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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2020-6-27 16:25:44 | 只看该作者 Only view this author
土拔鼠 发表于 2020-6-27 15:22
谢谢社长

1. 如果我在G16下用out=wfn 是不是就不需要写Density了?

1. 必须写density
2. 报错通常是因为硬盘满了,总的临时文件大小没法限制,除非你有不止一块盘,可以分别写到不同的盘上。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-27 18:07:48 | 只看该作者 Only view this author
土拔鼠 发表于 2020-6-27 15:22
谢谢社长

1. 如果我在G16下用out=wfn 是不是就不需要写Density了?

是。对于G09 C.01版及之后out=wfn默认用了density关键词

maxdisk关键词可告诉Gaussian最多能利用多少硬盘,这样的话有时候Gaussian会改成恰当的算法使得计算得以进行,实在算不了的话Gaussian会提前报错。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-27 18:27:45 | 只看该作者 Only view this author
xxu若白 发表于 2020-6-27 15:40
sob老师您好!参照您的文章《谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算》,简单设计了一下我计算的 ...

1 没问题
2 不能。应当重新算。而且既然B2PLYPD3都能算得动,做个M05-2X计算基本花不了什么时间
3 是
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发表于 Post on 2020-6-27 22:30:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-6-27 01:01
1 部分问题这里有说明
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355(http://bbs.keinsci.co ...

感谢卢老师的解答,希望以后能参加您的培训

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发表于 Post on 2020-6-28 00:25:15 | 只看该作者 Only view this author
请问老师用win版的gview6.0.16打开log文件出现如下错误,但linux打开这个log文件正常,请问老师如何解决?谢谢!

1.jpg (34.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

1.jpg

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发表于 Post on 2020-6-28 16:24:48 | 只看该作者 Only view this author
请问sob老师,MP2和CCSD(T)/小基组估算CCSD(T)/大基组能量的方法中,把MP2换成MP3或者MP4(SDQ)能不能提高精度?这类估算方法随着原子数增多,绝对偏差是否接近线性增长?

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发表于 Post on 2020-6-28 20:47:29 | 只看该作者 Only view this author

利用优化后的S0结构进行T1优化,出现报错,想问一下出现这种问题的原因。

图一:优化T1所输入的命令
图二: 报错显示


请问老师,出现该情况,该如何处理?怎么顺利地进行T1的优化。

图二 报错.png (42.9 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

图二

图二

图一 所输入的关键词.png (45.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

图一

图一

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发表于 Post on 2020-6-28 22:30:28 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,我想判断一个团簇对各种气体分子,例如氢气,氮气,二氧化碳等等的活化作用,在选用研究方法上有两个问题:
1. 我能想到的有气体分子的键长,键序变化,电子转移,二者相互作用能大小,请问老师我还想讨论成键轨道和反键轨道进出电子情况,是用电荷分解分析吗?
2. 除了上述方法,还想用点其它方法,请问老师还有没有其它比较好的波函数分析方法可以讨论客体分子被团簇的活化情况?

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发表于 Post on 2020-6-28 22:33:13 | 只看该作者 Only view this author
询问报错应该给给.log或者.out文件的结尾部分

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-28 23:52:16 | 只看该作者 Only view this author
李文桃 发表于 2020-6-28 20:47
图一:优化T1所输入的命令
图二: 报错显示

要贴就贴输出文件里的报错提示,贴shell里的出错信息毫无意义
8成是几何优化不收敛,或者优化中途原子间排成直线
前者看
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164
后者在opt里加Cartesian关键词
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-29 00:53:24 | 只看该作者 Only view this author
ldatea 发表于 2020-6-28 16:24
请问sob老师,MP2和CCSD(T)/小基组估算CCSD(T)/大基组能量的方法中,把MP2换成MP3或者MP4(SDQ)能不能提高精 ...

MP3有时候比MP2还要差,所以没有考虑的价值
用MP4(SDQ)原理上比用MP2做这个强,但一方面此方法还是挺昂贵,另一方面用于当前目的比MP2改进非常有限,所以划不来,基本没人这么做。
随原子数增多误差并非简单线性增长,因为还有误差抵消问题。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-29 00:55:51 | 只看该作者 Only view this author
dali 发表于 2020-6-28 22:30
请问老师,我想判断一个团簇对各种气体分子,例如氢气,氮气,二氧化碳等等的活化作用,在选用研究方法上有 ...

1 从团簇与小分子的轨道相互作用角度讨论,可以用Multiwfn做CDA
2 看具体情况和机理。用福井函数、双描述符、静电势分析可能也都能有帮助
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-29 00:56:34 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2020-6-28 00:25
请问老师用win版的gview6.0.16打开log文件出现如下错误,但linux打开这个log文件正常,请问老师如何解决? ...

没你的文件不好说
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发表于 Post on 2020-6-29 09:28:56 | 只看该作者 Only view this author
老师,我算了个体与组成片段的密度差分图,发现下图中虚线的数量明显要多于实线的数量,请问为什么会出现这样的现象,还有从图上能看出两者之间的相互作用的程度吗

dislin.png (54.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 23)

dislin.png

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发表于 Post on 2020-6-29 09:38:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-6-29 00:53
MP3有时候比MP2还要差,所以没有考虑的价值
用MP4(SDQ)原理上比用MP2做这个强,但一方面此方法还是挺昂 ...

明白了,谢谢sob老师。

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