10 05:05:44 | 只看该作者 Only view this author
Gaussian中,fchk文件是否包括了二进制chk文件的所有(常用)信息,即是不是转了fchk就可以删掉chk了?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-10 05:14:44 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-1-10 05:05
Gaussian中,fchk文件是否包括了二进制chk文件的所有(常用)信息,即是不是转了fchk就可以删掉chk了?


转换时只包含了比较有用的信息,一部分没用的信息会略过。chk之后可以删
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发表于 Post on 2016-1-11 18:04:54 | 只看该作者 Only view this author
请问
1、显性溶剂模型中如何寻找过渡态呢?
2、能不能如此计算:通过隐式溶剂模型找到过渡态并计算其能量,在通过显性模型找到底物的能量,通过这个计算出活化能呢?(底物不溶,必须用显;过渡态结果溶解性应该大,所以用了隐)

新手自学,表述不当之处还请见谅

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-11 20:11:44 | 只看该作者 Only view this author
fankui1990129 发表于 2016-1-11 18:04
请问
1、显性溶剂模型中如何寻找过渡态呢?
2、能不能如此计算:通过隐式溶剂模型找到过渡态并计算其能量 ...

1 照样找,只不过这时候比较麻烦,得考虑溶剂分子,有时候会碍事。
2 很难搞。都用隐式就完了。这和溶不溶没关系。
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发表于 Post on 2016-1-11 22:53:01 | 只看该作者 Only view this author
求助:动态相关与静态相关的定义。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-12 00:10:17 | 只看该作者 Only view this author
14xlliu 发表于 2016-1-11 22:53
求助:动态相关与静态相关的定义。


在A Chemist's Guide to Density Functional Theory 2ed里有不少讨论
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发表于 Post on 2016-1-12 09:50:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-12 00:10
在A Chemist's Guide to Density Functional Theory 2ed里有不少讨论

谢谢。

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发表于 Post on 2016-1-12 17:12:37 | 只看该作者 Only view this author
激发态的特定态计算,怎么判断应该关注那个态即root=?,是根据振子强度大小吗

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发表于 Post on 2016-1-12 19:10:00 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 bomsaude 于 2016-1-12 11:33 编辑

请教大家几个高斯和gaussview的小问题:

1. 对于有多步任务的高斯输入文件,gaussview如何显示link1中的分子结构?对于此文件的高斯输出文件,gaussview如何显示开始几步任务的分子结构?也就是说,多步任务的输入文件,gaussview我只看到了第一步任务的分子结构,它的输出文件,只看到了最后一步任务的分子结构。

2. 高斯优化的结果,如何观看其各步能量变化的曲线?扫描时的结果在gaussview中可以观看。

3. gaussview中"Results"中的"Optimization"选项,什么输出文件才能将其激活?刚才看别人的输出文件似乎可以显示,可能是我的系统的原因。

谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-12 21:12:19 | 只看该作者 Only view this author
14xlliu 发表于 2016-1-12 17:12
激发态的特定态计算,怎么判断应该关注那个态即root=?,是根据振子强度大小吗

先弄清楚到底想算什么问题
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314

诸如荧光,一般算S1,所以root=1。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-12 21:14:18 | 只看该作者 Only view this author
bomsaude 发表于 2016-1-12 19:10
请教大家几个高斯和gaussview的小问题:

1. 对于有多步任务的高斯输入文件,gaussview如何显示link1中的 ...

1 只能如此。要么就别用link1,而单独写成不同的输入文件批量运行
2、3 打开文件窗口下方选read intermediate geometries,这样读取优化任务输出文件才会把每一帧都载入
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发表于 Post on 2016-1-12 22:33:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-12 13:14
1 只能如此。要么就别用link1,而单独写成不同的输入文件批量运行
2、3 打开文件窗口下方选read interme ...

非常感谢!原先在打开opt优化结果文件时,从来没选过那个选项,所以,optimization总是灰色的。

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面壁者

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发表于 Post on 2016-1-13 09:57:05 | 只看该作者 Only view this author
@Sobereva Sob老师,请问在计算激发能的时候,如果激发能数值上已经高于电离能(ionization energy),此时的激发态是否还有意义(因为电子会被电离掉而不是跃迁到更高轨道??)

书上通常所说的里德堡态,是指的激发能高于电离能的激发态吗??
谢谢。
通过忠实地映射宇宙来隐藏自我,是融入永恒的唯一途径。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-13 17:13:30 | 只看该作者 Only view this author
AMolPC 发表于 2016-1-13 09:57
@Sobereva Sob老师,请问在计算激发能的时候,如果激发能数值上已经高于电离能(ionization energy),此时的 ...

高于垂直电离能的激发能就没物理意义了
里德堡态是指激发到很弥散的轨道上,见此文
图解电子激发的分类
http://sobereva.com/284
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