计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

   关闭 [复制链接 Copy URL]

357

帖子

0

威望

2071

eV
积分
2428

Level 5 (御坂)

真 掘墓者

11896#
发表于 Post on 2020-10-22 18:00:16 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-22 16:53
你原子坐标也没给,高斯版本也没给,我的机子跟你的也不一样,我怎么重复你的计算?
你既然已经算完了, ...

那你重新算个也不i是什么难事吧
圣诞刨坟忙

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125153

管理员

公社社长

11897#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-23 06:16:29 | 只看该作者 Only view this author
haos423 发表于 2020-10-22 15:44
感谢老师指点;还有一个问题:由于Gaussian不支持对三重态激发态用双杂化泛函做单点能的TD-DFT计算,那么 ...

对于T1态,完全可以这样用双杂化泛函算,而且很合适
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125153

管理员

公社社长

11898#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-23 06:23:15 | 只看该作者 Only view this author
赤赤媛 发表于 2020-10-22 11:49
各位大神,激发态构型优化好的log文件中,最后能量HF=  代表什么意思?一直以为他是S1态平衡构型的能量。

不要24小时内同时在公社QQ群和公社论坛里同一问题,注意看群文件里群规,以及论坛置顶的计算化学公社论坛新人必读。

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

50

帖子

0

威望

493

eV
积分
543

Level 4 (黑子)

11899#
发表于 Post on 2020-10-23 11:47:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-10-23 06:23
不要24小时内同时在公社QQ群和公社论坛里同一问题,注意看群文件里群规,以及论坛置顶的计算化学公社论坛 ...

对不起,sob老师,下次会注意

1万

帖子

0

威望

9886

eV
积分
22130

Level 6 (一方通行)

11900#
发表于 Post on 2020-10-23 18:20:37 | 只看该作者 Only view this author
kyuu 发表于 2020-10-22 18:00
那你重新算个也不i是什么难事吧

我重新算的,如果重复不出来你的错误,怎么办?比如我手里只有g16,你是g09算的,是g09有bug,这个bug在g16里解决了,那我算了也没用。
即使我也是l501报错,但是报的错和你不一样,我的经验也不能解决你的问题啊
况且,你连坐标都没给,万一是你坐标单位写错导致计算报错呢?那我打死也想不到,我只会用正确的坐标去算,然后完全看不出你报错的原因。
这个论坛不是客服论坛,大家没有义务帮你解决问题,让解答者方便对谁都好,尤其这还是解答者重复计算需要的精力比你贴个输出文件的精力要多,凭什么你的时间更值钱呢

评分 Rate

参与人数
Participants 2
eV +10 收起 理由
Reason
hebrewsnabla + 5
snljty + 5

查看全部评分 View all ratings

Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

49

帖子

0

威望

465

eV
积分
514

Level 4 (黑子)

11901#
发表于 Post on 2020-10-23 22:27:50 | 只看该作者 Only view this author

二聚体优化出现的问题

各位老师好,我做进在做一个二聚体的计算,无论是用wb97xd,还是m062x,在基态优化的时候总是会出现图中的报错,然而我去看实际的结构,报错提到的几个原子根本就不在同一个分子中,优化的输出文件在附件里,请问我该怎么解决这个问题呢?

1603463139(1).jpg (20.61 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

1603463139(1).jpg

22-w-opt.zip

948.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

优化结果文件

1187

帖子

5

威望

2876

eV
积分
4163

Level 6 (一方通行)

11902#
发表于 Post on 2020-10-23 22:32:47 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 snljty 于 2020-10-23 22:36 编辑

《Gaussian 常见报错及解决方法;新手求助报错时的注意事项》
http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html
在里面搜Tors failed----------------------------------------------------------------------------
顺便,看了一下输出文件,18核就给1GB内存还不到,不合适啊...

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125153

管理员

公社社长

11903#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-24 05:21:34 | 只看该作者 Only view this author
liyuanfu7 发表于 2020-10-23 22:27
各位老师好,我做进在做一个二聚体的计算,无论是用wb97xd,还是m062x,在基态优化的时候总是会出现图中的 ...

常见问题先搜公社论坛首页google框,没有答案再问
opt里写cartesian
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

156

帖子

0

威望

649

eV
积分
805

Level 4 (黑子)

11904#
发表于 Post on 2020-10-24 09:24:05 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,请问multiwfn打不开chk文件是怎么回事啊,我已经在settings.ini文件里把formchk的路径改成实际路径了,还是显示formchk conversion failed

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125153

管理员

公社社长

11905#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-24 09:54:01 | 只看该作者 Only view this author
Q-Chembio-llg 发表于 2020-10-24 09:24
sob老师,请问multiwfn打不开chk文件是怎么回事啊,我已经在settings.ini文件里把formchk的路径改成实际路 ...

你先弄清楚为什么formchk为什么转换不成功,而不是为什么Multiwfn打不开
如果你手动用formchk也转换不成功,仔细看此文中关于formchk相关说明
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

156

帖子

0

威望

649

eV
积分
805

Level 4 (黑子)

11906#
发表于 Post on 2020-10-24 09:57:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-10-24 09:54
你先弄清楚为什么formchk为什么转换不成功,而不是为什么Multiwfn打不开
如果你手动用formchk也转换不成 ...

感谢老师,我找到问题所在了,我的chk文件是Linux版高斯生成的所以用win版的高斯转换之后multiwfn没法读

49

帖子

0

威望

465

eV
积分
514

Level 4 (黑子)

11907#
发表于 Post on 2020-10-24 14:50:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-10-24 05:21
常见问题先搜公社论坛首页google框,没有答案再问
opt里写cartesian

老师,我在opt里面写了cartesian继续优化以后,最后报错出现link9999的情况,最后还是四个no,那应该怎么办呢?,

357

帖子

0

威望

2071

eV
积分
2428

Level 5 (御坂)

真 掘墓者

11908#
发表于 Post on 2020-10-24 20:48:04 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-23 18:20
我重新算的,如果重复不出来你的错误,怎么办?比如我手里只有g16,你是g09算的,是g09有bug,这个bug在g ...

真能强词夺理 无理取闹
圣诞刨坟忙

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125153

管理员

公社社长

11909#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-25 07:27:12 | 只看该作者 Only view this author
liyuanfu7 发表于 2020-10-24 14:50
老师,我在opt里面写了cartesian继续优化以后,最后报错出现link9999的情况,最后还是四个no,那应该怎么 ...

量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

173

帖子

0

威望

1036

eV
积分
1209

Level 4 (黑子)

11910#
发表于 Post on 2020-10-25 12:42:32 | 只看该作者 Only view this author
sob老师 我有个关于氧化还原势细节计算的问题想请教您一下,文字比较多,就创了个帖,http://bbs.keinsci.com/thread-20000-1-1.html,麻烦您了

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-24 00:34 , Processed in 0.194330 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list