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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-20 02:29:50 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2016-1-19 22:51
各位量子化学的前辈:
    大家好!请问哪里可以找到国外量子化学的视频?

你可以到youtube上搜搜
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2016-1-20 09:07:13 | 只看该作者 Only view this author
谢谢sob老师

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发表于 Post on 2016-1-20 09:14:37 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2016-1-19 22:51
各位量子化学的前辈:
    大家好!请问哪里可以找到国外量子化学的视频?

Youtube,Mooc
Youtube 上有个 Sherrill Group的课,十分简明,可以用来入门

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发表于 Post on 2016-1-20 09:16:42 | 只看该作者 Only view this author
各位量子化学的前辈:
   大家好!我有疑问关于SCF计算,要求能量对系数的一阶导数为0,可能是极小值,n阶鞍点,极大值,高斯计算如何判断它是极小值?是不是也计算类似于几何优化的Hessian矩阵?既然SCF计算依赖于初始猜测,只能得到局域极小值而不是全局最小,如何得到全局最小(类似于几何优化可以找到它所有的异构体找到能量最低的)?如果得不到全局最小,SCF的能量是不是不可信,后面的几何优化是不是也不可信?

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发表于 Post on 2016-1-20 11:11:37 | 只看该作者 Only view this author
请问,对于K-Kr元素而言,可以考虑标量相对论效应,也可以不考虑标量相对论效应。那么对于K-K元素,什么特殊情况下必须考虑标量相对论效应?另外对于K-Kr,用全电子基组计算结果是否一定好于赝势基组?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-20 11:48:49 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2016-1-20 09:16
各位量子化学的前辈:
   大家好!我有疑问关于SCF计算,要求能量对系数的一阶导数为0,可能是极小值,n阶 ...

SCF的参数空间上极小点远没有势能面上那么多,绝大多数情况只要收敛,就会收敛到参数空间最小点。
如果怀疑收敛到了非极小点,可以做波函数稳定性测试(高斯里stable关键词)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-20 11:50:41 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2016-1-20 11:11
请问,对于K-Kr元素而言,可以考虑标量相对论效应,也可以不考虑标量相对论效应。那么对于K-K元素,什么特 ...

K-K元素指什么?
K-Kr不一定全电子基组就好于赝势基组,具体看用的是哪种。是否考虑标量相对论效应都可以。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-1-20 12:00:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-20 11:50
K-K元素指什么?
K-Kr不一定全电子基组就好于赝势基组,具体看用的是哪种。是否考虑标量相对论效应都可 ...

谢谢老师!

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发表于 Post on 2016-1-20 14:49:23 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-1-20 09:14
Youtube,Mooc
Youtube 上有个 Sherrill Group的课,十分简明,可以用来入门

谢谢前辈

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发表于 Post on 2016-1-20 14:50:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-20 11:48
SCF的参数空间上极小点远没有势能面上那么多,绝大多数情况只要收敛,就会收敛到参数空间最小点。
如果 ...

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2016-1-20 19:31:24 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,我想请教您一个问题。
在计算一个络合物的NBO时,计算出错,输出文件末尾如下
Subroutine NAOANL could not find a S-type core orbital on atom  S   22.
ICORE :  2  1  0  0     M :  1     LA :  1
Error
Error termination via Lnk1e in /littleboy/g09/l607.exe at Wed Jan 20 10:21:59 2016.
请问这是怎么回事?如何来解决呢?
谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-20 20:06:30 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2016-1-20 19:31
sob老师,我想请教您一个问题。
在计算一个络合物的NBO时,计算出错,输出文件末尾如下
Subroutine NAOA ...

换基组
如果用了赝势别用赝势
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-1-20 21:41:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-20 20:06
换基组
如果用了赝势别用赝势

可是我用了锕系元素啊,而且通篇都用的是ECP60MWB这个基组和赝势,如果换了其他的结果咋办啊

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-21 05:23:31 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2016-1-20 21:41
可是我用了锕系元素啊,而且通篇都用的是ECP60MWB这个基组和赝势,如果换了其他的结果咋办啊


那就用更新的NBO版本
这是老版本的bug
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发表于 Post on 2016-1-22 23:15:26 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师您好,请问在利用Iop让高斯输出Overlap matrix的时候,能不能通过一些命令让它输出一个标准的N*N方阵(N是基函数数目),而不是像默认的那样,每输出5列矩阵元素就换行了,不方便选取整个矩阵做进一步运算??

谢谢!
通过忠实地映射宇宙来隐藏自我,是融入永恒的唯一途径。

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