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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-11 09:54:46 | 只看该作者 Only view this author
算一算 发表于 2021-3-11 04:30
该怎么给一个体系中的不同离子指定电荷呢?在高斯里,我告诉它体系的总电荷是多少,高斯会自动分配电荷给体 ...

谈谈约束性DFT(CDFT)
http://sobereva.com/271http://bbs.keinsci.com/thread-535-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-11 09:55:20 | 只看该作者 Only view this author
bxu764 发表于 2021-3-11 06:39
感谢解答

我现在想要分析的是一个基态是闭壳层的分子, 它的激发态(可以是单重也可以是三重)的单电子特 ...

分析单电子分布没必要非得用自旋密度。前面说了还有Multiwfn可以算的odd electron density,论坛里我回复过多次
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-3-11 10:19:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-11 09:54
isotropic shielding constant

谢谢老师

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发表于 Post on 2021-3-11 11:06:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-11 09:55
分析单电子分布没必要非得用自旋密度。前面说了还有Multiwfn可以算的odd electron density,论坛里我回复 ...

感谢社长的回答!

我研究的具体问题是光激发导致的有机分子内氢迁移反应,这一类的反应可以用扫描激发态势能面来研究,但是若想说明为什么是某个氢迁移到另一个原子上,这类问题我本想用spin density或者OED来进行解释. 不知道是不是合理,若不合理,请问您觉得用什么方法来解释比较好呢?

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发表于 Post on 2021-3-11 14:06:02 | 只看该作者 Only view this author
计算120电子体系的反应路径,用6-311G**基组进行优化,频率和IRC计算是否足够?是否需要更大的基组进行优化或者算单点,如果是,选择什么基组比较合适。

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发表于 Post on 2021-3-11 16:01:00 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 算一算 于 2021-3-11 16:05 编辑
北大-陶豫 发表于 2021-3-11 08:15
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态 http://sobereva.com/82
6 谈谈“量子化学计算中如何设定原子/片段 ...

呃,看了半天,结果你给的这个链接并没有回答我的问题啊!

更新:刚才看到12735楼的回答,NWChem可以

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发表于 Post on 2021-3-11 16:03:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-11 09:54
谈谈约束性DFT(CDFT)
http://sobereva.com/271(http://bbs.keinsci.com/thread-535-1-1.html)

哦哦,看来NWChem可以,谢谢了

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发表于 Post on 2021-3-11 16:11:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-11 01:19
把热原子点到碳上,然后再替换

谢谢老师

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发表于 Post on 2021-3-11 17:00:57 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,想请教一下有没有网站可以查到某个元素在某个基组下有多少个基函数呀

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发表于 Post on 2021-3-11 17:02:04 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2021-3-11 17:00
sob老师您好,想请教一下有没有网站可以查到某个元素在某个基组下有多少个基函数呀

你直接让高斯算这个原子,然后在输出文件里搜 basis 就行……
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2021-3-11 17:24:07 | 只看该作者 Only view this author
bxu764 发表于 2021-3-11 06:39
感谢解答

我现在想要分析的是一个基态是闭壳层的分子, 它的激发态(可以是单重也可以是三重)的单电子特 ...

不是,你理解错了,闭壳层体系TDDFT的基态是严格配对的,但激发态不是。所以不影响分析激发态的单电子性质
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-3-11 17:25:13 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2021-3-11 17:02
你直接让高斯算这个原子,然后在输出文件里搜 basis 就行……

谢谢老师

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发表于 Post on 2021-3-11 17:26:18 | 只看该作者 Only view this author
bxu764 发表于 2021-3-11 11:06
感谢社长的回答!

我研究的具体问题是光激发导致的有机分子内氢迁移反应,这一类的反应可以用扫描激发态 ...

这个取决于氢迁移是迁移的氢原子还是质子。如果迁移的更接近氢原子,那可以这么做,但如果迁移的是质子,那应该用基态和激发态的原子电荷、静电势等解释
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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发表于 Post on 2021-3-11 19:27:01 | 只看该作者 Only view this author
请问下老师 您提出的IGMH方法 中文翻译成什么比较合适呢

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发表于 Post on 2021-3-11 21:56:01 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我想问一下在几何优化的时候(我用的是B3LYP/6-31G(d))优化结果打开的时候有键断裂了,这个会影响计算的HOMO和LUMO的结果吗?

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