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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-1 20:29:11 | 只看该作者 Only view this author
ChemG 发表于 2020-7-1 12:49
新手求助;Gview需要安装linux版本么?还是说用Win版的导出输入文件转化后到Linux里面计算,之前用的都是Wi ...

如果你只有计算在linux上算,平时干别的都用windows,只需要用windows版gview就够了,毫无必要装linux版gview
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-7-1 21:13:24 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,您好!想请问下实验上用了THF/Toluene作为反应的溶剂,那再高斯中计算溶液单点的时候改如何设置溶剂呢?需要两个溶剂都写在命令行,还是选择一个溶剂进行计算?

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发表于 Post on 2020-7-1 21:42:08 | 只看该作者 Only view this author
陈丢丢 发表于 2020-7-1 21:13
sob老师,您好!想请问下实验上用了THF/Toluene作为反应的溶剂,那再高斯中计算溶液单点的时候改如何设置溶 ...

看这篇文章 http://sobereva.com/327 中的混合溶剂相关内容

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发表于 Post on 2020-7-2 09:27:11 | 只看该作者 Only view this author
thanhtam 发表于 2020-7-1 21:42
看这篇文章 http://sobereva.com/327 中的混合溶剂相关内容

好的,谢谢!

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发表于 Post on 2020-7-2 10:52:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-1 10:40
算单点不受影响
此问题只影响优化,opt加个cartesian就完了

谢谢老师 问题已解决

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发表于 Post on 2020-7-2 10:53:24 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-7-1 10:18
没看懂,你是想仅算一个二面角的数值,还是要对这个分子进行DFT计算?
前者的话,已经证明是平面了,无需 ...

谢谢老师

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发表于 Post on 2020-7-2 12:21:54 | 只看该作者 Only view this author
13163031955 发表于 2018-5-15 21:33
在笛卡尔坐标下,我指定y坐标,计算没有问题,但是就是指定x坐标的时候,会出错Unknown center X1,不知 ...

我遇到了同样的问题,不能把x坐标当成扫描变量,只能把y、z坐标当成扫描变量。请问您解决了么?

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发表于 Post on 2020-7-2 12:30:28 | 只看该作者 Only view this author
13163031955 发表于 2018-5-15 21:33
在笛卡尔坐标下,我指定y坐标,计算没有问题,但是就是指定x坐标的时候,会出错Unknown center X1,不知 ...

好了。我刚才用了Sob老师的方法,解决了。

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发表于 Post on 2020-7-2 16:31:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-6-27 00:55
不存在“HF需要的计算资源比DFT多”这种说法(除非是和利用RIJ的纯泛函比)

您的意思是没有在固定条件的情况下这两者是不能比较的,对吗?

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发表于 Post on 2020-7-2 19:44:49 | 只看该作者 Only view this author
请教一下老师,在激发态关键词TD下优化CH2OH自由基,结果总是L9999错误,打开文件发现H跑了。我也试过很多方法但是就是没对过。想知道这是什么原因,是设置的问题还是我的这个东西不能这样算呢?谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-3 02:15:10 | 只看该作者 Only view this author
jslo 发表于 2020-7-2 16:31
您的意思是没有在固定条件的情况下这两者是不能比较的,对吗?

说计算耗时、资源这种问题的时候,必须把前提条件说得尽量清楚,否则没有可比性
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-3 02:16:29 | 只看该作者 Only view this author
白雪少年 发表于 2020-7-2 19:44
请教一下老师,在激发态关键词TD下优化CH2OH自由基,结果总是L9999错误,打开文件发现H跑了。我也试过很多 ...

你先搜搜文献看这体系激发态应该是什么样的

TDDFT优化这个的激发态未必靠谱,也有可能本身被激发后就是会自发裂解。这个问题不是那么简单的

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发表于 Post on 2020-7-3 18:24:26 | 只看该作者 Only view this author
thanhtam 发表于 2020-7-1 13:05
不是必要的。gjf,log,fchk等文件是通用的。

当然,linux有图形界面的话,装个gview会方便一点,省得传 ...

好滴,了解啦,谢谢啦,主要是我现在没有linux版的Gview,所以只能考虑能不能用Win版的
我唯一知道的就是我一无所知,但我是化学小迷弟

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发表于 Post on 2020-7-4 09:28:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-1 20:29
如果你只有计算在linux上算,平时干别的都用windows,只需要用windows版gview就够了,毫无必要装linux版g ...

好滴,谢谢sob老师,那我就用Win版的Gview吧。
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发表于 Post on 2020-7-4 11:37:30 | 只看该作者 Only view this author

计算分子间氢键作用时水分子变形

这个体系研究水分子在Pt配位聚合物的配位情况,看了sob老师的帖子后我用了WB97XD去描述色散作用,发现水分子变形。这次使用了B3LYP泛函发现水分子还是变形,想求助是什么问题。非常感谢!

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