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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2021-3-18 11:36:47 | 只看该作者 Only view this author
在水溶液下同样用qc方法 同样出错 错误如下
Search did not lower the energy significantly.
No lower point found -- run aborted.

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发表于 Post on 2021-3-18 11:44:33 | 只看该作者 Only view this author
【求助】在下要研究一个光照产生活性氧的问题,主要可以分解为三步机理(详见图片)。  1. 其中第一和第二步是sensitiszer经光照最终处于三重态,请问如果要定量的说明有多大的可能性,一个分子能达到三重激发态,需要做哪些计算呢?
  2. 其中第三步是三重态得分子和三重态氧气回归到各自的单重态的过程,请问要如何能定量描述这个过程?例如想计算这个过程的速率和发生的可能性,应该从何入手呢?

感谢!

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发表于 Post on 2021-3-18 11:46:46 | 只看该作者 Only view this author

不同电脑的Gaussian可能冲突么?

想找过一个电脑计算高斯大体系。结果发现那个电脑连附件这么小的都跑不了(gjf文件是我直接复制过来的),请问这是什么原因啊,我在我自己电脑上很随意就跑出来了,我已经把运算需求降得不能再降了?请问是软件在不同电脑不兼容么(都是09W)?这个Error都看不出来。。。求解答。。。

微信图片_20210318124123.png (51.95 KB, 下载次数 Times of downloads: 20)

微信图片_20210318124123.png

MHHPA.out

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MHHPA.gjf

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发表于 Post on 2021-3-18 11:49:11 | 只看该作者 Only view this author
甭用win的高斯跑大体系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-18 12:00:57 | 只看该作者 Only view this author
是aweia 发表于 2021-3-18 11:31
优化出错,加上qc以后出现以下错误:CPHF failed to converge in LinEq1使用的输入是:#P b3lyp/genecp opt ...

没事甭用QC,又慢又容易收敛到不稳定波函数,照样可能根本不收敛

仔细看此文
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

根本就不存在scf=gdiss
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-18 12:05:16 | 只看该作者 Only view this author
仔细看此文
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html

32bit的Gaussian根本不可能用10GB内存
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发表于 Post on 2021-3-18 12:19:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-18 12:00
没事甭用QC,又慢又容易收敛到不稳定波函数,照样可能根本不收敛

仔细看此文

抱歉 我错的离谱了 当时用的是opt=gdiis

另外 测试时发现如果对所有原子都用lanl2dz就会收敛,而如果只对Pb使用lanl2dz,其他原子用6-31+g*的话就会出现如上错误。请问社长,根据这个能大概判断问题出在哪里么,或者怎么解决。
我目前在尝试您帖子中的其他方法
体系里大概有24个C 50个H 8个O 2个S 1个Pb一共85个原子

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发表于 Post on 2021-3-18 12:20:40 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2021-3-18 11:49
甭用win的高斯跑大体系

您好 我用的确实不是win呀 是在linux下算的

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发表于 Post on 2021-3-18 16:29:08 | 只看该作者 Only view this author
看了一下社长写的有关于安装电脑的配置单,有一点不太理解,想问下如果只是需要计算有机领域的过渡金属催化,可以使用GPU吗?是不是只有软件支持GPU加速的,有相关代码的才可以使用呀?

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发表于 Post on 2021-3-18 17:01:16 | 只看该作者 Only view this author
sxh3231796 发表于 2021-3-18 16:29
看了一下社长写的有关于安装电脑的配置单,有一点不太理解,想问下如果只是需要计算有机领域的过渡金属催化 ...

对,要结合你用的软件来看
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2021-3-18 17:03:38 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-3-18 17:01
对,要结合你用的软件来看

如果现阶段主要使用Guassian和ORCA,想装配电脑的话,装gpu会更好一些吗?

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发表于 Post on 2021-3-18 17:13:27 | 只看该作者 Only view this author
bxu764 发表于 2021-3-18 11:44
【求助】在下要研究一个光照产生活性氧的问题,主要可以分解为三步机理(详见图片)。  1. 其中第一和第二 ...

只论图中的这3个反应的话,第一步用计算出来的摩尔吸光系数就行了,第二步可以用orca、dalton、BDF等软件计算ISC速率常数。第三步用BDF应该可以做,其他应该也有能做的软件,不过我就不太清楚了。
但是如果你关心的是三重态量子产率的话,那么还要考虑两个过程,就是单重态sensitizer的荧光和它向基态的内转换过程。如果这个分子发荧光是对称性允许的,那么荧光速率用随便哪个支持TDDFT的软件都能算,但是对称性禁阻或者接近禁阻的体系需要考虑Herzberg-Teller效应,那个不是所有软件都能做,推荐用orca。内转换速率目前相对通行的方法是用高斯+MOMAP做,将来orca也会支持,但现在还不支持。
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-3-18 17:18:45 | 只看该作者 Only view this author
sxh3231796 发表于 2021-3-18 17:03
如果现阶段主要使用Guassian和ORCA,想装配电脑的话,装gpu会更好一些吗?

基本不会,orca不支持GPU,高斯名义上支持GPU,但是有人测过(好像是sob老师测的?)发现提速不多,或者说同等价钱花在CPU上更值。
另外那是Gaussian不是Guassian,要是Gua的话根本读不出“高斯”的“高”的音
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-3-18 17:40:13 | 只看该作者 Only view this author

高斯输入文件

高斯问题求助:高斯view构建分子或者高斯输入文件怎样更改同一原子不同的氧化态的价态,特别是不常用的氧化态(比如Cu,Ag的+2价态,Au的+5价态之类的),使构建的分子成不带电的单重态?

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发表于 Post on 2021-3-18 18:47:50 | 只看该作者 Only view this author
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