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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2021-1-24 15:10:19 | 只看该作者 Only view this author

谢谢你,我现在解决了,我增加了最大循环步数的关键词就可以了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-1-24 15:29:51 | 只看该作者 Only view this author
逸风舞摆 发表于 2021-1-24 12:38
各位老师,  这几天优化了一个结构,一个纯有机分子,电荷数是3,自旋多重度是1,跑高斯没有问题。
  然后 ...

本论坛不可能有帖子说这是bug,这种提示明显是自己输入文件的问题
Gaussian自带的基组都直接支持什么元素这里都写了http://sobereva.com/g09/m_basis_sets.htm
Ag通常用12432楼提到的赝势基组算
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-1-24 17:52:22 | 只看该作者 Only view this author
我在计算过渡态时忘记加freq关键词,现在已经得到过渡态结构,请问怎么在现在的基础上将freq算一下呢?

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发表于 Post on 2021-1-25 11:26:59 | 只看该作者 Only view this author
AndrewX 发表于 2021-1-24 17:52
我在计算过渡态时忘记加freq关键词,现在已经得到过渡态结构,请问怎么在现在的基础上将freq算一下呢?

将这个过渡态结构取出来,再OPT+freq一下,或者就重新再来一次也没关系啊

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发表于 Post on 2021-1-25 15:06:12 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,我在算一个构型的时候有个CH4中C-H的虚频一直虚频消不掉,使用的是m06l泛函,6-31g*和lanl2dz基组优化(体系有点大,基组就没换)。尝试了您博文上的方法,也用了calcall,但还是消不掉虚频,还有什么办法可以去掉虚频吗?算过渡态时候虚频第二个虚频有30多,优化时候的虚频有60多。

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发表于 Post on 2021-1-25 15:40:35 | 只看该作者 Only view this author
王晓东 发表于 2021-1-25 11:26
将这个过渡态结构取出来,再OPT+freq一下,或者就重新再来一次也没关系啊

过渡态结构如果已经收敛了,加freq就行了,没必要再加opt
Zikuan Wang
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BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2021-1-25 15:41:11 | 只看该作者 Only view this author
329678001 发表于 2021-1-25 15:06
sob老师您好,我在算一个构型的时候有个CH4中C-H的虚频一直虚频消不掉,使用的是m06l泛函,6-31g*和lanl2dz ...

试过加大格点了吗
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-1-25 16:05:34 | 只看该作者 Only view this author
sob老师打扰了,有什么方法可以计算1,2,3环的环张力呀?

问题8.JPG (19.83 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

问题8.JPG

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发表于 Post on 2021-1-25 19:13:46 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2021-1-25 16:05
sob老师打扰了,有什么方法可以计算1,2,3环的环张力呀?

你准备怎么定义环张力呢?
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2021-1-25 20:38:00 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2021-1-25 19:13
你准备怎么定义环张力呢?

老师,我也不懂

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发表于 Post on 2021-1-25 22:17:38 | 只看该作者 Only view this author

首先要明确问题,然后我们才能解决问题。
环张力有若干种不同的定义,请先明确你期望计算得到哪种定义下的环张力。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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发表于 Post on 2021-1-26 10:13:25 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Jameslzy 于 2021-1-26 10:17 编辑

各位老师好,最近在计算opt+freq的任务时,出现了几次任务正常结束,但是没有正常进行频率分析的情况。将最后的结构单独拷贝出来做频率分析也不能正常进行,但是最后任务显示的是正常结束。输入文件的关键词为:#p M06/def2svp opt(ts,noeigentest) geom=modred freq em=GD3 int=ultrafine scrf(smd,solvent=n,n-DiMethylAcetamide)
输出文件的末尾如下图:




使用的输入文件和产生的输出文件我也放到附件中了,烦请各位老师帮忙判断一下是什么问题,如何解决,谢谢老师。
Ru-TS01-HCl.zip (1.02 MB, 下载次数 Times of downloads: 1)

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发表于 Post on 2021-1-26 11:07:14 | 只看该作者 Only view this author
Jameslzy 发表于 2021-1-26 10:13
各位老师好,最近在计算opt+freq的任务时,出现了几次任务正常结束,但是没有正常进行频率分析的情况。将最 ...

用G16试试,这是程序bug

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发表于 Post on 2021-1-26 11:08:49 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-1-25 22:17
首先要明确问题,然后我们才能解决问题。
环张力有若干种不同的定义,请先明确你期望计算得到哪种定义下 ...

老师能不能推荐几篇环张力定义的文献呀

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发表于 Post on 2021-1-26 11:14:52 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2021-1-26 11:07
用G16试试,这是程序bug

好的,谢谢老师回复,现在手头上没有G16,之后我想办法找个G16试一下

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