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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-20 11:25:04 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2018-11-19 23:43
分析轨道时文献中出现dπ,dσ,dδ轨道,localized的轨道往往是混合的状态(D 0,D+1,D-1,D+2,D-2其中 ...

结合成份、图形,不难判断。
先看是单中心还是双中心的。如果是双中心为主要特征,又是轴对称的,肯定是sigma。如果沿着键轴有个节面,肯定是pi。如果几乎都是D基函数参与的,从图上看又有两个节面,肯定是delta
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2018-11-20 16:13:59 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Accelerator 于 2018-11-20 17:28 编辑

用GFN2-xtb和Gaussian对相同构型的氢气分子计算梯度,发现结果差异很大。
xtb给出的梯度:
0.4253656550059D-03   0.5018756576442D-03   0.2115390763236D-01
  -0.4253656550059D-03  -0.5018756576442D-03  -0.2115390763236D-01
B3LYP/6-31G*下的梯度:
-0.000914051   -0.001078460   -0.045456661
0.000914051    0.001078460    0.045456661
可见不仅数量相差接近一倍 连符号都反了(并不是因为不同势能面上极小值点不同的影响 之后测试键长为2 A时同样有类似的情况)
这个是因为xtb输出的问题(例如单位和符号指定和Gaussian不同),还是xtb的bug?Gaussian输出文件附上

H2.log

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发表于 Post on 2018-11-20 17:20:10 | 只看该作者 Only view this author

请问SAC-CI计算卟吩时遇到L301错误怎么解决?

请问SAC-CI计算卟吩时遇到L301错误怎么解决?

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发表于 Post on 2018-11-20 17:52:50 | 只看该作者 Only view this author
用了Gen没有在该有的位置写基组声明

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发表于 Post on 2018-11-20 18:07:31 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 努力努力再努力 于 2018-11-20 18:10 编辑
liyuanhe211 发表于 2018-11-20 17:52
用了Gen没有在该有的位置写基组声明

请问 一下具体该怎么写?

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发表于 Post on 2018-11-20 20:50:58 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2018-11-20 17:52
用了Gen没有在该有的位置写基组声明

找到原因了 谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-20 21:30:37 | 只看该作者 Only view this author
Accelerator 发表于 2018-11-20 16:13
用GFN2-xtb和Gaussian对相同构型的氢气分子计算梯度,发现结果差异很大。
xtb给出的梯度:
0.4253656550 ...

这几天忙着Multiwfn培训班的事没时间仔细看,原因不好说。可能一个是梯度一个是受力,一个埃-1一个Bohr-1。再测试、对比吧,肯定能弄清楚
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发表于 Post on 2018-11-20 22:02:59 | 只看该作者 Only view this author
老师好。
请问,有木有PSI4在Linux下的安装教程之类的呀。想用SAPT方法进行下能量分解。
谢谢老师回答。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-21 00:23:55 | 只看该作者 Only view this author
she 发表于 2018-11-20 22:02
老师好。
请问,有木有PSI4在Linux下的安装教程之类的呀。想用SAPT方法进行下能量分解。
谢谢老师回答。
...

官网上写得很明白。下载,然后./运行那个包,按提示操作就完了
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发表于 Post on 2018-11-26 20:11:22 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,用windows系统中xmanager软件在CRT中连接服务器打开linux版gview,打开文件分子转动卡顿,请问如何解决?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-27 10:31:55 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2018-11-26 20:11
请问老师,用windows系统中xmanager软件在CRT中连接服务器打开linux版gview,打开文件分子转动卡顿,请问如 ...

远程图形登录也就显示个2D画面还行,3D画面就别指望了(可能服务器的显卡本身没什么3D加速能力,可能网络传输速度问题,也可能xmanager本身问题)
还是在本机用吧
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发表于 Post on 2018-11-27 11:06:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva老师,我用CASSCF算自由基O=N-OCH2CH2O,选取的活性空间包括了O以及ONO的轨道,但是结果都是O的跃迁,不存在ONO的跃迁,是不是cas方法只可以算未成对电子活性自由基

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发表于 Post on 2018-11-27 16:23:10 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 DUNING 于 2018-11-27 19:53 编辑

老师好,我用Gaussian算出来的第一激发态的发射能是负值,看了您之前的帖子,也尝试了用stable=opt关键词找正确的基态波函数,提示是“The wavefunction is already stable”.然后做激发态计算的时候写guess=read读取其作为初猜波函数,结果算着算着激发能还是成了负值。请问老师这是怎么回事?

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发表于 Post on 2018-11-27 21:30:50 | 只看该作者 Only view this author
请问老师:在Dalton中计算旋轨耦合常数和三重态寿命的时候需要加入溶剂吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-27 21:56:22 | 只看该作者 Only view this author
DUNING 发表于 2018-11-27 16:23
老师好,我用Gaussian算出来的第一激发态的发射能是负值,看了您之前的帖子,也尝试了用stable ...

如果是激发态优化任务,先确认第一步的激发能是正的
如果就是单个结构下激发态计算任务,确保和stable=opt计算级别一致
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