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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-8 20:42:00 | 只看该作者 Only view this author
ABetaCarw 发表于 2020-1-8 11:36
社长,如何理解乙醇TD计算的fchk文件读取的轨道信息中有HOMO LUMO轨道占据数都还是2这个情况。不是有电子跃 ...

TDDFT就是基于基态分子轨道算的
这占据情况和TDDFT激发态情况完全没有对应关系

考察激发态波函数看
在Multiwfn中基于fch产生自然轨道的方法与激发态波函数、自旋自然轨道分析实例
http://sobereva.com/403http://bbs.keinsci.com/thread-9001-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-8 20:42:52 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2020-1-8 09:31
计算机配置16核,64G内存,进行DLPNO-CCSD(T)计算,体系约50个主簇元素原子,如何分配CPU和内存?是多核心 ...

看具体用什么基组
先16核都用,maxcore设3000,不行再说
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-8 20:44:54 | 只看该作者 Only view this author
wuzhiyi 发表于 2020-1-8 02:08
想问一下关于orca中双杂化泛函中mp2部分RI加速的写法
因为有些原因我要用DSD-PBEP86
于是我就照http://so ...

程序在这方面有一定含糊性,不同双杂化泛函默认的情况不同
对于具体方法,可以找个简单体系测试一下。不嫌麻烦就总写上RI-
PWPB95是肯定不需要非得写RI-的(写不写结果都一样,都会在MP2部分用RI)
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发表于 Post on 2020-1-8 21:03:41 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Theor_Comp 于 2020-1-9 13:09 编辑

使用morpro的CASTP2来优化分子的S0 S1 T1以及三重态对儿[TT].主要是优化[TT]时,怎么设置输入文件呀?

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发表于 Post on 2020-1-9 02:43:33 | 只看该作者 Only view this author

Gaussian error termination

Dear researchers,
I did the optimization of an organometallic compound, but the optimization failed and i got this error message (attached screenshot), i would like your opinion how to solve the failure. Please, it's urgent.



Sincerely,

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-9 03:35:30 | 只看该作者 Only view this author
aitouna 发表于 2020-1-9 02:43
Dear researchers,
I did the optimization of an organometallic compound, but the optimization faile ...

Since this problem is too common and I have replied many times in this forum, therefore I merged your topic into the present topic.

Simply using opt=cartesian instead of opt, the problem will be solved. There are also other solutions, while adding "Cartesian" is the simplest way and always works.
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发表于 Post on 2020-1-9 16:04:45 | 只看该作者 Only view this author
在单线态裂变过程中,涉及到了S0、S1、S2、S3以及T1、T2、T3等等,除此之外,还存在S1*-->(TT)1-->T1+T1,其中的(TT)1好像是需要用Caspt2处理。向大家求助,如何使用Molpro中的caspt2计算(TT)1态的能量以及扫描势能面。

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发表于 Post on 2020-1-9 20:01:37 | 只看该作者 Only view this author

用Win版Gaussian做计算时的默认核数和内存应当如何设置?

本帖最后由 jimulation 于 2020-1-9 20:04 编辑

http://sobereva.com/439 帖子中讲到,对于Linux版Gaussian,默认的CPU核数和内存可通过在Default.Route里面输入-P-和-M-来设置,但优先级低于输入文件中的%nproc和%mem。对于Windows版的Gaussian,是不是在Scrach文件夹中的Default.Rou文件中设置默认值(scrach.jpg)呢?此外,在计算机的属性中还有一项环境变量设置(win.jpg),这里的设置和Default.Rou中是-M是一个概念吗?
谢谢!


win.jpg (80.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

win.jpg

scrach.jpg (28.85 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

scrach.jpg

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-10 01:24:23 | 只看该作者 Only view this author
jimulation 发表于 2020-1-9 20:01
http://sobereva.com/439 帖子中讲到,对于Linux版Gaussian,默认的CPU核数和内存可通过在Default.Route里 ...

文中第2节已经写明了,仔细看
Windows下环境变量根本不需要设置。该设什么文中都已经明确提到了
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发表于 Post on 2020-1-10 10:16:40 | 只看该作者 Only view this author
请问一下,对于实验方向的工作,使用理论计算作为支撑,如果在supporting information里面提供柔性扫描结果,通常操作是提供每个结构的xyz的坐标,还是就画个能量扫描的图就可以了?

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发表于 Post on 2020-1-10 22:45:55 | 只看该作者 Only view this author
能不能实现两个F原子以X原子为轴旋转呢?想了好久没想出来,谢谢各位了

QQ截图20200110224332.jpg (7.11 KB, 下载次数 Times of downloads: 54)

QQ截图20200110224332.jpg

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发表于 Post on 2020-1-11 07:44:26 | 只看该作者 Only view this author
请问对于小分子团簇体系,用什么程序可以跑非PBC得dft-md呢

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发表于 Post on 2020-1-11 11:54:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-1-10 01:24
文中第2节已经写明了,仔细看
Windows下环境变量根本不需要设置。该设什么文中都已经明确提到了

看到了,谢谢Sob老师

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发表于 Post on 2020-1-11 14:29:46 | 只看该作者 Only view this author

计算出错,不知道怎么办

我计算的是纯硼体系,每次计算很容易出现这两个错误,向高手们求助一下

微信图片_20200111142913.png (12.74 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

微信图片_20200111142913.png

4.log

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-1-11 15:43:10 | 只看该作者 Only view this author
哆啦A梦 发表于 2020-1-11 14:29
我计算的是纯硼体系,每次计算很容易出现这两个错误,向高手们求助一下

去掉对当前计算毫无意义、只会添乱和暴增耗时的弥散函数,仔细看
谈谈弥散函数和“月份”基组
http://sobereva.com/119

不要写scf=tight这种多余关键词,仔细看
常见的多余的和被滥用的Gaussian关键词
http://sobereva.com/331http://bbs.keinsci.com/thread-3460-1-1.html

你这体系一看就没对称性,写symm=loose毫无意义

你上传的输出文件和你贴出来的报错完全不符
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