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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2018-5-2 20:57:47 | 只看该作者 Only view this author
请问,一个反应,存在两条反应途径A和B,当两条途径的势垒差值是多少时就可以说该反应只能按其中一条途径进行?有没有相关的资料呢?
另外,如何通过能垒来计算两条途径对应的产率呢?

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发表于 Post on 2018-5-2 20:59:42 | 只看该作者 Only view this author

几何优化问题

请教各位老师,利用SMD模型、M05-2X/6-31G*计算溶解自由能时,进行气相结构优化的时候,也需要使用同样的方法和基组吗?即也需要在M05-2X/6-31G*的条件下进行优化吗?
谢谢各位老师!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-2 21:17:07 | 只看该作者 Only view this author
lily1970 发表于 2018-5-2 20:59
请教各位老师,利用SMD模型、M05-2X/6-31G*计算溶解自由能时,进行气相结构优化的时候,也需要使用同样的方 ...

没这个要求
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-2 21:17:39 | 只看该作者 Only view this author
haha 发表于 2018-5-2 15:37
sobereva老师 对于自由基想计算三重态 在开壳层ub3lyp下设置triplets 还要改成0 3吗

你这体系电子数肯定是奇数,不可能有三重态,只能是二重态、四重态、六重态...
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-2 21:18:38 | 只看该作者 Only view this author
一直在路上 发表于 2018-5-2 20:57
请问,一个反应,存在两条反应途径A和B,当两条途径的势垒差值是多少时就可以说该反应只能按其中一条途径进 ...


跟温度有关
根据实际温度和自由能垒,按照过渡态理论计算两条路径的k,对比一下便知
动力学据控制的时候,相对产率也正比于k的相对比率
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发表于 Post on 2018-5-3 00:23:35 | 只看该作者 Only view this author
请问如果要考察分子内反应活性位点,是结合离子和中性状态的密度差图分析还是静电势图考察更好呢,计算简缩福井函数与双描述符对于这种情况哪个更能说明这个问题呢?谢谢老师。
自己决定自己的DNA

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-3 00:44:53 | 只看该作者 Only view this author
QuantumHan 发表于 2018-5-3 00:23
请问如果要考察分子内反应活性位点,是结合离子和中性状态的密度差图分析还是静电势图考察更好呢,计算简缩 ...

ALIE、双描述符、福井函数、Hirshfeld电荷都算算,如果结论相同,那是最好。如果有所不同,优先侧重双描述符的结果
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发表于 Post on 2018-5-3 08:14:28 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,我想计算图中N-S键断键的过渡态,我用scan拉长N-S键,企图使分子的两部分分开,但是scan拉长到3埃的时候,虽然N-S键发生断键,但分子的两部分并没有明显的分离,其他原子因为没有限制键长而结合在一起。当我用scan里的能量最高点作为初猜找过渡态,做IRC得到的产物并不是分子分离后的两部分,虽然N-S键断裂了,但是两部分的其他化学键又会成键。对于断裂化学键找过渡态应该怎么找呢?

111.jpg (3.62 KB, 下载次数 Times of downloads: 36)

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222.jpg (3.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 44)

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发表于 Post on 2018-5-3 09:45:03 | 只看该作者 Only view this author
由轨道对称性如何确定电子态?
如开壳层体系:
Orbital symmetries:
Alpha Orbitals:
       Occupied  (A1) (A1) (B2) (B1) (A1)
       Virtual   (A1) (B2)
Beta  Orbitals:
       Occupied  (A1) (A1) (B2) (A1)
       Virtual   (B1) (A1) (B2)
The electronic state is 2-B1.

闭壳层体系:
Orbital symmetries:
       Occupied  (A) (A) (T) (T) (T)
       Virtual   (A) (T) (T) (T) (T) (T) (T) (A) (T) (T) (T) (T)
                 (T) (T) (A) (A) (E) (E) (T) (T) (T) (T) (T) (T)
                 (T) (T) (T) (A) (E) (E) (T) (T) (T) (T) (T) (T)
                 (A) (T) (T) (T) (A)
The electronic state is 1-A.

如何确定开壳层体系的electronic state为2-B1,闭壳层体系的electronic state为 1-A。

谢谢!!

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发表于 Post on 2018-5-3 15:29:22 | 只看该作者 Only view this author
sob l老师   我看了篇文献(过渡金属氧化离子和甲烷反应的研究),它对过渡金属是自己定义基组,对C  H  O就直接使用pople基组   请问下过渡金属用pople系列基组描述为什么不合适

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-3 16:25:49 | 只看该作者 Only view this author
yangjianfeng 发表于 2018-5-3 15:29
sob l老师   我看了篇文献(过渡金属氧化离子和甲烷反应的研究),它对过渡金属是自己定义基组,对C  H  O ...

没法简单说不合适,也不要盲目效仿别人
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-3 16:26:57 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2018-5-3 09:45
由轨道对称性如何确定电子态?
如开壳层体系:
Orbital symmetries:

闭壳层体系总为1-A
开壳层体系对占据轨道不可约表示做直积就行了。上头的例子只有B1没有配对的,因此电子态也是B1
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-3 16:28:59 | 只看该作者 Only view this author
万山红遍 发表于 2018-5-3 08:14
sob老师您好,我想计算图中N-S键断键的过渡态,我用scan拉长N-S键,企图使分子的两部分分开,但是scan拉长 ...

就别scan了,直接把S-N距离拉长大概1/3,作为初猜找过渡态
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发表于 Post on 2018-5-3 17:14:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-5-3 16:25
没法简单说不合适,也不要盲目效仿别人

老师  那我过渡金属基组用def2tzvp  其他元素用pople系列基组行吗  会产生定性错误吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-3 17:15:55 | 只看该作者 Only view this author
yangjianfeng 发表于 2018-5-3 17:14
老师  那我过渡金属基组用def2tzvp  其他元素用pople系列基组行吗  会产生定性错误吗

如果没有特别的必要,也别两个基组混用
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