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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2019-11-21 15:49:01 | 只看该作者 Only view this author
有单晶结构,计算单键的旋转势垒需要考虑溶剂效应不?
谢谢!

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发表于 Post on 2019-11-21 21:05:19 | 只看该作者 Only view this author

求助Dalton脚本

各位老师同学们,我最近刚接触Dalton程序,想知道该如何编写Dalton程序的运行脚本,希望能有一个具体的范例可以参考,谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-21 22:15:56 | 只看该作者 Only view this author
tiantianl 发表于 2019-11-21 21:05
各位老师同学们,我最近刚接触Dalton程序,想知道该如何编写Dalton程序的运行脚本,希望能有一个具体的范例 ...

量子化学程序Dalton的编译方法和运行方式简介
http://sobereva.com/463http://bbs.keinsci.com/thread-12120-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-21 22:16:14 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2019-11-21 15:49
有单晶结构,计算单键的旋转势垒需要考虑溶剂效应不?
谢谢!

看具体旁边连的什么基团
能考虑建议总是考虑
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-21 22:17:53 | 只看该作者 Only view this author
白雪少年 发表于 2019-11-20 15:56
我想请教一下老师
1 实验上的一些变量,比如温度和压强可以在理论计算中考虑其影响。实验条件中的湿度,UV ...

量化研究的是微观过程,pH、湿度这种统计量没法体现,顶多在靠建模的时候以某种方式考虑。诸如湿度高的时候才反应的情况,建模时考虑是否让水参与反应

光照通过算激发态考虑

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白雪少年 + 1 谢谢

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发表于 Post on 2019-11-22 14:49:24 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,在PSI4中做SAPT时使用6-311+G(d,p) 基组计算简单的离子液体之间相互作用是否合适,这里的SAPT计算不可以加D3校正,会不会不能准确反映色散力?

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发表于 Post on 2019-11-22 19:00:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-21 22:15
量子化学程序Dalton的编译方法和运行方式简介
http://sobereva.com/463(http://bbs.keinsci.com/thread ...

好的,谢谢!

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发表于 Post on 2019-11-22 20:13:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-21 22:16
看具体旁边连的什么基团
能考虑建议总是考虑

谢谢!

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发表于 Post on 2019-11-23 01:42:12 | 只看该作者 Only view this author
老师您好!我想请教一下对磷叶立德做计算时是否需要加弥散?(磷叶立德结构见下图,是一种内鎓盐)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-23 07:36:20 | 只看该作者 Only view this author
haos314 发表于 2019-11-23 01:42
老师您好!我想请教一下对磷叶立德做计算时是否需要加弥散?(磷叶立德结构见下图,是一种内鎓盐)

不用
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-23 07:37:16 | 只看该作者 Only view this author
陌上花开小伟 发表于 2019-11-22 14:49
请问老师,在PSI4中做SAPT时使用6-311+G(d,p) 基组计算简单的离子液体之间相互作用是否合适,这里的SAPT计 ...

不适合
PSI4充分利用RI,而这个都没有标配的辅助基组
SAPT自然而然就把色散作用算出来了。你用SAPT之前应当先读一些基本的SAPT介绍

适合用什么参考
考察SAPT能量分解的能量项随分子二聚体间距变化的简单方法
http://sobereva.com/469http://bbs.keinsci.com/thread-12324-1-1.html
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度:一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
http://sobereva.com/513http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html
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发表于 Post on 2019-11-23 11:53:30 | 只看该作者 Only view this author
请问,如下图中所示混合基组的写法,我见到有的输入文件在元素名称后面写0,有的没写,请问这个0在这里有什么特殊作用吗?写和不写有区别吗?

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发表于 Post on 2019-11-23 14:23:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-23 07:37
不适合
PSI4充分利用RI,而这个都没有标配的辅助基组
SAPT自然而然就把色散作用算出来了。你用SAPT之前 ...

谢谢老师解答,读完老师列出的两篇文献后我觉得在SAPT中应该用B3LYP/aug-cc-pVQZ基组做能量分解计算,不知是否合适?

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发表于 Post on 2019-11-23 23:56:59 | 只看该作者 Only view this author
请问sob老师,有什么方法可以在gview里面搭建pb晶体的晶胞。仅仅当做图例可视化使用,不进行计算。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-24 00:25:34 | 只看该作者 Only view this author
343333333 发表于 2019-11-23 23:56
请问sob老师,有什么方法可以在gview里面搭建pb晶体的晶胞。仅仅当做图例可视化使用,不进行计算。

结合着自带的help玩玩它的PBC editor就知道了
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