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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-17 23:20:53 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2019-8-17 22:21
请问老师,什么情况用垂直电离能,什么情况用绝热电离能?

二者实验都可以测,想和哪个对比就用哪个
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-8-17 23:37:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-8-17 23:20
二者实验都可以测,想和哪个对比就用哪个

谢谢老师!

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发表于 Post on 2019-8-17 23:37:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-8-17 23:20
二者实验都可以测,想和哪个对比就用哪个

谢谢老师!

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发表于 Post on 2019-8-18 16:41:50 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师好,看您的一些关于如何计算PKa和氧化还原电势的回答中,推荐采用热力学组合方法来进行计算,关键词直接写CBS-QB3就可以。现在我想计算一个Ag2O单体作为碱和氧化剂时的PKa和氧化还原电势,直接写CBS-QB3报错基组不涵盖Ag。想问下老师,这种情况下还能够利用热力学组合方法进行计算吗,如果可以的话用什么关键词呢?谢谢老师。

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发表于 Post on 2019-8-18 18:09:50 | 只看该作者 Only view this author
老师好,我优化一个单线态分子,做stable=opt显示不稳定,但会帮你优化到稳定的波函数,得到稳定波函数后会在out文件里面显示:<S**2>= 1.0402 S= 0.6359; S**2 before annihilation     1.0402,   after     0.6954。从这个信息上看不是说明体系中存在一个电子吗?但我这个是单线态,我该如何理解优化得到稳定波函数后显示S= 0.6359呢?

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发表于 Post on 2019-8-18 21:42:11 | 只看该作者 Only view this author
老师好,我在算氮杂环卡宾的自旋密度时,发现alpha单电子没有出现在目标C上,全都分散到了其他几个原子上,为何如此?关键词:# opt freq b3lyp/6-31g(d) em=gd3

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-19 11:08:04 | 只看该作者 Only view this author
Jameslzy 发表于 2019-8-18 16:41
Sob老师好,看您的一些关于如何计算PKa和氧化还原电势的回答中,推荐采用热力学组合方法来进行计算,关键词 ...

甭用热力学组合方法。以常规步骤计算溶液下自由能:
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-19 11:08:35 | 只看该作者 Only view this author
陈丢丢 发表于 2019-8-18 18:09
老师好,我优化一个单线态分子,做stable=opt显示不稳定,但会帮你优化到稳定的波函数,得到稳定波函数后会 ...

仔细看此文
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态
http://sobereva.com/82
CASSCF计算双自由基以及双自由基特征的计算
http://sobereva.com/264http://bbs.keinsci.com/thread-322-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-19 11:10:10 | 只看该作者 Only view this author
chenw 发表于 2019-8-18 21:42
老师好,我在算氮杂环卡宾的自旋密度时,发现alpha单电子没有出现在目标C上,全都分散到了其他几个原子上, ...

用stable关键词检测一下,看当前波函数是否稳定。也尝试其它计算级别,诸如M06-2X/def-TZVP。如果结果也如此,而且波函数稳定,说明此体系里单电子分布就是离域的,不能太想当然
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发表于 Post on 2019-8-19 15:17:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-8-19 11:08
甭用热力学组合方法。以常规步骤计算溶液下自由能:
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
...

好的了解了,谢谢Sob老师回复。那是不是可以理解为,只有主族元素存在的情况下还是用热力学组合方法更好。有过渡金属存在的时候由于热力学组合方法中的基组不支持,所以就以常规步骤计算了。

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发表于 Post on 2019-8-19 15:42:17 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,看到你回答一个帖子说加电场,坐标空一行写电场矢量。请问,如果一个分子的某个键键轴方向的电场矢量如何得到,如何书写?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-19 16:03:42 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2019-8-19 15:42
请问老师,看到你回答一个帖子说加电场,坐标空一行写电场矢量。请问,如果一个分子的某个键键轴方向的电场 ...

根据两个原子笛卡尔坐标,自然就知道矢量方向
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-19 16:04:15 | 只看该作者 Only view this author
Jameslzy 发表于 2019-8-19 15:17
好的了解了,谢谢Sob老师回复。那是不是可以理解为,只有主族元素存在的情况下还是用热力学组合方法更好 ...

有的热力学组合方法也支持过渡金属,但支持的元素很不全,而且也不是专门为过渡金属考虑的
最近出来的G4(MP2)-XK就支持过渡金属,此文末尾提了
高性价比热力学组合方法G4(MP2)-6X的计算方法
http://sobereva.com/419http://bbs.keinsci.com/thread-10096-1-1.html
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发表于 Post on 2019-8-19 17:38:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-8-19 16:03
根据两个原子笛卡尔坐标,自然就知道矢量方向

谢谢老师,请问老师坐标空一行后电场矢量方向输入文件格式如何写?谢谢!

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发表于 Post on 2019-8-19 19:58:00 | 只看该作者 Only view this author

求助溶剂化能分析

各位老师您好,我想分析分子在不同溶剂中的溶剂化能,看到一篇文章说的方法如下,但他用的是Gaussion03,我用的是Gaussion09,请问有相关操作博文吗?感谢各位老师!

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