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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2018-10-1 18:51:53 | 只看该作者 Only view this author
金属氧化物吸附有机分子计算,体系比较大,opt和freq计算冻结金属氧化物,只对有机子进行opt和freq计算,那么IR光谱数据能使用吗?

谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-1 19:31:37 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2018-10-1 18:51
金属氧化物吸附有机分子计算,体系比较大,opt和freq计算冻结金属氧化物,只对有机子进行opt和freq计算,那 ...

看具体怎么冻的
不合理的冻结方式所得光谱没有意义,恰当冻结则可以用
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-1 19:34:26 | 只看该作者 Only view this author
刘小英雄steven 发表于 2018-10-1 17:04
老师我在柔性扫描时企图冻住两个键角,但是从输出文件上来看,好像然并卵,老师这是什么原因造成的呢。:d ...

明显已经生效了,诸如81-75-83一直保持在初始的90.07
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发表于 Post on 2018-10-1 20:17:34 | 只看该作者 Only view this author
老师,进行CDA分析的时候要把complex material分成fragment 1和fragment 2,frag1,frag2是通过化学键连接的,现在把他们分开生成fchk文件,是不是每一部分的电荷数按照每一部分的电荷数计算就可以(即frag1和frag2之间的化学键平分)?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-1 23:25:39 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2018-10-1 20:17
老师,进行CDA分析的时候要把complex material分成fragment 1和fragment 2,frag1,frag2是通过化学键连接的 ...

简单Multiwfn问题请在专门的帖子里咨询
http://bbs.keinsci.com/thread-10181-1-1.html
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发表于 Post on 2018-10-2 18:05:53 | 只看该作者 Only view this author
请问,给linux提交两个计算任务,不知道能不能区分哪个进程对应哪个计算的文件(chk,log)?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-2 22:02:19 | 只看该作者 Only view this author
lily19830130 发表于 2018-10-2 18:05
请问,给linux提交两个计算任务,不知道能不能区分哪个进程对应哪个计算的文件(chk,log)?

默认情况下chk的文件名就是Gau-pid号,通过pid号可以判断。log文件里也会体现当前的pid号。在top里可以看到pid号
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发表于 Post on 2018-10-3 11:44:21 | 只看该作者 Only view this author
请问怎样用热力学组合方法计算单原子热力学量,单原子会在优化步报错,用G4MP2和CBS-QB3都是如此。

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发表于 Post on 2018-10-3 13:29:25 | 只看该作者 Only view this author
请问,考虑溶剂化效应时,溶剂C6D6如何输入?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-3 13:48:09 | 只看该作者 Only view this author
一直在路上 发表于 2018-10-3 13:29
请问,考虑溶剂化效应时,溶剂C6D6如何输入?

和苯一样,隐式溶剂模型体现不出同位素的差别
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-3 13:48:58 | 只看该作者 Only view this author
h840473807 发表于 2018-10-3 11:44
请问怎样用热力学组合方法计算单原子热力学量,单原子会在优化步报错,用G4MP2和CBS-QB3都是如此。

G16里热力学组合方法多了noopt选项,可以跳过优化步骤
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发表于 Post on 2018-10-3 13:57:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-10-3 13:48
和苯一样,隐式溶剂模型体现不出同位素的差别

实验上用的是氘代的苯,如果用隐式模型计算的话就只能是C6H6了,这两个的计算值差别大吗?若是要想和实验更接近,就得考虑用显式溶剂模型,对吗老师?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-3 14:01:13 | 只看该作者 Only view this author
一直在路上 发表于 2018-10-3 13:57
实验上用的是氘代的苯,如果用隐式模型计算的话就只能是C6H6了,这两个的计算值差别大吗?若是要想和实验 ...

什么叫计算值?都已经说了隐式溶剂模型体现不出同位素的差别
看点隐式溶剂模型的资料,搞清楚基本计算原理
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发表于 Post on 2018-10-3 14:56:30 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,请问单电子近似得到的轨道能量和分子的电子能量(单点能)之间是什么关系?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-3 23:18:32 | 只看该作者 Only view this author
bangdage 发表于 2018-10-3 14:56
sob老师您好,请问单电子近似得到的轨道能量和分子的电子能量(单点能)之间是什么关系?

没有直接关系
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