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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2016-3-4 21:03:15 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 liyuanhe211 于 2016-3-4 21:05 编辑

这不是错误提示。确认进程确实结束了的话考虑是什么外力把程序终止了,比如被排队软件停了,看再算一次(从当前数据点restart)能不能行。

不要用scf=maxcyc=500

oniompcm=x 多余,本来就默认
(其实solvent=water 也多余,不过个人感觉写上提示一下也有好处)



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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-4 21:51:49 | 只看该作者 Only view this author
jhlwc545454 发表于 2016-3-4 20:37
回复在856、857L

输入文件是

856L已经回复了一部分。
6-311G根本没法用,都3-zeta了还不加极化函数一定会被审稿人批评。一般计算任务基组的底限是6-31G*。
你既然都没写genecp用自定义基组和赝势,你在坐标后面还对不同元素自定义基组/赝势,这是完全多余的。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-3-4 22:32:49 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-3-4 21:03
这不是错误提示。确认进程确实结束了的话考虑是什么外力把程序终止了,比如被排队软件停了,看再算一次(从 ...

可是不增大步数的话就停在中间不动了。。。

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发表于 Post on 2016-3-4 22:37:21 | 只看该作者 Only view this author
jhlwc545454 发表于 2016-3-4 22:32
可是不增大步数的话就停在中间不动了。。。

啥叫停在中间不动

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发表于 Post on 2016-3-4 23:09:32 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-3-4 22:37
啥叫停在中间不动

就是这样的

~LXG`2)DSA03VT{@DOX[V`J.png (309.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 29)

~LXG`2)DSA03VT{@DOX[V`J.png

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发表于 Post on 2016-3-4 23:10:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-4 21:51
856L已经回复了一部分。
6-311G根本没法用,都3-zeta了还不加极化函数一定会被审稿人批评。一般计算任务 ...

sob老师不好意思,是我前面写错了,当时运行前输入的文件是%chk=C:\Users\Administrator\Desktop\single1.chk
----------------------------------------------------------------------
# opt=cartesian oniom(b3lyp/genecp:uff) scrf=(iefpcm,solvent=water,oni
ompcm=x) geom=connectivity scf=maxcyc=500

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-4 23:32:12 | 只看该作者 Only view this author

这跟步数上限根本没直接关系,上限设那么大丝毫意义都没有,只可能出现难收敛、震荡的情况时白浪费时间还继续算
2070这种错误是你输入文件写得不对
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发表于 Post on 2016-3-4 23:36:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-4 23:32
这跟步数上限根本没直接关系,上限设那么大丝毫意义都没有,只可能出现难收敛、震荡的情况时白浪费时间还 ...

那么后来加了步数出现
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
的原因还是输入文件写的不对吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-4 23:47:33 | 只看该作者 Only view this author
jhlwc545454 发表于 2016-3-4 23:36
那么后来加了步数出现
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Be ...

输入输出文件压缩后传上来一看就明白
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-3-5 03:05:21 | 只看该作者 Only view this author

高斯301错误-Unrecognized potential number 6 in GetPot.

错误提示301-Unrecognized potential number           6 in GetPot. 输入文件已附上。 多谢各位~

SWNT8-0 CPE.gjf

15.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 11

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-5 06:55:28 | 只看该作者 Only view this author
lei234 发表于 2016-3-5 03:05
错误提示301-Unrecognized potential number           6 in GetPot. 输入文件已附上。 多谢各位~

仔细看此文
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
http://sobereva.com/60

你没用赝势,就不要写genecp,应当写gen

自定义基组之间不要有空行
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发表于 Post on 2016-3-5 20:38:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-4 23:47
输入输出文件压缩后传上来一看就明白

输入输出文件在附件里,sob老师帮我看看吧

single输出.txt

4.04 MB, 下载次数 Times of downloads: 2

single输入.txt

4.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-6 02:08:40 | 只看该作者 Only view this author
jhlwc545454 发表于 2016-3-5 20:38
输入输出文件在附件里,sob老师帮我看看吧


基组定义严重不合理。都没给碳定义基组,而且O和P用的6-31G太烂。

PS:当附件较大,对于文本文件来说(如Gaussian输出文件),应当先压缩一下再传,这样能显著减少附件下载耗时,并节省论坛空间资源。
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发表于 Post on 2016-3-7 17:28:15 | 只看该作者 Only view this author
各位量化的前辈:
    好!想问一个问题:高斯进行TDDFT计算的步骤有几步?分别是什么?(类似于hartree fock计算那样猜测分子轨道系数,进行Roothaan方程计算。进行迭代,直到密度矩阵基本不变)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-3-7 20:51:56 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2016-3-7 17:28
各位量化的前辈:
    好!想问一个问题:高斯进行TDDFT计算的步骤有几步?分别是什么?(类似于hartree f ...

先照常做基态DFT计算得到DFT轨道和能量,然后根据现成公式构建TDDFT哈密顿矩阵,通过Davidson迭代等方式求最低的一些根。
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