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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2021-3-7 14:22:09 | 只看该作者 Only view this author
请问ADF里面怎么查看<S0|SOC|T1>呀

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12692#
发表于 Post on 2021-3-7 17:43:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-7 05:45
TDDFT算的激发态没法算自旋密度
但是计算TDDFT激发态的自然轨道,然后靠Multiwfn绘制odd electron densi ...

感谢社长的解答;

看了MultiWFN手册相应的部分读到:” Now we calculate OED for a closed-shell system OC-BH3 at CCSD level (while at HF/DFT level, this quantity is obviously zero everywhere) “ 产生如下疑问:
1. 为何HF/DFT计算得到的OED处处为0?对闭壳层基态做OED分析是否只能采用CCSD这一类的计算?
2. 做一个基态是闭壳层的体系的TDDFT计算,root=i,out=wfn,导出单重激发态的波函数是否就能用来做OED分析?
3. 如果指定用Unrestricted TDDFT 计算基态是闭壳层的体系,得到的激发态波函数能否得到自旋密度?
4. 三重态体系是开壳层,那么如果只想分析T1态的自旋布居,用UKS先优化结构再做单点能计算是否就可以用来表征T1的自旋布居?

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发表于 Post on 2021-3-7 18:19:59 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-3-6 15:44
这是因为计算开了DIIS。在没有开收敛加速或者只开了damp、shift的情况下,SCF的能量是变分的,但是开了DI ...

谢谢老师的耐心回复

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12694#
发表于 Post on 2021-3-7 18:22:30 | 只看该作者 Only view this author
bxu764 发表于 2021-3-7 17:43
感谢社长的解答;

看了MultiWFN手册相应的部分读到:” Now we calculate OED for a closed-shell sys ...

1. 因为闭壳层体系的HF波函数,电子是严格成对的,要想描述电子和严格成对之间的偏离,必须用post-HF方法,最低是MP2
2. 理论上可以,multiwfn支不支持不知道
4. 可以
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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12695#
发表于 Post on 2021-3-7 22:15:56 | 只看该作者 Only view this author

求gaussian频率计算中得到自由能的单位是什么

求gaussian频率计算中得到自由能的单位是什么

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发表于 Post on 2021-3-7 22:26:42 | 只看该作者 Only view this author
卢老师好,我在使用multiwfn的基于分子力场的能量分解功能时,在定义分子片段的时候出现Error: Unable to find parameter for atom    1 with type ?的报错,请问是什么原因呢?谢谢。

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12697#
发表于 Post on 2021-3-7 22:28:14 | 只看该作者 Only view this author
Zero-point correction=                           0.199173 (Hartree/Particle)
Thermal correction to Energy=                    0.214385
Thermal correction to Enthalpy=                  0.215329
Thermal correction to Gibbs Free Energy=         0.154042
Sum of electronic and zero-point Energies=          -1232.255886
Sum of electronic and thermal Energies=             -1232.240674
Sum of electronic and thermal Enthalpies=           -1232.239730
Sum of electronic and thermal Free Energies=        -1232.301017

随便挑了个高斯输出文件,截了这一段,自己理解去,写得很清楚了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2021-3-7 22:36:16 | 只看该作者 Only view this author
补充一下,#2楼所示内容单位均为a.u.
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2021-3-7 22:48:47 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-3-7 22:28
Zero-point correction=                           0.199173 (Hartree/Particle)
Thermal correction t ...

好的,谢谢

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12700#
发表于 Post on 2021-3-7 22:49:11 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-3-7 22:36
补充一下,#2楼所示内容单位均为a.u.

好的,谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-8 00:12:08 | 只看该作者 Only view this author
Q-Chembio-llg 发表于 2021-3-7 22:26
卢老师好,我在使用multiwfn的基于分子力场的能量分解功能时,在定义分子片段的时候出现Error: Unable to f ...

如1L所示,Multiwfn的问题请发到相应答疑专贴里
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-8 00:12:46 | 只看该作者 Only view this author
836589673 发表于 2021-3-7 22:15
求gaussian频率计算中得到自由能的单位是什么

凡是Gaussian输出信息里没给单位的地方99.9%的可能性都是原子单位

Gaussian给出热力学量的时候Hartree/Particle这个单位是错的,应为Hartree
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-8 00:20:35 | 只看该作者 Only view this author
bxu764 发表于 2021-3-7 17:43
感谢社长的解答;

看了MultiWFN手册相应的部分读到:” Now we calculate OED for a closed-shell sys ...

1 HF/DFT的分子轨道占据数是整数,根据OED的公式就知道必然处处为0。只有基于非整数占据数的轨道(如后HF、TDDFT的自然轨道)做OED才有意义

2 是

3 不能

4 是。单点计算不是必需的,直接用opt任务产生的fch文件给Multiwfn算自旋布居用也可以,自旋布居对基组要求不高
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发表于 Post on 2021-3-8 10:44:29 | 只看该作者 Only view this author

DMol3模块能量计算和结构优化的默认温度是多少

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-8 10:55:15 | 只看该作者 Only view this author
18899533667 发表于 2021-3-8 10:44
DMol3模块能量计算和结构优化的默认温度是多少

无意义的问题
仔细看
谈谈温度、压力、同位素设定对量子化学计算结果产生的影响
http://sobereva.com/423http://bbs.keinsci.com/thread-10159-1-1.html
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